| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 127761 | 60 (1.070) | 3 (0.050) | 3/546 | 8.4 | 5.0% | intergenic (+174/‑151) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 127874 | 55 (1.010) | intergenic (+287/‑38) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
TGCTGCCGATTTCTCTCTCCTTCGACCACCGCGTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGAAACCGTAATCGTAGAACGTTACAACACCCTTGGCGGTGTTTGCCTGAA > NC_000913/127475‑128051 | ggctgcCGATTTCCCTCTCCTTCGACCACCGCTTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCGGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGGAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTggg < 1:358765/300‑1 (MQ=255) tctctctcCTTCGACCACCGCGTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGGTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAgg < 1:144431/300‑1 (MQ=255) tctctcCTTCGACCACCGCGTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGt > 4:176786/1‑299 (MQ=255) ccgtcgatcacgcggTGGTCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACCGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTAATGATGTTATTAGCGAATAGACAATTCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAATTACCGACGGTTCGACAGACCCGGTGGTTGTTAGGGTAATACTTCCCATCACCTACGGATTACTGGGTTCATGAAGTTAGCaacg > 2:106230/15‑299 (MQ=255) ccTTCGACCACCGCGTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCa < 4:308020/298‑1 (MQ=255) tccaccgacgcttcaTCGCCGGGGCTTATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAgcgc < 2:154405/286‑1 (MQ=255) agcaccgtcgatcacgcGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGa > 3:48539/17‑301 (MQ=255) catcgcgTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTGACGACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTTATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAAt < 1:225564/298‑1 (MQ=255) gTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTTGTTGTTAGGGTTTTACTTCACCTACCCTATGTCTTTCTGTTTTCAGCAAGGTTGCAATCGCCAGAATCCCCat > 1:343047/1‑300 (MQ=255) gATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATCGATTTCTGGGTGCAGCATGGTAGCAAGCTCCAGAATCCCTAggg > 1:331790/1‑300 (MQ=255) tGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACAtaagt > 1:5010/1‑301 (MQ=255) ggTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCAAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACAtaagtaag < 4:362561/300‑1 (MQ=255) aCCTTCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCAGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTAGTAGCGAATATACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGc < 3:106358/301‑1 (MQ=255) aCCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAggg < 4:343055/300‑1 (MQ=255) gaccaaacggCTGTCTGACATTCGACGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCt < 1:49433/292‑1 (MQ=255) cacGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCt > 1:86459/1‑259 (MQ=255) cacGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCt < 4:86460/259‑1 (MQ=255) cacGCGGTCTGACATTCGCCGGCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCGCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAAcgcc < 2:48481/301‑1 (MQ=255) gTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTAAATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCg > 2:30429/1‑301 (MQ=255) cTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGc > 4:40065/1‑301 (MQ=255) gACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGcc < 4:5010/300‑1 (MQ=255) gagttcagacgtgtgctcttccgatctcAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGacgacg < 3:67348/273‑1 (MQ=255) ggTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGt < 1:176785/301‑1 (MQ=255) gcgctcttccgatctgCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTGGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTAt < 2:121697/285‑1 (MQ=255) gATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTACTCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATCGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGCGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGTTTTCTGGGTGCAGCCAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGATTACCTAAGTAAGTGACTGGGGTGTGGTCGTGAAGCCAACGCCGCTGCGGCTCGAAAgacgatgcgtc > 1:297763/1‑293 (MQ=255) gtaaAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCCTTAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGATCGACCTGCTGGTGGTTAGGGTATTACTTAACATAAAAACAGGTTTTCTAGGGGGAGAAAGGGAACAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGGTGAACTAAGTAAGTGACTGGGGTGGTTTCTTGAAGCTAACTCCGCTGCGGCCTGAACGACGACGGGTATGAccgccg > 4:307982/1‑301 (MQ=255) aaGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCgg > 4:54922/1‑298 (MQ=255) gCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTAtagatcggaagagcaca > 3:121847/1‑285 (MQ=255) ggCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAatat < 1:40065/301‑1 (MQ=255) cAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGGAAGTGACTGGGGTGAGGGCGGGAAGCTAACGCAGCTGCGGCCTGAAAGACGACgggatcggaagggcggcgtggaggggtag > 2:67272/1‑275 (MQ=255) tGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTg < 3:30471/301‑1 (MQ=255) ctcATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCa > 1:231688/1‑300 (MQ=255) ttattaGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACt > 4:177766/1‑301 (MQ=255) ttaGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTgt > 3:62529/1‑300 (MQ=255) gaagagAATAGAAAAATCGGTGGCCGGTTGGTGTTTAAAAATTGGTAAGAATTGGGTAAAAAAAAGAAGGAGAAAAGGACCCGGTGGGGGTTAGGGGAGTACTTCACAGACCCTATGGAGTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAAGCCCCAGGAGCGTACAGAAGTAAGTGACTGGGGTGATGGCGTGAAGCTAACGCCGTTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTg < 2:62459/295‑1 (MQ=255) gACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTa < 1:15789/191‑1 (MQ=255) gACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTa > 4:15789/1‑191 (MQ=255) aCAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCCTGcccca < 1:177765/301‑2 (MQ=255) taaTCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCa < 3:46498/300‑1 (MQ=255) aaaTCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATc > 1:77718/1‑265 (MQ=255) aaaTCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATc < 4:77719/265‑1 (MQ=255) aaTCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCaa > 2:46440/1‑300 (MQ=255) cGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGt < 4:231691/300‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGt < 4:331797/300‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGCGGTCATGCTGAGTACTTAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGACCTCGCAGGTTat > 1:197257/1‑300 (MQ=255) tAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGAtt > 4:152949/1‑86 (MQ=255) tAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGAtt < 1:152948/86‑1 (MQ=255) aaaaaTTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGCGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGttt > 1:131546/1‑300 (MQ=255) tGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGAGCTGa > 3:107075/1‑301 (MQ=255) tAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGc > 4:132870/1‑259 (MQ=255) tAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGc < 1:132869/259‑1 (MQ=255) tttGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTg > 4:123957/1‑301 (MQ=255) gTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGAGTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGaa > 3:62480/1‑301 (MQ=255) aaCCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGGAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGAAACCGTa < 4:197258/300‑1 (MQ=255) tAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGaa < 4:165067/126‑1 (MQ=255) tAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGaa > 1:165066/1‑126 (MQ=255) aGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCCGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGcc < 1:82564/237‑1 (MQ=255) aGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCCGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGcc > 4:82565/1‑237 (MQ=255) ggTATTACTTCACATACCCTATGGATGTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAAGCGCCAGGAGCTTACATAAGTAAGGGACAGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGAAACCGTAATCGTAGAACGTTACAACACCCTTGGCGGTGtt < 1:123956/301‑1 (MQ=255) ttCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGAAACCGTAATCGTAGAACGTTACAACACCCTTGGCGGTGTTTGCCTGaa > 3:52099/1‑301 (MQ=255) | TGCTGCCGATTTCTCTCTCCTTCGACCACCGCGTGATCGACGGTGCTGATGGTGCCCGTTTCATTACCATCATTAACAACACGCTGTCTGACATTCGCCGTCTGGTGATGTAAGTAAAAGAGCCGGCCCAACGGCCGGCTTTTTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCATGATGAGTACTGAAATCAAAACTCAGGTCGTGGTACTTGGGGCAGGCCCCGCAGGTTACTCCGCTGCCTTCCGTTGCGCTGATTTAGGTCTGGAAACCGTAATCGTAGAACGTTACAACACCCTTGGCGGTGTTTGCCTGAA > NC_000913/127475‑128051 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |