Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 644,042 | 0 | C | T | 9.5% | 162.2 / 4.9 | 58 | intergenic (‑75/+155) | rnk/rna | regulator of nucleoside diphosphate kinase/ribonuclease I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/26); new base T (4/2); total (30/28) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CAGCGTGCGCACACGCACTTCGCCATCGCTAAGATTGCGGAATTTAACCCGGCTGTTCATTGTCACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATATCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGATAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCTGCGAGTGTCGCAGATAAACATACCCAAAAGAAAACCCTCACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCT > NC_000913/643743‑644342 | cgaagtgcgtgtgcGCACTTCGCCATCGCTAAGATTGCGGAATTTAACCCGGCTGTTCATTGTCACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATATCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGATAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCTGCGAGTGTCGCAGATAAACATACCCAAAAGCAAACCCTCACCGTCAGgcggcg > 1:491868/14‑301 (MQ=255) 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ggAATTTAACCCGGCTGTTCATTGTCACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATATCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGAAAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCGGCGAGTGGCGCAGATAAACATACCCAAAAGAAAACCCTCACCGCCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATAATGATACTGACTGTTGCTCAc > 1:518523/1‑301 (MQ=255) cccGGTTGTTTATTGGTACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATAGCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGATAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCTGCGAGTGTCGCAGATAAACATACCCAAAAGAAAACCCTCACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAg < 1:298489/301‑1 (MQ=255) gTTCATTGTCACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATATCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGATAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCTGCGAGTGTCGCAGATAAACATACCCAAAAGAAAACCCTCACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTACAATGATGATCCTGACTGTTGCTCACTCATTAAAGTGAtttt > 1:436686/1‑300 (MQ=255) 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ccGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGaaagatcggaagagcaca > 2:384638/1‑285 (MQ=255) cgAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGTGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCt < 2:485031/301‑1 (MQ=255) | CAGCGTGCGCACACGCACTTCGCCATCGCTAAGATTGCGGAATTTAACCCGGCTGTTCATTGTCACCACGTCGTGTGGCATCTCTTCTGGCGAACACATTTGGGCGCGATCCAACTCTGCGTTTAACGCGTCGGCGATTGGCAAACCAGCATAGGCGGGTTGCTCCAGCAGAATATCGATGCGTTCGGCATCCAGGTCGTTAATGATGATAGTTGGTCTGGACATTTTTACTCCATGTCGTCGGTGCTGCGAGTGTCGCAGATAAACATACCCAAAAGAAAACCCTCACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCT > NC_000913/643743‑644342 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |