Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,410,045 | 0 | T | . | 99.2% | 585.2 / ‑3.1 | 131 | intergenic (+39/‑88) | rlmB/yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base . (65/64); total (66/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGATGAATTTAATA > NC_000913/4409746‑4410340 | cgcgcACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttt > 1:987877/1‑301 (MQ=255) cgcgcACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCACATTTTGATGGttt > 2:10973/1‑301 (MQ=255) acacgacgctcttccgatctaaGGGAATATCTGGGTCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACAATCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttca < 2:631055/281‑3 (MQ=255) tgggTATGGTGCAGGAAGAGAATATCGGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACAATCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 2:626292/297‑4 (MQ=255) 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cAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGCCGCCTGGCGCTGGTGCTGGGTGAGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTAACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGCTCAGCCTCCCGATAGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGCTCGGAATTAGCTTATCTGAGACGGTGCTCAAGCGCAGCTTATTTCTCAGACTTATGAAAAGCCGTCCCGCTGTGGA‑CGTTTTTTTTTGTCTCTAGCTTGTATGATACTTACGTATTTCAAATATTCAtttttt > 2:90143/1‑299 (MQ=255) cAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTTAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTTAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCCCAGAATTATGAACAGCCATCACGATTTCGATGG‑TTTTTTTTGTCTTGTGCTGGTTAGATAGTTACGTATTGTCAATATTCATTttat > 2:700039/1‑301 (MQ=255) aTCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAAc < 1:1120505/301‑1 (MQ=255) 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ggATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGATGAATTTAATa > 1:1185415/1‑301 (MQ=255) gATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGATGAATTTAATa > 1:400792/1‑300 (MQ=255) gATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGGGAGTAGTATAAGCAATCCAGATGAATTTAATa > 1:609449/1‑300 (MQ=255) | GCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGATGAATTTAATA > NC_000913/4409746‑4410340 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |