| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2998987 = | 134 (1.190) | 5 (0.050) | 4/582 | 16.2 | 3.7% | noncoding (71/74 nt) | glyU | tRNA‑Gly |
| ? | NC_000913 | 2999059 = | 127 (1.150) | intergenic (‑2/+77) | glyU/ygeR | tRNA‑Gly/LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TAACTTTTATCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGCCCGCTTCGAGATGCGTAAGGCATTATAA‑ACCTTACGCTCTCCTTAGCAAGTGCCACGCTGCTGACTGCTGATTAATTCGCCATCAGCATTTTGGCTTGCTGCCCTGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAGGCGAACAGATGCCGCATCCGTGCTCCCCATAGTGGCGATTTTTTGCCCAGCCTTCACGCTTTGCCCAT > NC_000913/2998689‑2999287 | taaCTTTTATCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAgg > 2:1008378/1‑300 (MQ=255) ttttATCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGc < 2:774434/301‑1 (MQ=255) tttATCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTTGAGCGGGCg > 1:214129/1‑301 (MQ=255) ttCTGTTGCTGCCCACGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAg < 2:991455/300‑1 (MQ=255) aTCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGTATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGACAGGGCGAAg > 1:891366/1‑301 (MQ=255) ttGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGGTTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGGTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAggg < 1:598353/300‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAggg > 2:200513/1‑301 (MQ=255) cTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAggg > 1:286707/1‑301 (MQ=255) cccccGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAAcc < 2:287031/301‑1 (MQ=255) cccccGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAAcc < 1:1007146/301‑1 (MQ=255) 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atatACCAGCAAGAATAAGAGTTAATGCAGATTTCCATTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAACTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGCCCGCTTCGAGATGCGTAAGGCATTATAA‑ACCtt < 1:869788/301‑1 (MQ=255) ataCCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGCCCGCTTCGAGCTGCGTAAGGCATTATAA‑ACCTTa > 1:253488/1‑300 (MQ=255) tctaGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGCCCGCTTCGAGATGCGTAAGGCATTATAA‑ACCTTACGc < 2:185760/298‑1 (MQ=255) 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TAACTTTTATCTGTTGCTGCCCCCGTGGAATTAAGAATGTTAAATACAGATTCACTCGTCACTTCTGCCCCTGTCGCCTGGCATGTGCCGCACGAAAATATACCAGCGAGCAGAAGAGTTAATGCAGATTTCCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGCCCGCTTCGAGATGCGTAAGGCATTATAA‑ACCTTACGCTCTCCTTAGCAAGTGCCACGCTGCTGACTGCTGATTAATTCGCCATCAGCATTTTGGCTTGCTGCCCTGAGGCGGCAAGTAACGTAGCGGATCAATTGCCGTTGCACGGTAACGAATCTGGAAATGCAGGCGAACAGATGCCGCATCCGTGCTCCCCATAGTGGCGATTTTTTGCCCAGCCTTCACGCTTTGCCCAT > NC_000913/2998689‑2999287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |