| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,239,245 | (G)5→6 | coding (1612/2097 nt) | yjbH → | DUF940 family extracellular polysaccharide protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,239,240 | 1 | . | G | 94.7% | 455.0 / 12.5 | 134 | coding (1607/2097 nt) | yjbH | DUF940 family extracellular polysaccharide protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/1); new base G (67/59); total (73/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CCCGGAAAACTTTTACATGTATCAGCTGGGCGTGATGGGAACGGCAGATTTGTGGCTGACGGACCATCTGCTGACCACCGGCAGCCTGTTTGCAAATCTTGCCAACAACTACGACAAGTTTAACTACACTAATCCTCCGCAGGACTCGCACTTACCGCGCGTGCGTACCCATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAA‑ACCATGTTTGGCGGTGC‑G‑G‑G‑GG‑CAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAACTACGTTAAACAGCGCGACTGGCGTAGTGCAAAAGATATGATGAAATTCACCGACTACAGCGTGAAAACCGGACATCTGACCGCCTACTGGACGCCATCTTTCGCTCAGGATGTGTTAGTTAAAGCCAGCGTCGGGCAGTATCTGGCAGGGGATAAAGGCGGCACGCTGGAGATCGCCAAACGCTTTGATAGCGGCGTGGTGGT‑GGGTGGCTATGCCACGATCACTAATGTTTCG > NC_000913/4238944‑4239535 | cGGAAAACTTTTACATGTATCAGCTGGGCGGGATGGGAACGGCAGATTTGTGGCTGACGGACCATCTGCTGACCACCGGCAGCCTGTTTGCAAATCTTGCCAACAACTACGACAAGTTTAACTACACTAATCCTCCGCAGGACTCGCACTTACCGCGCGTGCGTACCCATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAA‑ACCATGTTTGGCGGTGC‑g‑g‑g‑ggg < 2:527523/301‑2 (MQ=255) 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CCCGGAAAACTTTTACATGTATCAGCTGGGCGTGATGGGAACGGCAGATTTGTGGCTGACGGACCATCTGCTGACCACCGGCAGCCTGTTTGCAAATCTTGCCAACAACTACGACAAGTTTAACTACACTAATCCTCCGCAGGACTCGCACTTACCGCGCGTGCGTACCCATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAA‑ACCATGTTTGGCGGTGC‑G‑G‑G‑GG‑CAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAACTACGTTAAACAGCGCGACTGGCGTAGTGCAAAAGATATGATGAAATTCACCGACTACAGCGTGAAAACCGGACATCTGACCGCCTACTGGACGCCATCTTTCGCTCAGGATGTGTTAGTTAAAGCCAGCGTCGGGCAGTATCTGGCAGGGGATAAAGGCGGCACGCTGGAGATCGCCAAACGCTTTGATAGCGGCGTGGTGGT‑GGGTGGCTATGCCACGATCACTAATGTTTCG > NC_000913/4238944‑4239535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |