| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP016816 | 462,630 | Δ57 bp | coding (2164‑2220/2238 nt) | JCVSYN2_02140 → | PTS sugar transporter |
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| ? | CP016816 | 462687 = | 2 (0.000) | coding (2221/2238 nt) | JCVSYN2_02140 | PTS sugar transporter | |||||
Only 100 of 1171 total aligned reads displayed.
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AACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAGCAAAATCAACATCTTCTAAACCAAAAACAACTAAAGCTAAATCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATAAATCACTCTTTTTCTATTGTTCTATTTAAA > CP016816/462560‑462814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |