| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 387,569 | T→C | L200P (CTC→CCC) | tauC → | taurine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 387,569 | 0 | T | C | 98.5% | 450.4 / ‑4.4 | 133 | L200P (CTC→CCC) | tauC | taurine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (70/60); total (73/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GGGATCGCGATGGGACTTAGCCCTACGGTACGCGGCATTCTGGATCCGATAATCGAGCTTTATCGTCCGGTGCCGCCGCTGGCTTATTTGCCGCTGATGGTGATCTGGTTTGGTATTGGTGAAACCTCGAAGATCTTACTGATC‑TATTTAGCGATTTTTGCACCGGTGGCGATGTCGGCGCTGGCGGGGGTGAAAAGCGTGCAGCAGGTTCGCATTCGTGCCGCCCAGTCGCTGGGTGCCAGCCGTGCGCAGGTGCTGTGGTTTGTCATTTTGCCCGGTGCGCTGCCGGAAATCCTCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGG‑TGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACGTCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACG > NC_000913/387274‑387866 | gggATCGCGATGGGACTTAGCCCTACGGTACGCGGCATTCTGGATCCGATAATCGAGCTTTATCGTCCGGTGCCGCCGCTGGCTTGTTTGCCGCTGATGGTGATTTGGTTTGGTATTGGTTAAACTTCTAAGTTCTTACTGATC‑TATTTAGCGATTTTTGAACCGGTGGCGTTGTCGGCGTTGGCGGGGGTGAAAAGCGTGCAGCAGGTTCGCTGTCGTGCCGCCCAGTCGTAGGGTGACAGCTGCGCGCAGGTTCTGTGACTGTGCATCTTGCTCGGTGCGCGGCCGGCAATCCTCAACg > 1:940965/1‑301 (MQ=255) 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cccGGTGCGCTGCCGGAAATCCCCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGG‑TGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACGTCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCCCAAAt > 2:505731/1‑301 (MQ=255) cGGAAATCCCCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGG‑TGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACGTCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGAc < 2:863939/301‑1 (MQ=255) cGGAAATCCCCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGG‑TGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACGTCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGAc < 2:924919/301‑1 (MQ=255) 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GGGATCGCGATGGGACTTAGCCCTACGGTACGCGGCATTCTGGATCCGATAATCGAGCTTTATCGTCCGGTGCCGCCGCTGGCTTATTTGCCGCTGATGGTGATCTGGTTTGGTATTGGTGAAACCTCGAAGATCTTACTGATC‑TATTTAGCGATTTTTGCACCGGTGGCGATGTCGGCGCTGGCGGGGGTGAAAAGCGTGCAGCAGGTTCGCATTCGTGCCGCCCAGTCGCTGGGTGCCAGCCGTGCGCAGGTGCTGTGGTTTGTCATTTTGCCCGGTGCGCTGCCGGAAATCCTCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGG‑TGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACGTCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACG > NC_000913/387274‑387866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |