New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2819836 = | 245 (1.110) | 4 (0.020) | 4/544 | 32.6 | 1.7% | coding (2176/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase |
? | NC_000913 | 2819907 = | 231 (1.080) | coding (2105/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CACGATCTGTGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGGTTTC > NC_000913/2819536‑2820133 | cacGATCTGTGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGattatt > 3:597096/1‑301 (MQ=255) ccTTAGATACGCCTGCCATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTca < 3:705532/300‑1 (MQ=255) ccTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCATCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACAAACAGCTTAACACCATTAACATCATTTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTcag < 4:587482/301‑1 (MQ=255) tAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTcagc > 4:258389/1‑299 (MQ=255) aGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTTTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGa < 3:992324/301‑1 (MQ=255) aCGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATgcg < 4:679865/301‑1 (MQ=255) ccTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGcgcgc > 4:11172/1‑300 (MQ=255) 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ccAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGc < 2:133581/301‑1 (MQ=255) gCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCCGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCCTGAACGGTGGc > 3:659923/1‑298 (MQ=255) gCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTc < 4:1383492/248‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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