Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 527,072 | 1 | . | G | 95.0% | 415.3 / 11.1 | 120 | coding (3812/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base G (56/58); total (60/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑G‑G‑GGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATACTCACGGTGCAGATAGTCATGGCGATTATGTTGATG > NC_000913/526776‑527365 | gaaaTAAGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCCTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑g‑g‑g‑gg < 1:518464/298‑1 (MQ=255) 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gATCTGGAGCATGTACGG‑G‑G‑GGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATACTCACGGTGCAGATAGTCATGGCGAtt > 2:1127545/1‑301 (MQ=255) aTCTGGAGCATGTACGG‑G‑G‑GGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATACTCACGGTGCAGATAGTCATGGCGAt < 2:342638/299‑1 (MQ=255) ggAGCATGTACGG‑G‑G‑GGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGAAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATACTCACGGTGCAGATAGTAATGGCGATTATGtt > 1:799685/1‑301 (MQ=255) 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CGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑G‑G‑GGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATACTCACGGTGCAGATAGTCATGGCGATTATGTTGATG > NC_000913/526776‑527365 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |