| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,239,245 | (G)5→6 | coding (1612/2097 nt) | yjbH → | DUF940 family extracellular polysaccharide protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,239,240 | 1 | . | G | 96.0% | 618.9 / 10.6 | 177 | coding (1607/2097 nt) | yjbH | DUF940 family extracellular polysaccharide protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base G (85/83); total (88/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GGCCCGGAAAACTTTTACATGTATCAGCTGGGCGTGATGGGAACGGCAGATTTGTGGCTGACGGACCATCTGCTGACCACCGGCAGCCTGTTTGCAAATCTTGCCAACAACTACGACAAGTTTAACTACACTAATCCTCCGCAGGACTCGCACTTACCGCGCGTGCGTACCCATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGT‑TTGGCGGT‑GC‑G‑GG‑GGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA‑GCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAACTACGTTAAACAGCGCGACTGGCGTAGTGCAAAAGATATGATGAAATTCACCGACTACAGCGTGAAAACCGGACATCTGACCGCCTACTGGACGCCATCTTTCGCTCAGGATGTGTTAGTTAAAGCCAGCGTCGGGCAGTATCTGGCAGGGGATAAAGGCGGCACGCTGGAGATCGCCAAACGCTTTGATAGCGGCGTGGTGGTGGGTGGCTATGCCACGATCACTAATGTTTCG > NC_000913/4238942‑4239535 | cccGGAAAACTTTTACATGTATCAGCTGGGCGTGATGGGAACGGCAGATTTGTGGCTGACGGACCATCTGCTGACCACCGGCAGCCTGTTTGCAAATCTTGCCAACAACTACGACAAGTTTAACTACACTAATCCTCCGCAGGACTCGCACTTACCGCGCGTGCGTACCCATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGT‑TTGGCGGT‑GC‑g‑gg‑g > 2:539256/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |