Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,410,026 | G→A | 7.4% | intergenic (+20/‑107) | rlmB → / → yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,410,026 | 0 | G | A | 7.4% | 155.3 / 2.3 | 54 | intergenic (+20/‑107) | rlmB/yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/20); new base A (2/2); total (32/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 |
CTAACCTTGCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAAT > NC_000913/4409738‑4410324 | cTAACCTTGCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGCAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTTGACGCGTTTCTTCCATGAACGTTTCGGTTGCGCCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAACTAATTTATCAGAATTATGAAACGCCATCCAGAgtt > 1:217803/1‑301 (MQ=255) tttggcgcACCATGCGTTTGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATgg < 1:147064/297‑1 (MQ=255) tGCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑t > 2:519157/1‑301 (MQ=255) gTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCt > 2:191401/1‑301 (MQ=255) 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gCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAAtagaacggaagagcgacgagcagg > 1:166288/1‑278 (MQ=255) ccgatctggATCATACACTCTTTCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAGCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatta < 1:276012/294‑1 (MQ=255) ggcgGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCaaaagatcggaagagcacaca > 2:505602/1‑283 (MQ=255) 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gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTTCGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTTTACCTGAACAAAATATTGCTGTAACAAATACCACGACCGCATTAATTCTTAAACTGAATGATTATGGCGATTTGCAAAACACTCTTCTTTTTACTTCCCGCCAAATAATTCACGAAACCTTTCTTTCTCCGGTGcgtagcacactc > 1:456662/1‑294 (MQ=255) aaGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCCAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATATGTCCGGTGATTAGTATCAGCaaa > 1:461233/1‑300 (MQ=255) | CTAACCTTGCGCGCACCATGCGTATGTTGCAGGAAGAGAATATCTGGATCGTCGGTACGGCAGGCGAGGCGGATCATACACTCTATCAGAGCAAAATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAAT > NC_000913/4409738‑4410324 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |