Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 4,187,507 | 0 | A→C | 100.0% | 430.2 | 147 | N720H (AAC→CAC) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
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aTTAACCGTG‑ACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGAc < 2:83006/300‑1 (MQ=255) ggg‑ACGGTAAGGAAGAGAAGCAAGTTTCGTTCCAAAGGATGTACAAGATGGTCGGCGCCGGGGCGCGTGGTTATGCGGCACAGAATCGTCAGCTGGCTGGGATGGGGGGTCTGATGGCGAAGCCGGAGGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCAGCGCGAACCTCAGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTGCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCtggtgg < 1:548673/298‑1 (MQ=255) gTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCTCCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAATTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGAACTGGTGGTTACCGa > 2:904135/1‑301 (MQ=255) gAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAACGGTCTGGCGAATACCGCACTGAACACCGCGAACTCCGGTTCCCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGCCGCAGAACATGATGGttcacgccggcg > 2:166516/1‑291 (MQ=255) aaGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACGCCGGGGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACg < 2:394363/300‑1 (MQ=255) gagaAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTACTGGTATGCGTGGTCTGTTGGCGAGGCCGGATGGCTCCATCATCGACACGCCAATCCCCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGTTGCGCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTCAACACTCCGAACTCCGGTTACCTGCCTCGTCGCCTGGTTTACGTGAGCCAGGCACTGGTGGTTCCCGCAGACGAtt > 1:328894/1‑301 (MQ=255) agaAGCAGGTGTCCTTCCACAGCATCTAGATGATGGCCGAGTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAATACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGAt < 1:676159/299‑1 (MQ=255) tCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACGCAAAGCTGACAACTCCGGTTACCTGCCCCGTCGTCTGGTTGAAGTGGCGCAGGACCCGGTGGTTGCCGagggcgggtgggttaccccgg > 2:309131/1‑281 (MQ=255) tCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACACCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCCCGTAAAGGCCTGGCGGATACCGCACTAACACCTGCGAACGCCGGTTACCTGACTCGCAGTCTGGTTGCAGTGGCGCGGGCCCGGGTGATTACCGAAGACTATTGGGGTACCCATg > 1:927211/1‑301 (MQ=255) | GGACCAGATCATGTACACCGGCTTCGCCTATGCAGCGCGTTCTGGTGCATCTGTTGGTATCGATGACATGGTCATCCCGGAGAAGAAACACGAAATCATCTCCGAGGCAGAAGCAGAAGTTGCTGAAATTCAGGAGCAGTTCCAGTCTGGTCTGGTAACTGCGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCG‑AACGATCGTGT‑ATCCAAAGCGATGATGGA‑TAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTG‑ACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGG > NC_000913/4187212‑4187805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |