| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,453,435 | (G)5→4 | coding (865/1026 nt) | ytfT → | putative sugar ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,453,431 | 0 | G→. | 100.0% | 375.4 | 89 | coding (861/1026 nt) | ytfT | putative sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (31/55): ref base (1/0): total (33/56) | ||||||||||
CGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCAC > NC_000913/4453235‑4453604 | cgcgAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTgggg > 1:465775/1‑200 (MQ=255) aTGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGAGGCGGATATTTGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGAGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGCGCGGGCGCTTTAACCTGCTTCTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAg > 1:220279/1‑200 (MQ=255) ggCTAACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAgg < 1:538395/199‑1 (MQ=255) cACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGAt > 1:481383/1‑200 (MQ=255) cTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTgggg > 1:637911/1‑179 (MQ=255) cTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGa > 1:714536/1‑200 (MQ=255) 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aTTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGt < 1:445343/200‑1 (MQ=255) aTTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGt < 1:338554/200‑1 (MQ=255) cgtcggGTCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCtt < 4:439459/138‑1 (MQ=255) cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCg < 1:538926/200‑1 (MQ=255) tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGGACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGc < 3:519956/132‑1 (MQ=255) tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGc > 4:365231/1‑141 (MQ=255) gCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGCTGAACACCGGACTTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGCGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTCCTGATTGTTCAg > 2:440026/1‑150 (MQ=255) gCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAAc > 1:773692/1‑200 (MQ=255) gATGGGCGGGCGCTTTAACCTTCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGAGTATTCAGGGGATGAGCACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAGAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCg < 2:292143/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTc < 4:562991/141‑1 (MQ=255) gcgcTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCAc < 1:634354/200‑1 (MQ=255) gcTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCa > 4:477227/1‑141 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGtt > 3:557242/1‑132 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 2:335033/150‑1 (MQ=255) gCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 4:487776/141‑1 (MQ=255) gCTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 4:567488/141‑1 (MQ=255) acTACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAGTTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 4:450916/140‑1 (MQ=255) tACTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAg < 4:342233/141‑1 (MQ=255) aCTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaaa > 2:479820/1‑150 (MQ=255) cTTTCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTc < 4:306799/141‑1 (MQ=255) tttCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTGCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAgg < 2:206770/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTGTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAgg < 2:721201/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGT‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATAAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAg < 2:519784/150‑1 (MQ=255) ggtggt‑GGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGGACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 3:29616/132‑1 (MQ=255) | CGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCAC > NC_000913/4453235‑4453604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |