| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4044061 | 178 (1.090) | intergenic (+17/‑138) | dsbA/yihF | periplasmic protein disulfide isomerase I/DUF945 family protein | |||||
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| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CTTCTGATATCCGCGATGTATTTATCAACGCAGGTATTAAAGGTGAAGAGTACGACGCGGCGTGGAACAGCTTCGTGGTGAAATCTCTGGTCGCTCAGCAGGAAAAAGCTGCAGCTGACGTGCAATTGCGTGGCGTTCCGGCGATGTTTGTTAACGGTAAATATCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACA > NC_000913/4043788‑4044379 | cTTCTGATATCCGCGATGTATTTATCAACGCAGGTATTAAAGGTGAAGAGTACGACGCGGCGTGGAACAGCTTCGTGGTGAAATCTCTGGTCGCTCAGCAGGAAAAAGCTGCAGCTGACGTGCAATTGCGTGGCGTTCCGGCGATGTTTGTTAACGGTAAATATCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAACTATCTGTCCGAGAAACAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCtt‑‑‑‑‑‑‑tt > 3:16721/1‑301 (MQ=255) 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4:901782/301‑1 (MQ=255) tAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGTTATAACTTTa > 1:1000698/1‑300 (MQ=255) gAATATTCACGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTa < 4:1319971/204‑1 (MQ=255) cACGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑GTTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGAc < 4:662615/301‑1 (MQ=255) aCGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATCATGCATCCTTCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAAc < 1:761679/240‑1 (MQ=255) aCGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCa < 4:211821/200‑1 (MQ=255) aCGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAAc > 4:761704/1‑240 (MQ=255) cGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATtta < 4:667535/225‑1 (MQ=255) | CTTCTGATATCCGCGATGTATTTATCAACGCAGGTATTAAAGGTGAAGAGTACGACGCGGCGTGGAACAGCTTCGTGGTGAAATCTCTGGTCGCTCAGCAGGAAAAAGCTGCAGCTGACGTGCAATTGCGTGGCGTTCCGGCGATGTTTGTTAACGGTAAATATCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑TTT‑‑‑TT‑‑ATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACA > NC_000913/4043788‑4044379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |