| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 721003 | 89 (1.490) | 5 (0.090) | 5/550 | 7.6 | 5.6% | intergenic (+163/+53) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| ? | NC_000913 | = 721011 | 81 (1.400) | intergenic (+171/+45) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
GTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGTCCCATATAAATACGCAAATA‑GTGACTGTGTTCGACCGCGTTTGGCCCCCACACCTGGTTAAGGAGCTGGCGCTGGGTGAGTACTTTTCCGGCATTGTTGAGCAGCACCGCCAGCAGGCGGAACTCAATTGGTGTGAGATGCACCTCTTCCTCACCCCGG > NC_000913/720709‑721302 | gTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGCATTGTTTTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt > 2:158464/1‑301 (MQ=255)gTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt > 1:346082/1‑301 (MQ=255) cGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtaataataa > 3:132003/1‑293 (MQ=255) cGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat > 1:209091/1‑301 (MQ=255) cGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat < 1:306806/301‑1 (MQ=255) aGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg > 2:13450/1‑301 (MQ=255) gACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACgg > 3:137700/1‑301 (MQ=255) cGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGTCtttct > 3:98145/1‑299 (MQ=255) aTTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGAGGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGCTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAACCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATATTACTTTTTGGTTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATACCGTCTttaattaaa > 2:159541/1‑300 (MQ=255) gaagaaGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa > 2:142375/1‑301 (MQ=255) aagTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggc < 4:13465/301‑1 (MQ=255) gAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc > 1:47211/1‑301 (MQ=255) gAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc < 3:25955/301‑1 (MQ=255) aaaaGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTGCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc < 2:55168/300‑1 (MQ=255) gCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa > 4:114887/1‑301 (MQ=255) gCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 4:72916/1‑301 (MQ=255) gATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATAtt > 4:139375/1‑301 (MQ=255) aTGAGCAAACTTCATAATATTAGTTGTCCGCCTTATATGTGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTc < 3:19950/301‑1 (MQ=255) aGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaaa > 4:42293/1‑301 (MQ=255) cAAACGTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 2:42249/300‑1 (MQ=255) caCTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTATGTTAAAATGCCGTATTTATTATTACGGCTTTATTTATTAAAAGGCAGGCTGTATTACTATTATTATTCaattcat > 3:118222/2‑296 (MQ=255) cTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa > 2:27250/1‑301 (MQ=255) tGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATa < 1:98151/300‑1 (MQ=255) tGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAAT‑AAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCttt < 1:154873/239‑1 (MQ=255) gTCCGACTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATAcc < 1:309908/301‑1 (MQ=255) 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gCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt < 1:291150/301‑1 (MQ=255) ttATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTATGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAACGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCATAGCTAAAACCGATAGCCAATCCCGGTTTc > 3:359802/1‑300 (MQ=255) gTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCg > 2:158951/1‑301 (MQ=255) 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tttaCCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAg > 4:63103/1‑301 (MQ=255) ccTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGtttt < 2:148248/301‑1 (MQ=255) cctacacgactctcttccgagctaGAAATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTTTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGTTTTTg < 2:80775/278‑1 (MQ=255) tCCTGTTGTAGATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATAAGGTTGAGCTGTGAAGGTGATAAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTAAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGGAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTc < 4:92030/301‑1 (MQ=255) tgtgAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGc > 1:22784/1‑297 (MQ=255) tgaaGGTGAAGATATTCTTTCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACGCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGCGGGCGGGATCCTGTTCCAGTTTTTGTCGCAGATGTCCCa < 4:141368/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |