| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 539423 | 119 (0.880) | 4 (0.030) | 4/586 | 20.3 | 3.6% | coding (277/1362 nt) | allB | allantoinase |
| ? | NC_000913 | = 539503 | 100 (0.760) | coding (357/1362 nt) | allB | allantoinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GTTGTAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGACCGTCTGCATGAGCTGGATGAAGTGGGCGTTGTCGGCTTCAAATGCTTCGTTGCGACCTGTGGCGATCGCGGTATCGACAACGACTTCCGTGATGTAAACGACTGGCAGTTCTTCAAAGGTGCGCAGAAGCTGGGCGAACTGGGTCAGCCGGTGCTGGTGCACTGCGAAAACGCGCTGATTTGTGACGAACTGGGCGAAGAAGCGAAGCGTGAAGGTCGCGTAACCGCTCATGACTATGTGGCTTCGCGTCCGGTATT > NC_000913/539204‑539799 | gTTGTAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGAt < 2:833670/300‑1 (MQ=255) tGTAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTTTCGTTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCg < 2:950639/301‑1 (MQ=255) tAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAGGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGc < 1:945008/301‑1 (MQ=255) tAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCgg < 1:26391/300‑1 (MQ=255) tatCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACaa > 1:381305/1‑301 (MQ=255) tatCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACaa > 1:728349/1‑301 (MQ=255) tatCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACaa > 1:643458/1‑301 (MQ=255) 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atttgtgctAGCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCAAATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTaca < 2:419343/296‑1 (MQ=255) tgctgcTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGAGGCGTCTGGGCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTacaac < 2:524613/301‑1 (MQ=255) gctATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTCAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCttgaaaactc > 2:315466/1‑292 (MQ=255) 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aaaGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACACCATCGACCGTCTGCATGAGCTGGATGAAGTGGGCGTTGTCGGCTTCAAATGCTTCGTTGCGACCTGTGGCGATCGCGGTATCGACAACGACTTCCGTGATGTAAACGACTGGCAGTTCTTCAAAGGTGCGCAGAAGCTGGGCGAACTGGGTCAGCCGGTGCTGGTGCACTGCGAAAACGCGCTGATTTGTGACGAACTGGGCGAAGAAGCGAAGCGTGAAGGTCGCGTAACCGCTCATGACTATGTGGCTTcg < 2:73490/300‑1 (MQ=255) gACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGACCGTCTGCATGAGCTGGATGAAGTGGGCGTTGTCGGCTTCAAATGCTTCGTTGCGACCTGTGGCGATCGCGGTATCGACAACGACTTCCGTGATGTAAACGACTGGCAGTTCTTCAAAGGTGCGCAGAAGCTGGGCGAACTGGGTCAGCCGGTGCTGGTGCACTGCGAAAACGCGCTGATTTGTGACGAACTGGGCGAAGAAGCGAAGCGTGAAGGTCGCGTAACCGCTCATGACTATGTGGCTTCGCGTCCg > 1:893818/1‑301 (MQ=255) ttGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGACCGTCTGCATGAGCTGGATGAAGTGGGCGTTGTCGGCTTCAAATGCTTCGTTGCGACCTGTGGCGATCGCGGTATCGACAACGACTTCCGTGATGTAAACGACTGGCAGTTCTTCAAAGGTGCGCAGAAGCTGGGCGAACTGGGTCAGCCGGTGCTGGTGCACTGCGAAAACGCGCTGATTTGTGACGAACTGGGCGAAGAAGCGAAGCGTGAAGGTCGCGTAACCGCTCATGCCTATGTGGCTTCGCGTCCGGTAtt > 1:1081999/1‑301 (MQ=255) | GTTGTAGATATCGCCGTTAAAGGCGGAAAAATTGCTGCTATCGGTCAGGATCTGGGCGATGCAAAAGAAGTTATGGATGCGTCTGGTCTGGTGGTTTCGCCGGGCATGGTTGATGCGCACACCCATATTTCTGAACCGGGTCGTAGCCACTGGGAAGGTTATGAAACCGGTACTCGCGCAGCGGCAAAAGGTGGTATCACCACCATGATCGAAATGCCGCTCAACCAGCTGCCTGCAACGGTTGACCGCGCTTCAATTGAACTGAAGTTCGATGCCGCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGACCGTCTGCATGAGCTGGATGAAGTGGGCGTTGTCGGCTTCAAATGCTTCGTTGCGACCTGTGGCGATCGCGGTATCGACAACGACTTCCGTGATGTAAACGACTGGCAGTTCTTCAAAGGTGCGCAGAAGCTGGGCGAACTGGGTCAGCCGGTGCTGGTGCACTGCGAAAACGCGCTGATTTGTGACGAACTGGGCGAAGAAGCGAAGCGTGAAGGTCGCGTAACCGCTCATGACTATGTGGCTTCGCGTCCGGTATT > NC_000913/539204‑539799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |