Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,519,739 | T→C | 6.0% | L238P (CTT→CCT) | curA → | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 1,519,739 | 0 | T→C | 6.0% | 3.2 0.0 ‑0.1 | 67 | L238P (CTT→CCT) | curA | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (36/27): total (38/29) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.26e-01 |
GGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGTGCCCAAAAGGTATTGATATCTATTATGAAAACGTGGGCGGTAAGGTATTCGATGCGGTGCTACCGTTACTTAATACATCTGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAA‑AGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCC‑ACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTG > NC_000913/1519444‑1520037 | ggCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGTGCCCAAAAGGTATTGATAGCTATTATGAAAACGTGGGCGGTAAGGGATTCGATGCGGTGCTACCGTTACTTAATa > 2:245096/1‑301 (MQ=255) 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aaaCGGTGGCGGTAAGGTATTCGAGGCGGTGCGACCGTTACTTAATACAGCGGCGCGCATTCCCGTCTGCTGATTAGTGCGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACGCGGTCCGGATCGGTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATCCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAA‑AGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCC‑ACAGACg < 2:682723/301‑1 (MQ=255) tGGGCCGTAAGGTATGCGATGCGGTGCTACCGTTACTTAATACATCCGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCCATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGATATGGGGCAATGGGTGAA‑AGATGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCC‑ACAGACGTTTAt < 2:798701/301‑1 (MQ=255) aaGGTATTCGATGCGGTGCTACCGTTACTTAATACATCTGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGCTGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCGTGCAAGGTTTTATTATGGCTCAGGATTATGGTCATCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAA‑AGAGGATAAACTCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTTGAGAATGCCCC‑ACCAGCGTTTATCGGCcttg > 2:771884/1‑299 (MQ=255) 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ttAATACATCTGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAC‑ag > 2:464791/1‑201 (MQ=255) ttAATACATCTGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAA‑ag < 1:464777/201‑1 (MQ=255) | GGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGTGCCCAAAAGGTATTGATATCTATTATGAAAACGTGGGCGGTAAGGTATTCGATGCGGTGCTACCGTTACTTAATACATCTGCGCGCATTCCCGTCTGCGGATTAGTGAGCAGCTATAACGCTACAGAGCTACCACCCGGTCCGGATCGTTTACCTCTGTTGATGGCTACAGTGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAA‑AGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCC‑ACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTG > NC_000913/1519444‑1520037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |