Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG51.7% 392.1 / 144.8 421intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (33/164);  new base G (160/51);  total (204/217)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.94e-35
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 540 total aligned reads displayed.

TGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAG  >  CP016816/105213‑105465
                                                                                                                               |                                                                                                                                     
tGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAG‑TATTTATTAGTATTTAATAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaatta                                                                                                                                      >  2:1885461/1‑128 (MQ=255)
 gattaacAAGCCTTTTTTATTTTTAAAATCAATTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATCTAAC‑TATATATAAATATAAAATATATAATATATCATTTTAATAtaataaa                                                                                                                                     >  1:352028/7‑128 (MQ=255)
 gTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTATTAATAtaattaa                                                                                                                                     >  2:1491578/1‑128 (MQ=255)
  ttAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaatgaat                                                                                                                                    <  1:1686009/128‑1 (MQ=255)
   tAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                   <  2:1944842/128‑1 (MQ=255)
    taacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattt                                                                                                                                  <  1:535929/125‑1 (MQ=255)
    aaTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattt                                                                                                                                  >  1:1798799/1‑128 (MQ=255)
     aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATCTAAT‑TATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAAtgaaatta                                                                                                                                 >  2:272957/1‑128 (MQ=255)
     aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                 <  2:1125467/128‑1 (MQ=255)
     aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                 <  2:572233/128‑1 (MQ=255)
     aTCAAGACTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                 <  2:746041/128‑1 (MQ=255)
      tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                <  1:794373/128‑1 (MQ=255)
      acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAATATTAATATTAATATAAATTAGCTAAT‑TATATATAATTATATATTAATTTATATATAATTTTAAAATAAttaatttaa                                                                                                                                >  1:1239025/2‑128 (MQ=255)
      acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAT‑TATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                >  1:1260977/2‑128 (MQ=255)
      acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAAttaatttaa                                                                                                                                >  1:973463/2‑128 (MQ=255)
      acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                >  2:485758/2‑128 (MQ=255)
       cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAT‑TAAATAATATAATTTATTATATTATTAATCAAATTAATATAAtaaaattaat                                                                                                                               >  1:1153814/1‑128 (MQ=255)
          gCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaat                                                                                                                               <  2:1590462/125‑1 (MQ=255)
            cTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaaa                                                                                                                          <  1:1506088/128‑1 (MQ=255)
             ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTATATTATTTATCCTTTTAATATAATGAAtaaaattaaaat                                                                                                                         >  1:1972935/1‑128 (MQ=255)
             ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAat                                                                                                                         <  2:449916/128‑1 (MQ=255)
              tttttATATGTAATATCACTTATTATAGTATGAAAAAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAata                                                                                                                        <  1:744193/128‑1 (MQ=255)
               ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAATATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAT‑TATTTATTAGAATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAatat                                                                                                                       >  1:698301/1‑128 (MQ=255)
                tttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATATTAATATAATGAATTTAATTAAAATAtt                                                                                                                      >  1:1550397/1‑128 (MQ=255)
                   aTTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATACTTATAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTt‑‑a                                                                                                                 >  1:566141/1‑128 (MQ=255)
                        tAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTta‑‑aat‑‑‑aaa                                                                                                         >  1:1004070/1‑128 (MQ=255)
                        tAAAATAAATTATTATATTATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAAG‑TATTTATTATGATTGTTTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaa                                                                                                         <  2:1544709/128‑1 (MQ=255)
                         aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑taaa                                                                                                        <  2:1083857/128‑1 (MQ=255)
                         aaaaTAAATTATTATATTATGAAATAATAAATATTAATTTTAAAAAAAAATATCTAAT‑TATTTATTATGATTTATTATTTTATTTATCCATTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaaa                                                                                                        <  2:711333/128‑1 (MQ=255)
                           aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaa                                                                                                      >  2:1479878/1‑128 (MQ=255)
                                   tttttattATTAAAAAATAAATATTAATTTTAATATTAAATATCTATT‑TTTTTTTTATGTTTGTTTATTTTTTTTTACCTTTTAATATTATTAATTTTTTTAAAATTTTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaataa                                                                                              <  1:883643/121‑1 (MQ=255)
                                    ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTTATTAAAat                                                                                                                         <  1:1859903/105‑1 (MQ=255)
                                     tataGTATCAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATATAATTAAAATATTTA‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aa                                                                                           >  1:1937474/1‑128 (MQ=255)
                                      ttattATTAAATAATAAATATTAATTTTAATAAAAATTTACTAAT‑TATTTATTAGGATTTTTAATTTTATTTTTCATTTTAATATAAATAATTTTATTAAAATATTTT‑‑aaa‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaa                                                                                          <  2:1637342/124‑1 (MQ=255)
                                      ataGTATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAAT‑TATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaa                                                                                          <  2:1710673/128‑1 (MQ=255)
                                       tatattttaataatAAAATTTATTTTTAAAATAAATTATATAAT‑TTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAAAAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaaa                                                                                         <  1:514677/120‑1 (MQ=255)
                                        aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaa                                                                                        >  1:1014288/1‑127 (MQ=255)
                                         ttttttaataatTAATATTAATTTTAATTATAATTATCTTAT‑TATTTATTATGATTGTTTAGTTTATTTTTCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAATTTTT‑‑AAT‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaacaa                                                                                       <  2:1024579/122‑4 (MQ=255)
                                         ttatttaataatAAATTTTAATTTTAATATAAATTATATAAA‑TATTTATTATCATTTATTATTTTATATATCCATTTAAAAAAATGAATTAAATTAAAATTTTTA‑‑TAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACa                                                                                       <  2:1454338/122‑1 (MQ=255)
                                           aTGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGTATTTATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaa                                                                                     >  2:1295599/1‑127 (MQ=255)
                                            ttaaaTAATAAATATTATTTTTAATATAAAATATCTAAT‑TATTTATTTTGTTTTTTTATTTTTATTATCCTTTTAATATAAATAAATTTATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGa                                                                                    <  1:1828709/126‑1 (MQ=255)
                                             ttaaaaataaATTTTAATGTTAATATAAATTATCTAAT‑TATTTATTATGATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTTATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGAc                                                                                   <  2:1673270/123‑1 (MQ=255)
                                             gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATATAATTAAAATATTAT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaa                                                                                   >  1:22598/1‑125 (MQ=255)
                                             gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaa                                                                                   >  1:770040/1‑125 (MQ=255)
                                               aataaaAAATTTTAATGTTAATTTAAATTATCTAAT‑TTTTTATTATTATTGTTTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCt                                                                                 <  2:947640/128‑1 (MQ=255)
                                               aataaaAAATATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAT‑TATTTATTAGGATTGAATAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCt                                                                                 <  2:1001425/128‑1 (MQ=255)
                                                ataataAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTAT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaaata                                                                                >  2:790010/1‑122 (MQ=255)
                                                  ataaaaTATTAATGTTAAAATAAAATATCTATT‑TATTTATTTTTATTTATTATTTTATTTAACATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTA‑‑AAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAa‑t                                                                             <  1:929888/125‑1 (MQ=255)
                                                  aataaataTTAATTTTAATATAAATTATCTAAG‑TATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAa‑t                                                                             <  2:1796131/128‑1 (MQ=255)
                                                  aataaataTTAATTTTAAAAAAAATTATTTAAT‑TTTTTATTAGTTTTTATTTTTTTATTTATCATTTTAAAAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAa‑t                                                                             <  2:1014288/128‑1 (MQ=255)
                                                  aataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTATGATTTATAATTATATTTATAATTTTAATATAATAAATATAATTAAAAAATTAT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaataata                                                                              >  2:695662/1‑120 (MQ=255)
                                                   ataaatataaatTTTAAAATAAAATATCTAAT‑TATTTTATATTTTTTTTTATTTTATTTAACATTTTAAAAAAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑‑aaa‑‑‑aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaacaagaccta                                                                             <  2:1362797/128‑10 (MQ=255)
                                                   ataaAGATTATTTTTAATATAAATTTTCTTAG‑TATTTATTTTTATTGATTATTTTAATTATACTTTAAATATAATTAAATAAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAa‑ta                                                                            <  2:916655/128‑1 (MQ=255)
                                                    taaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑Aaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaaacaaaaa                                                                            >  1:1665492/1‑118 (MQ=255)
                                                     aaaGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAcaaaaaata                                                                           >  2:1783635/1‑120 (MQ=255)
                                                          ttAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AATA‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAACTAA‑AATTTTTa                                                                      >  1:1590118/1‑128 (MQ=255)
                                                             aTGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAA‑AAAAACTAA‑AATTTTaaaaaaa                                                                 >  2:173758/1‑127 (MQ=255)
                                                                ttAATAAAAATTAGCTAAGTTTTTTATTGGATTTTATTTGTTT‑TTTATCCTTTTATAAATATTAAATTAATTAAAA‑ATTTT‑‑AAA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAACAAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACaa                                                               <  1:144770/128‑1 (MQ=255)
                                                                 tAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                   <  1:383182/66‑1 (MQ=255)
                                                                 tAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                   >  2:383182/1‑66 (MQ=255)
                                                                   atatTAATTTGCTTAT‑TAGTTGTTAGGTTTGATTTTTTTTTTTTTCATTTTATTTTTATGATTTTTTTTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACaattaa                                                           <  1:474075/128‑1 (MQ=255)
                                                                    tataAATTAGAAAAT‑TATTTATTAGTTTTGTTTATTTTATTTATACTTTTAAAATTATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACaattaa                                                           <  1:1293981/128‑1 (MQ=255)
                                                                      taAATTATCTATG‑TATATATTAGGTTTGTTTAGTTTATTTATCCTTTTAATATATAGAAATTAATTAAAATAATTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACaattaatt                                                         <  2:409602/128‑1 (MQ=255)
                                                                       aaaTTAGCTAAT‑TATTTATTATGATTTATTAGTTTAATTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACAattaatta                                                        <  2:545937/128‑1 (MQ=255)
                                                                         caactcataataatttataTGGTTTGATTTGTTTATTTATAATTTTAATAAAATCAATTTAATTAAAAAATTTA‑‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACAATTAATTAAg                                                      <  1:423255/116‑1 (MQ=255)
                                                                            aGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAA‑AAAACAAAA‑AATTAATAAAAAAAAaaaattaattaat                                                  >  1:313573/1‑123 (MQ=255)
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                                                                                                                     ttAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAA‑AATTTTAAAAAAAAATAAAATAAATATTAATTTATTAAATATAATTTTTTAAAAAAtataaattaat           >  2:230340/1‑121 (MQ=255)
                                                                                                                      tAATATAATTAATTTAAATAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGc          <  1:1809496/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                               |                                                                                                                                     
TGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAG‑TATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAGACCTAA‑TATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAG  >  CP016816/105213‑105465

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑