| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4034172 | 163 (1.120) | coding (1028/1452 nt) | trkH | potassium transporter | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGT‑TGCGACATTGAATAACCTGGGGCCAGGGCTTGGCGT > NC_000913/4033873‑4034469 | aTCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTCCTGCTTTTATGTTCAGCCTTTA‑Tcg < 2:106888‑M2/301‑3 (MQ=255) 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tCAGCCTTTA‑TCGGCGGTGTCGCCGGGGCAACGGGCCGGGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGGTGAAACGATTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGTGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGT‑TGCGACATTGAATAACCTGGGGCCAGGGc < 2:1498993/301‑1 (MQ=255) ttA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGGCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTGTAAGCAGGGGAACCGTTAGCTGAAACGACTGGGGCAGCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAAGCGCGAACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGGGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGT‑TGCGACATTGAATAACCTGGGGCCAGGGCTTGGCGt < 2:1386900/301‑1 (MQ=255) | TATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGGCGTGGATGACTTTTCTGCCTTTGCGTCGGTTGT‑TGCGACATTGAATAACCTGGGGCCAGGGCTTGGCGT > NC_000913/4033873‑4034469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |