| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 437881 = | 748 (0.240) | 854 (0.350) | 172/204 | 5.1 | 62.6% | intergenic (‑185/+237) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 437884 | 416 (0.170) | intergenic (‑188/+234) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 1460 total aligned reads displayed.
TAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438031‑437881‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatatATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAG < CP016816/437884‑437758 AAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAAATTTATAAAATATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATAT < 2:2224912/128‑1 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 2:6322151/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 1:6474923/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTAAAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTACACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 1:3220441/1‑128 AATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATAT > 1:301812/1‑128 aaATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAATACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATA < 2:4128214/126‑1 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCAACATTTTATGATGATCTCTTGC‑‑ATATATATATA > 2:371077/1‑128 gtataAAAAAATAAAAAATCTAAAATATAAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATATAATACAAACTCAGATCTAAATTTCACCAATTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATAT < 1:1009657/123‑1 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATAT < 1:3585107/128‑1 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAGCTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATA > 2:2070952/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATA < 1:5373103/128‑1 TTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATAT < 1:700921/128‑1 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA > 1:497645/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA > 2:1591484/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA > 2:3817005/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAAATATAAACTATATAAACTATAAATAAAAACTACAAAATTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA < 1:4150305/128‑1 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATAT > 2:5690380/1‑128 AAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑CTATATATATATATATATAGATA > 1:4347546/1‑128 AAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATA > 2:6591512/1‑128 AAAAAATTATAAATCTAAATTATTAAATTTATAAACTATAAATAAAAAATACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTATATTTAACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATA < 2:2720408/128‑1 AAATATTAAATATATATATTATTAACTTTATAAACTATATATAAAAACTACATATTTTAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATAT < 2:5782202/128‑1 AATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACAATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATgca < 2:5055144/128‑4 ATATAAAAAATCAAAATAATTAACTATATAAACTATAAAAAAAAAATACAAATTTAAGACCAACTCATATATAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATAT < 1:2116902/128‑1 ATTAAAAATCTAAATTATTAAATTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATca < 1:5904800/128‑3 TTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATA > 2:4406917/1‑128 AAATATAAATTATTAAATTTATAAAATATAAATAAAAAATACAAAATTAAGAAAAACTCAGATATAAATTTAACCATATTATTCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATcat < 2:4906323/128‑4 AATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATATTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCA > 2:4800678/1‑128 AATCTAAATTATTAACTTTATAAAATATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATACATATATATATATcatt < 1:5794718/128‑5 TCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACCAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATcattaa < 1:5046640/128‑7 aTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTATAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATACATATATATATATATATATATATATATATCATTA < 2:6458109/127‑1 AAATTATTAACTTTATAAAATATAAATAAAAACAACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTC < 2:1472796/128‑1 ATTATTAACATTATAAACTATAAATATAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATATATATATCACAATTTTATTCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTC < 1:3727575/128‑1 TATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCTCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCTCAATATCTCTA > 1:2756781/1‑128 TATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAATACCAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTA < 1:1150875/128‑1 TTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTATCTCTATA > 1:1641856/1‑128 aaataTATAAAATATATATAAAAAATACAAATATAATACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGG < 2:1182113/123‑1 ctaTATAAACTCTAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTA < 2:3391704/125‑1 TTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAA < 1:6584585/128‑1 TTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACAAACTCAGATATATATTTCACCATTTTATGCTGATCTCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAA < 1:1278742/128‑1 TATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATA‑‑ATTAACTCTATAGGTAATATt > 2:5576614/1‑127 ATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAAATCTATATTTAAT > 2:2606329/1‑128 ATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAAATTCACCATTTTATTCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATAT < 2:2458331/128‑1 AAACTATATATAAAAACTAAATATTTAAGACCTACTCAGATATAAATTTCTACATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATAT < 1:156344/128‑1 AAAATATATATAAAAACTAAAAATTTAAGACAAACTCAGATATAAATTTAAAAATTTTATGCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGG < 1:3817005/128‑1 ACTATAAATAAAAACTACATATATAAGACCAACACAGATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGAGCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGG < 1:3466902/128‑1 TATATATAAAAACTACAAATTTAATACCAACTCAGATATAAATTTAACCATTTTATGCTGATCTCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGT < 2:5462093/128‑1 TATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGATAATATAGAtat > 1:970380/1‑125 ATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGG < 1:2019641/128‑1 TAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGGTTTTT > 1:5488769/1‑128 AATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCAATAACTCTATATGAAATttagattttt > 1:288518/1‑118 AAAAACTACAAATATAAGACCAACACATATCTATATATCACCATTTTATGATGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTT < 2:4513756/128‑1 ACTAGAAATTTTAGACAAACTCATATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGC < 2:4001908/128‑1 TACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGC > 2:5177129/1‑128 ACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATA‑‑AATAACTCTATAGTTAATATTGATTTTTTTGCTTagattaat > 1:3904590/1‑120 CAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATATTTAATATTGAGGATTatcatttgatt > 1:5604510/1‑117 CAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTAACTCTAAATTTAATATTGAGTTTTTTGTTTTGCTT > 2:6219825/1‑128 AAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGATGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCAT < 1:5239250/128‑1 TAAGACCAAATCAGATCTAAATTTCTCTATTTTATGATGAGAGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCT < 1:2201757/128‑1 caAACTCATATCTAAATTTCACAATTTTATGCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAAT < 1:1496095/126‑1 aaaaTCAGATATATATTTAACAATTTTATGCTGATCGCTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAA < 1:6228698/124‑1 CTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTATATCTATAGTTAATATTGAGTTTTTTGATTTGATTCATGTAATAAAATATTT > 2:6000963/1‑128 CTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATCGATTTTTTTTATTTGATTGATTTAAAAAAATATTT > 1:6321429/1‑128 CTAAATTTATCTATTATATTATGATAGATTTA‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTATATAGGTAATATGTAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAA < 1:4001650/128‑1 TAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATAATTAACTCTATAGATTATATGGAGGTTTTTTATTTGATTAATTTAATAAAATATTTTTTTTAAA > 2:43043/1‑128 AAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGGTTTTTTCTTTGATTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAAT > 1:1777690/1‑128 AAATATCAACATTTTATGCTTATAGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAA < 1:1939988/128‑1 ATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGGTTTTTTCTTTGGTTGATTTCATAAAATATTTATTTTAAATAT > 2:1794656/1‑128 ATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGATGTTTTTGATTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAC > 2:3891708/1‑128 TTTCACAATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATACATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATA < 1:4787628/128‑1 TTTCAACATTTTATGCTTATAGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACA < 1:6144297/128‑1 TTCACAATTTTATGCTGATCGCTTGA‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATAC < 1:4890466/128‑1 ACCATTTTATGATGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACA < 1:2467089/128‑1 aCATTTTATTCTGATAGATTG‑‑‑A‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTT < 2:3072025/127‑1 ATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTATCTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGATTAATTTCCTAAAATATATATTTTAAAAATACAATTTT > 1:3119298/1‑128 TTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTATCTCTATAGGTAATATGGTGTTTTTTGATTTGCTTAATTTGCTAATATATTTATTTTAAAAATAATATTTTTAT > 1:815644/1‑128 TGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATA < 1:3382727/128‑1 gataggtagcatATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTA < 1:2663022/116‑1 ATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATATATAATATTTAGGTTTTTTCTTAGCATCATATCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCAAATA > 2:3276509/1‑128 ATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATT < 1:2307836/128‑1 agatttC‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATT < 1:2398705/122‑1 ttaATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT < 2:2315781/125‑1 cttgcATATATATATATATATATATATATATATATAATTAACTCTATAGTTAATATGGATGTTTTTTATTTGATTAATTTAATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATATTTATTTATAATATTTATT > 1:568664/6‑128 ATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATAGAGGTTTTTTATTTTATTAATATCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAA > 2:2880701/1‑128 ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAA < 2:6119203/128‑1 ATATATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAA < 1:4277862/128‑1 ATATATATATATATATATATATATATATAATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGATTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATG > 1:4594786/1‑128 TATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTTTTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAA > 2:813735/1‑128 TATATATATATATATATATCATTATCTATATAGGTATTATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA < 2:5893087/128‑1 tTATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGTTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAA < 1:1390396/127‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT < 1:4489630/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT < 2:3601870/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT < 2:2974586/128‑1 ATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTAC > 1:6008020/1‑128 ATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTATAAAAATACAATTTTTATATATAATATTTATTAAAAATTAAACTTACAACTAC > 2:5294879/1‑128 ATATATTTATATCTTTAACTCTATATGTAATATTGTGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAA < 2:1326950/128‑1 TATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAtttttgtagt < 2:683175/128‑11 TATATTTATCATTATCTCTTTAGGTAATATGTAGGTTTTTGCTTTGCTTGATTTCTTATAATATTTTTTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAtt < 2:1937046/128‑3 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:5141412/128‑1 TATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATA < 2:3169503/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 1:257482/128‑1 TAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438031‑437881‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatatATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAG < CP016816/437884‑437758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |