New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CGGTTAACGTCAACGTGATCGCCGCAAGCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATGCGCCAGCGCCGCGCTGTGTTCTGCGATGCGTTCCCAGTGTGGACGAAGATTTCGTGCCGGTTGTGCCAGACTAAGCGCCGCCAGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCGGCTGGCTTCTTGCTGCAATTCGTCCTGACGCGTTAACCAGTTTAGCGATTGTTGTTCTTGCTGCTGCGCGGTAATTAACTGTTTTTCTTCGTCAGTAAGTACCTGCAAACTCGCTGTCAGCGATTGCACTTGTTCCGGCGTGAGCAAC > NC_000913/414532‑415121 | cggTTAACGTCAACGTGTTCGCCGCAAGCGCATTAAGGTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCTATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGGTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGGAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAatat < 1:55333/300‑1 (MQ=255) aCGTCAACGTGATCGCCGCAAGGGCATTAAGTTTTTGCCAAGCATGGGTTAACGGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCTCGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATGcgccag > 2:315761‑M2/1‑295 (MQ=255) aCGTCAACGTGATCGCCGCAAGCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGCGCACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGTAAGCGGTCGTGTTACTGTAACCTGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGATGACTGCTTCGCCGCGTGGCGGCGCATGCTGGCGCGAACCCCCTTTGTGCTCTGTAAGCGAGTGTTTCCTTCCTCAACCTACTGTCGCGTTTGCGCCa > 2:88016/1‑300 (MQ=255) aCGTCAACGTGATCGCCGCAAGCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTACACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTTGCGCATGCTCGCGCGAAGCGACATTTTGCTCTTTACGCGAGTCTTTACTTTTTCAAGCTGCTGGCGACTCTGCGCCaa > 2:799685/1‑300 (MQ=255) tCAACGTGATCGCCGCAATCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATGCGCCAgcgc < 1:799720/301‑1 (MQ=255) cAACGTGATCGCCGCAAGCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTGTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTTCTTCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGCATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAACCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGTCGAATATTCGCCAgcgc > 1:743858/1‑300 (MQ=255) cGTGATCGCCGCAAGCGCATTAAGTTTTTGCTCAGCATGGGTTAACTGTTGCTGCCATTGCCGCA‑GATGCTCGCGATCGCTGGTTTGTTGGGAGAACTGCGCACGCCAACCCGCCGGTTCGTTGTTCCACTGACGGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTACTTCTGCTGACTGCTACGCCGCGTGGAGGCGACTGCTCGCGCGACGCGCCATTGTGCTCCTTAGGCGAGTATTTACTTCCTCAATCTGCTGGCGAATATGCGCCAGcgcctc > 2:110370/1‑298 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |