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Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
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gTCGATGGTCGCCAG‑TGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGCTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCCCCAGGAATCGGCTGGcagcag > 1:982304/1‑300 (MQ=255) aTGGTCGCCAG‑TGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCAGCAgcgcgc < 2:1343376/301‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAG‑TGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCAGCAgcgcg < 2:1333138/300‑1 (MQ=255) tGGTCGCCAG‑TGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCAGCAGcgcgcg > 2:1148428/1‑301 (MQ=255) ggTCGCCAG‑TGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCAGCAGcgcgcgg > 2:652108/1‑300 (MQ=255) aGTGGCTGTTTGTGGTGGCGACGGCTGCAAACGCCAAGCACGTTACACTTCTAGTTGGCGTGAATGGGCGGTATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGAGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGAATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCGGCAGCGCGCGATgtgg < 1:1388775/300‑1 (MQ=255) | CTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACGCGCCCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAATCTCATCTCCAGGAATCGGCTGGCAGCAGCGCGCGATGTGG > NC_000913/2911238‑2911831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |