New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1002641 = | 48 (0.910) | 3 (0.060) | 3/590 | 7.0 | 5.9% | coding (835/1071 nt) | elfG | putative fimbrial‑like adhesin protein |
? | NC_000913 | 1002700 = | 49 (0.940) | coding (894/1071 nt) | elfG | putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TCCTCCTATGGCGCTGGCGCGATTATATGAATGCTACAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTACCACCAGAAACCGGGCGATTTGAAGCCACGGCAACGGTGAGAATAAATTTTGATTAACGCGTGAACGTATGAAGAAAAAAACGATATTTCAGTGCGT > NC_000913/1002343‑1002917 | tcctccTATCGCTCTGGCGCGATCATTGTGATACTAACACATACCGGCAGGTTCTTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTGCGATACATTCACGTGGCTCCTGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATGTAGGTAATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACATGGGAAACGCGTGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAAcc < 2:93231/301‑1 (MQ=255) acactcttcggatctggcagaaTTATATGAATGCTAAAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACATGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCGTTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGTGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATATCTTCACTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAAcc < 2:218780/280‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGGCGCGATTATATGAATGCTACAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCACTTTCAGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTCGGGGCCAGAACGGCAGAACTGGCAATTCCAGTCAGGTGGAACACGGGTATCGCGGGATACGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCCACcacacc > 2:186040/1‑298 (MQ=255) tggcgctggcgcGATTATATGAATGCTACAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTTCGGCACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTCGGGCATAAACTTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCAAGTCCGGTGTAACACGGGAAACGAGGAGTGCGTTAATGTCAACCTGAGTCTCAGGGCACagacagaca > 2:305593/1‑299 (MQ=255) ggcgcGATTATATGAATGCTACAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGCCAATGCCGGAGTGACAATTGAAGTTGCTTCAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTTTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGTAGGCAACcagatcggaagagca > 1:218783/1‑287 (MQ=255) gagATAATAGGAAATCTAAAACATACCCGCAAGGGCATCCTTAACGACTACGGGTAAACCAGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTGCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCGCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGCCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATcc < 2:228313/298‑1 (MQ=255) aagAATGCTACAACATACCCGACAGTTTTTCCGGTACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGGGAGACAATTGAAGTTGAATTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGAt < 2:473344/299‑1 (MQ=255) gATTCCTGCACGACTCCAGGTACACCGGTTTTCGTGTATTACCTCTCTGGTACGATCAATTCACCCGGCTCCTGTTCCGTCAATGCCGGAGAAACACTCGAAGTTGATCTAGGTGATGTCATCGCTCCCAATATCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGACAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTCAATGTCAACCGGAGTATGTACGCAACCACAGACGCCAGCTATCCACAGGCGGTTAACacgtcaagcacgagcgtggacg > 2:79649/1‑285 (MQ=255) tGCACGACTACAGGTACTCCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGcccacgccaggacgtgacgt < 1:427783/301‑18 (MQ=255) aCAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCCGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATa > 1:394568/1‑301 (MQ=255) gTACACCGGTTTTAGTTTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATa < 1:428918/297‑1 (MQ=255) ttAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTTACTTGGCTCATGGTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACatta < 2:394559/301‑1 (MQ=255) tATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTccc < 1:234969/301‑1 (MQ=255) tATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGCTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCCCAGACCCCAGCTATCCCCCGGCGATTACGACGTCACGTCCGAGCGTGGGNGGGGTGGTGACAGAAACCAAGAACAACATTATATcc > 2:75146/1‑300 (MQ=255) aTTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATAATTTccc > 1:268293/1‑300 (MQ=255) tACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAAACACAGACCACAGCTATCACCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGGGGTGACCGAAAGCAAGAACAACCTTATTTccc > 1:500043/1‑298 (MQ=255) ccTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCctg > 1:398554/1‑299 (MQ=255) cTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTTAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCCCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACCTGCAATTCCACTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGACTAGTTACTGTCAACCTGAGCCTGACGGCAACAACACACCCCAGCTACCCCCAGGCGACTAATACGTACCGCCCTCGCGTGGGCGTGGTGCTGCACGATAGCCAGCACAACTTTCTTTCCCCTGCtggtgg > 2:183606/1‑301 (MQ=255) aTCAATTCACTTGGCTAATGTTACGGAAATGCCGGAGAGAAAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAAGTTCCGGGTTGGAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTATTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCGGCTATCCCCAGGCGATTAAGGCGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTa < 2:282487/300‑1 (MQ=255) tCAATTCACTTAGCTAATGTTCCGTCAATGCCGGGGAGACAATTTAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTAcc < 2:268289/301‑1 (MQ=255) aCTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGctct > 1:44873/1‑299 (MQ=255) cgtcgaggacggtgaaagaaagtaaGTTGAATTAGATTATTTCTTCCGAGCCAATTTGCGTGTTGTTGGGCCGAAACCTCGTGGGGCCAGAACGGCCGAACTAGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAGCCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCGGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGc < 2:518066/277‑1 (MQ=255) 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aGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGCCGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTAGCGCTCTCTATTCCTGATGATGAAGACAGTATCGAGCGCATGAATGt > 2:421118/1‑300 (MQ=255) acttagtgtagttattCGCTGCCAATTTCCGTGGTGTATGGCATAAAGCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACATGCAATTCCATTCAGATGCAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATcc < 2:324737/287‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGCCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATAATACAGCCAGTATCGCGCGACTGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACa > 1:14158/1‑301 (MQ=255) ccAATTTCCGTGTTGTACGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTacc < 1:421128/301‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGCCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCTCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGCGTACCACCAGaaa > 1:6768/1‑300 (MQ=255) tgtAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCGGATGATGCAGACCGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGTACGACAGGTGTAACACCAAAAACCggg > 1:390466/1‑301 (MQ=255) 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gtAACAGGGGGAACGCGGGATTAGTTAATGGCAACCTGAGGCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCGATCCCCAGGCGATTAAGGCGTCACGGTCGGGCGTGTGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTACCACCAGAAACCGGGCGATTTGAAGCCACGGCAACGGTGAGAATAAATTTTGATTAACGCGTGAACGTAt < 2:14158/300‑1 (MQ=255) acacGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTACCACCAGAAACCGGGCGATTTGAAGCCACGGCAACGGTGAGAATAAATTTTGATTAACGCGTGAACGTATgaag < 2:44872/301‑1 (MQ=255) tttAGTTACGGTCCACCTCGGTCTGACGGCAACCCCAGACCCCGGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTACCACCAGAAACCGGGCGATTTGAAGCCACGGCAACGGTGAGAATAAATTTTGATTAACGCGTGAACGTATGAAGAAAAAAACGATATTTc < 2:6768/300‑1 (MQ=255) 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TCCTCCTATGGCGCTGGCGCGATTATATGAATGCTACAACATACCCGCAGGTGATTCCTGCACGACTACAGGTACACCGGTTTTAGTGTATTACCTGTCTGGTACGATCAATTCACTTGGCTCATGTTCCGTCAATGCCGGAGAGACAATTGAAGTTGATTTAGGTGATGTCTTCGCTGCCAATTTCCGTGTTGTAGGGCATAAACCTCTTGGGGCCAGAACGGCAGAACTTGCAATTCCAGTCAGGTGTAACACGGGAAACGCGGGATTAGTTAATGTCAACCTGAGTCTGACGGCAACCACAGACCCCAGCTATCCCCAGGCGATTAAGACGTCACGTCCTGGCGTGGGCGTGGTGGTGACCGATAGCCAGAACAACATTATTTCCCCTGCTGGTGGAACATTACCGCTCTCTATTCCTGATGATGCAGACAGTATCGCGCGAATGAATGTCTATCCAGTCAGCACGACAGGTGTACCACCAGAAACCGGGCGATTTGAAGCCACGGCAACGGTGAGAATAAATTTTGATTAACGCGTGAACGTATGAAGAAAAAAACGATATTTCAGTGCGT > NC_000913/1002343‑1002917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |