| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,853,127 | Δ1 bp | intergenic (‑139/‑426) | ivbL ← / → tisB | ilvB operon leader peptide/toxic membrane persister formation peptide, LexA‑regulated |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,853,124 | 0 | C | . | 98.8% | 715.2 / ‑1.8 | 160 | intergenic (‑136/‑429) | ivbL/tisB | ilvB operon leader peptide/toxic membrane persister formation peptide, LexA‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (82/76); minor base A (2/0); total (84/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |