Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG54.9% 1414.6 / inf 1401intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (115/492);  new base G (583/155);  total (752/649)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1713 total aligned reads displayed.

TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATA‑TTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCG  >  CP016816/105212‑105467
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  gTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaatgaa                                                                                                                                        >  2:4416598/1‑128 (MQ=255)
   attaacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATAAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATATATCATTTTAATAtaataaat                                                                                                                                       >  1:1011803/6‑128 (MQ=255)
    tAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                      <  2:622204/128‑1 (MQ=255)
     taacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTAATTTATTTATCCTTTTAATATAAttaaatt                                                                                                                                     >  2:1707235/4‑128 (MQ=255)
     taacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGATAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAAtgaattt                                                                                                                                     >  1:4410282/4‑128 (MQ=255)
     aaTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATTAAATAATAAATATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATAATTAATTAATTTATATAAACTATAAATAtaattaatat                                                                                                                                     >  2:3689352/1‑126 (MQ=255)
      aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                    <  1:1432278/128‑1 (MQ=255)
      aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                    <  1:85621/128‑1 (MQ=255)
      aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                    <  2:4676425/128‑1 (MQ=255)
       tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                   >  1:4112727/1‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATATTATGAAATAATAAATATTAATGTTAATATAAATAATCTAATTATTAATTATTATTAATTATTATATTTAACCTAtaaatataataaatataa                                                                                                                                   >  2:859794/2‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                   >  2:4998059/2‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTATAATAAAAtgaatttaa                                                                                                                                   >  1:4328021/2‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAACTAATAATAAAATACAATTAATTAGTTTATTAATCATTTTAATATaaataaataaat                                                                                                                                  >  2:3780817/1‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaat                                                                                                                                  <  2:686404/128‑1 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGATAATATAAATTAGCTAAATATTTATAAGAATTTAATAGTTAATTTATCCTTATAATATAAtgaatttaat                                                                                                                                  >  2:3880986/1‑128 (MQ=255)
          aGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCATTTAAATATAAtgaatttaataa                                                                                                                                >  1:2940121/1‑126 (MQ=255)
           gCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaattaa                                                                                                                               <  1:4715860/128‑1 (MQ=255)
           gCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATataattaa                                                                                                                               >  2:2998939/1‑128 (MQ=255)
             cTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTTATTAGTTTATATATCCTTTTAATATAATAAATTTAATAaaaa                                                                                                                             >  2:106617/1‑128 (MQ=255)
              ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAat                                                                                                                            >  2:4298766/1‑128 (MQ=255)
              ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAat                                                                                                                            >  2:4243537/1‑128 (MQ=255)
              ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTATATTTATCCTTTTAATATAATGAATATAATTAAAat                                                                                                                            >  2:408058/1‑128 (MQ=255)
               tttttATTTGTAAAATCACTTATTATATTAAGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAata                                                                                                                           <  1:547650/128‑1 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATGAAATTAATTAAAata‑t                                                                                                                         >  1:4840761/1‑128 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAata‑t                                                                                                                         <  1:3920753/128‑1 (MQ=255)
                 tttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑tt                                                                                                                        >  2:4494204/1‑128 (MQ=255)
                    aTTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTt‑a                                                                                                                    >  2:4175557/1‑128 (MQ=255)
                       tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAATAATAAATAATTTATTTATCATTAAAATATAATAAAAATAATAAAAata‑taataaaa                                                                                                                  >  2:271014/1‑121 (MQ=255)
                       tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTt‑a‑at‑‑a                                                                                                              >  2:2019895/1‑128 (MQ=255)
                          aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAACAAAATATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTAAATAAAAAAA‑TTTa‑a‑aa‑‑aaaa                                                                                                           >  2:2353786/1‑128 (MQ=255)
                            aataaattattaTATTATTAAATAATAAATATTAATTTTAAAAAAAAATATATAATTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaa                                                                                                         <  1:13061/122‑1 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAATAATTTAATAAAAAAA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaa                                                                                                         >  2:2600044/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAat                                                                                                                            >  2:1624258/1‑114 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaa                                                                                                         >  1:4617884/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAATA‑TTAT‑A‑AT‑‑aaaaaa                                                                                                         >  2:2116751/1‑128 (MQ=255)
                             aTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑a‑aa‑‑aaaaaaa                                                                                                        >  1:3604652/1‑128 (MQ=255)
                                   tattatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATATAATTATTAATTAATATTTATTAGATTATTTATAATATTAATATAAATAATTAAATTAAAAAA‑ATTT‑a‑aa‑‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                  >  2:2213227/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                               >  2:3127088/1‑128 (MQ=255)
                                       tttttATTAAATTATAAATTTTAATTTTATAATAAATTATATTATTATTTTTTATGTTTTTTTTTTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                              <  2:568671/124‑1 (MQ=255)
                                        tattATGAAATAATAAATAATAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaac                                                                                             <  2:1166659/125‑2 (MQ=255)
                                         aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TATT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                            >  2:3362831/1‑127 (MQ=255)
                                          ttttGAAATAAAAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                           <  1:3357002/125‑4 (MQ=255)
                                           tATTAAATAATAAATATTAATTTTAAAATAAATTATCTAATTATTTATTATTTTTGAATACTTTATTTATCCTTTAAATAAAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACa‑a                                                                                         <  1:3082673/128‑1 (MQ=255)
                                             ttaaaTAAAAAATATTAATGTTAATAAAAAATAGCTTATTTTTTATTATGATTGTTTATTTTTATTAACATTTTAAAAAAAATCATTTAATTAAAATA‑ATTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaacaagacc                                                                                        <  1:479311/126‑8 (MQ=255)
                                                aataatAAATATTAATTTTAAATAAAATTAGATTATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTTTAATTTTAATTAAATTAATTTTATTAAAAAA‑TTTT‑A‑AT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaagac                                                                                     <  2:4819616/128‑9 (MQ=255)
                                                aataatAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaa                                                                                    >  2:3566909/1‑123 (MQ=255)
                                                 ataataAAGATAAAAGTTAATATAAATTAGCAAATTATTTATTATAATTTATAATTTTATTTATCATTTTAATATAAAAAATTTAAATAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaa                                                                                   >  2:3218479/1‑122 (MQ=255)
                                                  taataaATTTTAATGTTAATATAAATTTTCTAATTATTTTTTTGTTTTTATTTTTTTTTTTATAATTTTAATTTAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAat                                                                                 <  2:1490233/128‑1 (MQ=255)
                                                  taaataataTTAATGTTAATATAAAATTGCTAATTTTTTATTATGATTTTTTATTTTTTTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTaa                                                                                  <  2:1824365/120‑1 (MQ=255)
                                                  atataaATATTAATTTTAATAATAAATATATAATTATTTATTATTATTTATAATTTTATTTAAACTTTTAATAAAATAAATTAAATTAAAA‑A‑ATTT‑A‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAat                                                                                 <  1:1678889/126‑1 (MQ=255)
                                                    aataatatttatttTAAAATAAATTATTAAATTTTTTTTTATTTTTTATTATTTTAATTTACCTTTTAAAATAATTAATTTAAATAAAAAA‑TTTTAA‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAat                                                                                 <  1:5186276/122‑1 (MQ=255)
                                                     taaATATTAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAatat                                                                               <  1:952471/128‑1 (MQ=255)
                                                            tAATTTTAAAATAAAATATCTAATTATTTTATATGATTTATTAATTTATTTATACATTTAATATAATTAAATTAATTAAAAAA‑TTTTAA‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTaa                                                                         <  1:3759532/128‑1 (MQ=255)
                                                               ttttAATATAAATTAGATAAGTTTTTATTATGTTTTTTTATTTTATTTAACCTTTAAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAAc                                                                     <  2:2792235/126‑1 (MQ=255)
                                                                gTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAATAATATTGTTaaaaaaa                                                                    >  1:4244925/1‑126 (MQ=255)
                                                                  tAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAACAAAATATTATTAAAAAAaat                                                                  >  2:2900601/1‑128 (MQ=255)
                                                                  tAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACA‑ATACAAAATATTATTAAAAAAaata                                                                 >  1:4156401/1‑127 (MQ=255)
                                                                    atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAACAAAATATTTTAaaaaaaaaaaa                                                                >  2:249899/1‑125 (MQ=255)
                                                                     tataAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AGACCAAATTTTATTAAAAACaaataa                                                               >  2:5342541/1‑128 (MQ=255)
                                                                       taAATTTGATAATTTTTTATTTTGTTTTTTTATTTTATTTATACTTTTATATTAATTTATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAACaattaatt                                                             <  1:1103240/128‑1 (MQ=255)
                                                                       taAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑ATA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAACATAATATTTTTAAAAACatttata                                                              >  2:5127740/1‑126 (MQ=255)
                                                                         aatatgaaaattatttattAGTCTTTATTTTTTTATTTTTAATTTTATTATAATTTATTTAATTAAAATATTTTT‑A‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                            <  1:561156/117‑1 (MQ=255)
                                                                           ttttgaaattatttattATGATTTTTTATTTTATTTATAATTTTAAATAAATTAATTTAATTAAAATT‑TTTT‑A‑ATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAACAAttaattaa                                                           <  2:1278016/119‑1 (MQ=255)
                                                                             aGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑AAACCAAATATTTTTAAAAAAAAttaaataaaaatt                                                      >  2:5286227/1‑123 (MQ=255)
                                                                                   gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AACCCAAATATTTTTAAAAACAATTAATTAATT‑CTTGATtta                                               >  2:4928084/1‑128 (MQ=255)
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                                                                                                                      tAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAATTTTTTAAAAAAAAATAAAATAATA‑ATTTA‑TTATTAAAAATTTATTTTTTAAAAAAttaaaatttata            >  2:1933090/1‑118 (MQ=255)
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                                                                                                                           taatgaatTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAATTTTTAAAAAAAAATAAATAAATAATTGATTAATAAAAAA‑TTATTTTTTAAAAAAATTACAttatctaaa         >  2:5420513/1‑121 (MQ=255)
                                                                                                                               |                                                                                                                                        
TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑A‑AT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACA‑AGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATA‑TTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCG  >  CP016816/105212‑105467

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑