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cGGGGAGTACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGCACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCTCCGCGAAATGCGTGCTGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTCCGTCCCCGGGGGGGTGTCATTACGTGAAGTCACTGCCTGGGCTCAGCTCCATGCCGTAGCAACATTATCTGCCGTTGCtctc > 2:345255/1‑299 (MQ=11) cGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTTGCtctc > 1:1160816/1‑299 (MQ=17) cGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCtctc > 1:1124493/1‑299 (MQ=32) ggggAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGCTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCTAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCCTGGGCTCAGCTCCACGACGTTGCAACATTCTCTGCCGTGGCTCTCCt > 2:458663/1‑300 (MQ=12) aGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAg < 1:63153/300‑1 (MQ=31) caTCCCATAAACGCTAAATTAAGGTTTGTGGACTTACGCATGATATGATTTAACG‑GCCCACGTAATGAATCTCCCGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAGCTTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAAGGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAGCGGc < 2:826205/300‑1 (MQ=11) | GTTTCAGGTTTACTCTGAGGTCTGGAAAGATGAAGCCCCAGGAGATATTTCTATCAACCCTGGGGCTGCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG‑AATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAGCGGC > NC_000913/607708‑608305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |