Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3455330 | 3455908 | 579 | 45 [43] | [44] 45 | [gspA]–[gspC] | [gspA], [gspC] |
GATTATTTTTAATGTGAATTATTTCCATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTACAACCAGGGGAT > NC_000913/3455667‑3456207 | cggaagcgtcagatgtgtataagcgccagcAACTATAGTTAAAAATTGACAGATCATTAATCAACCAACAAACTCGATTCAGTCCGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTGAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACg < 2:938137/272‑1 (MQ=255) gAATTATTTCCATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAg > 2:354495/1‑244 (MQ=255) gAATTATTTCCATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAg < 1:354499/244‑1 (MQ=255) ccATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGcc > 1:641980/1‑256 (MQ=255) acATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCCGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGcc < 2:641956/255‑1 (MQ=255) cAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAACAGCGATACTCCCTAAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTCTTTGAAAAATACATACAACCAgatt > 2:218363/1‑298 (MQ=255) cAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTTAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGt > 2:764265/1‑301 (MQ=255) cAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGt > 2:620015/1‑301 (MQ=255) cAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGt > 1:423009/1‑301 (MQ=255) cAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGACGGGAACg > 1:938186/1‑272 (MQ=255) aaaaTGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCTGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATTAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAACGTTGTGTTTGaaaa > 1:513174/1‑300 (MQ=255) gATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCAt > 1:778990/1‑301 (MQ=255) tCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTa > 1:874140/1‑301 (MQ=255) aaGTCGGATTTCAGCCTTGCCGCTTTAGGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTTAAAGATGCAAATCCCGTGGAAGTTAATCATGAAACACCTAAGCTCTCTTTAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTGGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGc < 2:423003/300‑1 (MQ=255) gTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTa > 1:509751/1‑301 (MQ=255) tttCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGa > 1:952122/1‑300 (MQ=255) tCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATTCCGGGGTAAAAGCTGCAAAACCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGAcat < 2:513166/301‑1 (MQ=255) tCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGAcat < 2:952072/301‑1 (MQ=255) gCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCCCATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGCGCGCGAACAAAAACGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTTAGTCAGCGCCGGGAACGATTGTTAGAAAAATAACTAAAACGAGCGTTGTGTTTGAAACTAACGGGCATAACGAAAAGTTAACTATACATCCAGTGCAACCTGCCATCCTCAagacg > 2:553859/1‑297 (MQ=255) cTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGTGAAGCGAACAAAGGCGATACTCACTCAACGAAGACCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCGCGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCACCCATGGCTACCTGACCTCAACAagcagc > 2:473761/1‑300 (MQ=255) cTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCt > 1:972806/1‑169 (MQ=255) cTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCt < 2:972752/169‑1 (MQ=255) ttAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACg < 1:620030/301‑1 (MQ=255) ggAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGAAGga > 1:459648/1‑301 (MQ=255) gAAACCACTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGAt < 2:874099/297‑1 (MQ=255) gtctctATAGCGCTTAATGGCAGTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTGAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAagc < 2:440917/222‑1 (MQ=255) ctctctATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAagc > 1:440924/1‑223 (MQ=255) ctctATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGc < 1:177401/173‑1 (MQ=255) ctctATAGCGCTTAATGGCATTGTACCCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGc > 2:177398/1‑173 (MQ=255) ctctATAGCGCTTAATGGCATTGTAATCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCACTCCCGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCCCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGTTATACggg > 2:669627/1‑301 (MQ=255) ctATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCCGGGATACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAACGTCAAAATGTACTACCTGATTATATTATCCCCACGCCTATACGTGATGACGAACAGATATAAgggat > 2:586724/1‑299 (MQ=255) ctATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATg > 2:827044/1‑243 (MQ=255) ctATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATg < 1:827080/243‑1 (MQ=255) tAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCCCCATCCAGGGCTACATGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGaa > 1:276313/1‑300 (MQ=255) aaggccaatGTACTCACATCGAAAGATGAGCCTTCTTTTGTGTTAATTATTGAGGGGAGCAAACAAAAGCGATACCCCCTCAACGAAGCCCTTTAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAAcc < 2:778956/293‑1 (MQ=255) tGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAAccc > 1:405724/1‑300 (MQ=255) aTTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATCAGGGCTTCGATTGAACCATCGTa > 1:372874/1‑301 (MQ=255) gTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACCAGCTGATTATATTATCGCCACGCCTAACCGTGTTTGAGAACAAATATACGGGTTTCGATTGAACCCTCGTaatg > 2:376875/1‑299 (MQ=255) cacaTCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAAACCTCGTAAGGGCCt > 2:576960/1‑300 (MQ=255) ttcttTTTTCTTAATTAATGGGGGGAGCGAAAAAAAGCGATACACCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGc < 2:509743/301‑1 (MQ=255) gTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTa > 1:183528/1‑300 (MQ=255) taattaatGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTACAAc > 1:345521/1‑300 (MQ=255) aaattaatGAGGGGAGCGAACAAAAGGGTTACTCCCACAACGAAGCCCTTTGATCAGCGGCGGGAACGTTTACTAAAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACGCACGGGCATTACGAAAAACTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACACCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTGCCACCAGCTTGCTACAAcc < 2:459641/300‑1 (MQ=255) aatGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTACAACCAgggg > 1:557252/1‑301 (MQ=255) aGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACTAAGCCCTTGGGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTACAACCAGGGGat < 1:376880/299‑1 (MQ=255) | GATTATTTTTAATGTGAATTATTTCCATACAACTATAGTTAAAAATGGACAGATCATTAATCAACCAACAAACGCATTTCAGTCTGATTTCAGCCTTGCCGCTTTATGGCGTAACGAAAATCATGCTGGGGTAAAAGATGCAAATCCCGTGGCAGTTAATCAGGAAACACCTAAGCTCTCTATAGCGCTTAATGGCATTGTACTCACATCGAATGATGAGACTTCTTTTGTCTTAATTAATGAGGGGAGCGAACAAAAGCGATACTCCCTCAACGAAGCCCTTGAGTCAGCGCCGGGAACGTTTATTAGAAAAATAAATAAAACCAGCGTTGTGTTTGAAACTCACGGGCATTACGAAAAAGTAACTCTCCATCCAGGGCTACCTGACATCATCAAGCAGCCTGATTCAGAAAGTCAAAATGTACTCGCTGATTATATTATCGCCACGCCTATACGTGATGGAGAACAGATATACGGGCTTCGATTGAACCCTCGTAAGGGCCTCAATGCATTTACCACCAGCTTGCTACAACCAGGGGAT > NC_000913/3455667‑3456207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |