Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 34,111 | 1 | .→T | 2.6% | 10.5 ‑0.5 ‑0.2 | 154 | intergenic (+73/‑189) | carB/caiF | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit/cai operon transcriptional activator |
Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Rejected: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/1): ref base (79/71): total (82/72) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.23e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.83e-01 |
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CCGCACATTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAATATGGCCTTGTTTAATTGCTTCAAAACGAGTCATAGCCAGACTTTTAATTTGTGAAACTGGAGTTCGTATGTGTGAAGGATATGTTGAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGCAAGAGAGATCTCTATTCATTTCGATAT > NC_000913/33811‑34406 | ccGCACATTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCCCAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCg > 2:927817/1‑301 (MQ=255) caTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCCAATAATAGCGGGTCATGGAAGATATTTTTCATCGGCTAATTTGCTCGACTAACTAATCAGGTTCTCTGCTGAGGACCG‑ttttt > 1:80732/1‑301 (MQ=255) aTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGCCTCCCGCGGG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAACATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACCGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGCATGCCGATCCGACTTAAAAAGTACTTTCGGTGCAGGACATTCCAGCACAGTTCAAATAAGAGCATGTCCTGGGCGATATTTTTCATGCGATATTTTTGTCCAATACCACATACGGTTCACTGACTGGTACGG‑tttttt > 1:411074/1‑301 (MQ=255) aTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGTCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATACTAGCCTGTCATGGCAGATATTTTTCATTCTCTAATTTGATCGAAGACCTAATTCGGTTTTTTGCTGAGGACAG‑tttttt > 1:453220/1‑301 (MQ=255) aTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGCCTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGCAATGCACGCACCGACCCACTCATAGCGTGTCATGGCAGCTATTTTTACTCCGCTACTTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTTCTTAGGCCCG‑tttttt > 1:545020/1‑301 (MQ=255) aTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTCCAGGACATGCACGCACAGAACAAATAATAGCGTGTCATGGCAGTTATTTTTCATCCGCTAATTTCATCGAATAACTAATCCGGTTCCCTGATGAGGACCG‑tttttt > 2:330246/1‑301 (MQ=255) aTTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCGCAGGCCGTCGTGAGCTTGAAGACTCCCGCGTG‑CTTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTCAGACCCCACCCGGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGAATGAAAAAGTCATTTCGGTGCAGGACAGGCACGCCACGATCAAATAATAGCGTGTACTTGCAGAGTTTTTTCATACGGTAATTTGATAGAATAACTAATCCAGTACTCTTATAAGTACCT‑tttttt > 1:127625/1‑301 (MQ=255) aGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAAGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGGGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGACCCAATAATAGCGTGTCATGGCAGATCTTTTTCATCCGCTAATTTAGTCGATTCACTAATACGGTTCTCTGTTGAGGACCG‑TTGTTTTTTGCCCTTTAATTaa > 1:117430/1‑301 (MQ=255) aaTATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGACGATGCGACTGAAAAAGTCATTTCCGTGCAGGCAATGCACGCAACGATCAAATAATAGAGTGTCATGGCAGATATTTTTCAACCGCTAATTTGATCGAATAACTAATAGGGTTCTTTGCAGAGGGCCG‑ATTTTTTTTTCCCATTTATGAAATCATTTgg > 1:127206/1‑301 (MQ=255) ccTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCCAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATCACTAATCCGGTTCTCTGATGATGACCG‑TTTTTTTTTGCCCCTTAAGTAACTCTTTTGGGGatt > 2:572097/1‑298 (MQ=255) catcatAAACCCCCCCGCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGata < 2:799429/301‑1 (MQ=255) catcaACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCCCGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATTGCAGATATGTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACGG‑TTTTTTTTTTCCCAGTAATTAACTCTTTTGGGGAATCGATAttt > 1:291732/1‑301 (MQ=255) catcaACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTCATTTGATCGAATCACTACTACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATAttt > 2:307243/1‑301 (MQ=255) accTCAGGCTGTCGTGCGATTGAAGCCTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAACTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGACTGCCGATGCGACTGAAAAAGAAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGCACCAATAATAGCGTCTCATGTCAGCTATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGCATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGCCCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATTTTTTGGGGAACCGATATTTTTGCTTACAt > 2:727178/1‑301 (MQ=255) cctggCGATTGACGACGCCCG‑GTGTATTCGCCGAATGTCCCTGCAAGATCAGATGCATTACGACACCAACCGGAACGGCGTCGTTGCCACCGCGATGGCGATGAATGCAGATTCGCTTGAAAAAGTAAGTTCGGTGCAGGAAATGTACGCAAAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGGTATCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTTGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGAttt < 2:775409/297‑1 (MQ=255) aTTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTATGTAAATCTTTTGGGGATTCGATTTTTTTGTTGACATAAGCAGGATTTatttaca > 1:260059/1‑295 (MQ=255) aTTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTACGTAAATCTTTTGGGGAATCGATCTTTTTGATGACTTAAACACGATTTAGCTca > 1:454907/1‑300 (MQ=255) aTTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTAAACGGCGACTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAACTGCACGCACAGGTCAAATACTCGCTTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTACTAAGGTTCTCTTTTGAGGACCGTTTTTTTTTTGCCCATTCAGTAAACCTTTTTGTGCATCGGTTTTTTtgatggacttatcatgatttctttc > 1:350023/1‑280 (MQ=255) ttGAAGACTCCCGCGTG‑ACGCGGCGCAGTGCGCTGAAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTcaca < 1:927787/301‑1 (MQ=255) cccGCGTG‑ATACGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCGCCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCGTAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTACAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTGTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGAc < 2:211205/301‑1 (MQ=255) tggtggcaggggggggCAAGATAAAGTGCATGACGACACCACCCGGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATGTCGGTGCAGGAAATGCACGAACAGAGCAAATAAGAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTg < 1:889113/286‑1 (MQ=255) ggcgCAGTGCGCTGAAAAAGAAAGGGCATTAAGACACCACCCTGAAAGGCGGATGTGCCACCGAGAGGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGc < 1:608963/298‑1 (MQ=255) tggCAGTGCGGTTGAAAAGAAAGGGCATTACGAAACCACCCTGAACGGCGGCTGTGCCACCGCGATGTCGCTGAATGCGGATGCGACTGAAAAAGGAATTTCGGGGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGTTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTGTGCCCATTAAGTAAATCTTGTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATACGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCAt < 1:631899/299‑1 (MQ=255) tcgCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCa < 2:40652/300‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCTGCAATATAAATTGCATTACGCCACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCTTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATAc < 2:127630/300‑1 (MQ=255) cTGCAATAAAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTGGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGata < 2:852741/301‑1 (MQ=255) cTGAAATATAAAGTGCACTAAGACACCACCCTGCACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGATGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGAACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCAGGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGata < 1:307233/301‑1 (MQ=255) atGCAAAAGAAAGTGCATTACGACACCACCTGGAACGGCGGCGTGGCCACCGCGATGGCGCTGAAGGCGGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTGTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGata < 1:936423/300‑1 (MQ=255) gaaaTAAAAAGTGCATTAAGACACCACCCGGAACGGCGGCTTGGCCACCGAGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGAACAGATCAAAGAATAGCGTGGCATGGCAGAGATTGTTCATCCGCTAATTTGATAGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGTACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATAc < 1:763118/289‑1 (MQ=255) cAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGGTGACATAAGCAGGATTTAGCTAACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACGATCGctatat > 2:223205/1‑301 (MQ=255) ataAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATGTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTTTTGACTTAATCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTGTCATACTATCGATATATCca > 2:272771/1‑300 (MQ=255) 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cATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGCACAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTCATTTGATCGACTAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATATTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTCTCTCACACTTATCGACGGTTAAGTTGCATACTTTCTATTTATTTACAATTTGaa > 1:94668/1‑301 (MQ=255) tACGACACCACCCTGAACGGCGGCGTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAAGTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAatat < 2:730650/301‑1 (MQ=255) acacCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTCATTTAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTAAAACTTATGGACGATGCAGTTACATACTATAGCTATATCCACAATTTTAATATgga > 1:729500/1‑299 (MQ=255) accCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGACATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTTAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGCTTACCTTAGCAGGTTTTACCTCCCAATTCTCGACGGGAACGTTGCCAACTACCGATATATACACCATTTTTATCTGGCCTTGtt > 1:95278/1‑301 (MQ=255) accCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTTCCCCTTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTTGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTTCATACTATCGATATATACAAAATTTTTATATGGCCTTGtt > 2:191050/1‑301 (MQ=255) accCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAATATTGCCTTGtt > 1:535898/1‑301 (MQ=255) 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ctctGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTCTCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAATATGGCCTTGTTTAATTGCTTCAAAACGAGTCATAGCCAGACTTTTAATTTGTGAAACTGGAGTTCGTCTGTGTGGAGGCTATGTTGAAAAACAACTCTACTTTTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAGATCGGTGGGTGATACCACGAGAGATCTCTGTTc > 1:322602/1‑300 (MQ=255) ctGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGCAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAATATGGCCTTGTTTAATTGCTTCAAAACGAGTCATAGCCAGACTTTTAATTTGTGAAACTGGAGTTCGTATGTGTGAAGGATATGTTGAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGCATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGCa > 2:2844/1‑282 (MQ=255) | CCGCACATTCAGGACCGTATCAAGAATGGCGAATATACCTACATCATCAACACCACCTCAGGCCGTCGTGCGATTGAAGACTCCCGCGTG‑ATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACCCTGAACGGCGGCTTTGCCACCGCGATGGCGCTGAATGCCGATGCGACTGAAAAAGTAATTTCGGTGCAGGAAATGCACGCACAGATCAAATAATAGCGTGTCATGGCAGATATTTTTCATCCGCTAATTTGATCGAATAACTAATACGGTTCTCTGATGAGGACCG‑TTTTTTTTTGCCCATTAAGTAAATCTTTTGGGGAATCGATATTTTTGATGACATAAGCAGGATTTAGCTCACACTTATCGACGGTGAAGTTGCATACTATCGATATATCCACAATTTTAATATGGCCTTGTTTAATTGCTTCAAAACGAGTCATAGCCAGACTTTTAATTTGTGAAACTGGAGTTCGTATGTGTGAAGGATATGTTGAAAAACCACTCTACTTGTTAATCGCCGAATGGATGATGGCTGAAAATCGGTGGGTGATAGCAAGAGAGATCTCTATTCATTTCGATAT > NC_000913/33811‑34406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |