New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 192641 | 125 (1.110) | 5 (0.050) | 5/586 | 15.5 | 4.2% | intergenic (+61/‑231) | pyrH/frr | uridylate kinase/ribosome recycling factor |
? | NC_000913 | = 192767 | 104 (0.940) | intergenic (+187/‑105) | pyrH/frr | uridylate kinase/ribosome recycling factor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AAAGCAACCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCAAATAAAATAGCCTAATAATCCAGACGATTACCCGTAATATGTTTAATCAGGGCTATACTTAGCACACTTCCACTGTGTGTGACTGTCTGGTCTGACTGAGACAAGTTTTCAAGGATTCGTAACGTGATTAGCGATATCAGAAAAGATGCTGAAGTACGCATGGACAAATGCGTAGAAGCGTTCAAAAC > NC_000913/192341‑192936 | aaGCAAACAAAGTTGACGGCGGGTTTACCGCCGATCCGGCGCAAGATCCAAACCCAACCATGTACGAGAAACCGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCCGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATTGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATAACGGAATAATTCCCGTGATGGAAAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGt < 1:404924/301‑1 (MQ=255) cAACCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGtt < 2:768443/299‑1 (MQ=255) cAACCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGtt < 2:199356/299‑1 (MQ=255) cAACCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGtt < 2:900314/299‑1 (MQ=255) aCCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTCATaa < 2:820061/301‑1 (MQ=255) ttGACGGCGTGTTTACCGCTAATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCGGGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa < 1:1086381/301‑1 (MQ=255) tGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTAt > 2:343433/1‑301 (MQ=255) ttccctacacgacgctcttccgatctCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTGTCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTgcag < 1:910963/276‑1 (MQ=255) ccGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGAGTCAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTgcaggcaggt > 2:660641/1‑299 (MQ=255) gCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTg > 2:23573/1‑301 (MQ=255) cTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTTACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTTACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATTAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTgg < 2:76207/301‑1 (MQ=255) cGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTTAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCTCGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATAGGAACAAACCGGGTGCGCTGCGACGTGTGGTAATGGGTGAGAAATAAGGTACTTTAACTACGGACTAATTCCCGTGATGGATCAATAATGGTAAGATTCCGCGGAAGTATAGCGGTGGCGTAATTCTGGTTATAATGCGTTATTGTTGCACTCAGTTTgcttctgg > 1:952368/1‑294 (MQ=255) gAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGATAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGGGATGGATAAATAAGGGGAAGATTCCGCGGAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTCTTGTTGCAGGCCGTTTGGTCACGGCCAg > 1:688061/1‑301 (MQ=255) aaGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAgcg > 2:87358/1‑301 (MQ=255) aaGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAgcg > 1:527376/1‑301 (MQ=255) gATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAgcgcg > 2:395778/1‑301 (MQ=255) aTCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGGGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGATGCAGGACGTTTGGTCCAGGCCAgggcgg > 1:178970/1‑300 (MQ=255) aTCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAgcgcg > 2:623615/1‑300 (MQ=255) ccAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTGTCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTgcagagatcggaagagcacacgtctgaa > 2:912070/1‑275 (MQ=255) cAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCgcag > 2:533738/1‑300 (MQ=255) cAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGGGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCgcag > 2:142461/1‑300 (MQ=255) cATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCg > 1:728734/1‑301 (MQ=255) cATGTACGAGAAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCg < 1:367738/301‑1 (MQ=255) ttACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTACTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTAc < 1:124784/300‑1 (MQ=255) cGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACaaa > 2:862341/1‑301 (MQ=255) 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gCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTAGAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGGAAGGTTGGCg > 1:406899/1‑301 (MQ=255) gCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGTTAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCTAGCACtt > 2:102436/1‑300 (MQ=255) tGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCCGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGGGGCTGGCGAGCACTGc > 1:275976/1‑300 (MQ=255) 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tCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCaa < 2:276300/300‑1 (MQ=255) tCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCaa < 2:527937/300‑1 (MQ=255) gACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCaaataaa < 2:729568/300‑1 (MQ=255) 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atAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTGGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGAGTGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGAAAATAAAATAGCCTAATAATCCAGACGATTACCCGTAATATGTTTAATCAGGGCTATACTTAGCACACTTCCACTGTGTGTGACTGTCTGGTCTGACTGAGACAAGTTTTCAAGGATTCGTAACGTGATTAGCGATATCAGAAAAGATGCTGAAGTACGCATGGACAAATGCGTAGAAGCGTTc < 1:903657/299‑1 (MQ=255) tAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCAAATAAAATAGCCTAATAATCCAGACGATTACCCGTAATATGTTTAATCAGGGCTATACTTAGCACACTTCCACTGTGTGTGACTGTCTGGTCTGACTGAGACAAGTTTTCAAGGATTCGTAACGTGATTAGCGATATCAGAAAAGATGCTGAAGTACGCATGGACAAATGCGTAGAAGCGTTCa < 1:80902/300‑1 (MQ=255) tCTGGTTATAAGGCGTTATTGTGGAAGGGAGGTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCAAATAAAATAGCCTAATAATCCAGACGATTACCCGTAATATGTTTAATCAGGGCTATACTTAGCACACTTCCACTGTGTGTGACTGTCTGGTCTGACTGAGACAAGTTTTCAAGGATTCGTAACGTGATTAGCGATATCAGAAAAGATGCTGAAGTACGCATGGACAAATGCGTAGAAGCGTTCAAAAc < 1:172904/300‑1 (MQ=255) | AAAGCAACCAAAGTTGACGGCGTGTTTACCGCTGATCCGGCGAAAGATCCAACCGCAACCATGTACGAGCAACTGACTTACAGCGAAGTGCTGGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGGCGAGCACTGCCCGGGGCCAAAATGGCAAATAAAATAGCCTAATAATCCAGACGATTACCCGTAATATGTTTAATCAGGGCTATACTTAGCACACTTCCACTGTGTGTGACTGTCTGGTCTGACTGAGACAAGTTTTCAAGGATTCGTAACGTGATTAGCGATATCAGAAAAGATGCTGAAGTACGCATGGACAAATGCGTAGAAGCGTTCAAAAC > NC_000913/192341‑192936 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |