New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP016816 105365 =1161 (0.630)166 (0.100) 91/220 21.7 14.1% intergenic (+860/+66) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
?CP016816 = 105361 992 (0.610)intergenic (+856/+70) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 1259 total aligned reads displayed.

TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488
                                                                                                                                |                                                                                                                                
 tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAATTATTTATTAGAATTTATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTAAATAAAAATATTTaaat‑a                                                                                                                                >  2:2178882/1‑128 (MQ=255)
    aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAAAATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTaaaa‑aaaa                                                                                                                             >  2:1264639/1‑128 (MQ=255)
      aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGAATGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaa                                                                                                                           >  2:2773684/1‑128 (MQ=255)
      aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATAAATTTAATTAAAAAAATTAAAT‑aaaaaa                                                                                                                           >  2:1539804/1‑128 (MQ=255)
      aaTAACTTATTATAGTATTAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAaa‑aaaaaa                                                                                                                           <  2:3465218/128‑1 (MQ=255)
         aaattattaTAGTATGAAATAATAAATATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaa                                                                                                                        <  1:2925115/125‑1 (MQ=255)
            ttattaTAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaa                                                                                                                     >  1:3777983/1‑128 (MQ=255)
                tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTTTTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaatatcgg                                                                                                                 >  1:3680844/1‑122 (MQ=255)
                tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATAAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTAAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                 >  1:2138382/1‑128 (MQ=255)
                  tattATGAAATAATAAATATTAATGTTAATATAAATTATTTAATTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aacaaaaaaaaaaaaaac                                                                                                               <  1:3722378/125‑2 (MQ=255)
                   attATTAAATAATAAATATTAATTTAAAAATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATAC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                              <  1:2838715/126‑4 (MQ=255)
                   aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATAAATATAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                              >  2:1338272/1‑127 (MQ=255)
                       ttaaaTAATAAACTTTAATTTTAATAAAAATTATCTAATTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAc                                                                                                         <  1:1903080/126‑1 (MQ=255)
                       tGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaa                                                                                                          >  2:3147393/1‑121 (MQ=255)
                        taaaTAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGTTTTTTTATTTTATTTATCA‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                       <  1:35787/127‑1 (MQ=255)
                        gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaa                                                                                                         >  2:859665/1‑122 (MQ=255)
                         aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaa                                                                                                        >  2:3247916/1‑124 (MQ=255)
                         aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                        >  2:63466/1‑124 (MQ=255)
                           ataataAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAACC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaaat                                                                                                      >  2:755950/1‑122 (MQ=255)
                               aaaaTATTAATTTTAATAAAAATTAGATAATTATTTATTAGTTATTATTATTTTATTTATAC‑TTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGt                                                                                               <  2:3647606/127‑1 (MQ=255)
                                 aaGCTTAATATAAAAATAAATTACCTATTTATTTAATAGGTTATATTAGTTTAATTATCC‑TTTTAAAATCATCAATTTATATAAAAAATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGt                                                                                               <  2:3428851/128‑1 (MQ=255)
                                   gATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAATACATAATATTTTTa                                                                                             >  2:3376550/1‑128 (MQ=255)
                                          tatAAAATAAATAAGCAAAGTATTTATTAGGATTCAACAGTTTATTTATCC‑ATTTAAAAAAATTAATTTAAATAAAAAATTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACa                                                                                       <  1:735251/126‑1 (MQ=255)
                                            tAATATAAATTAGGTACGTATTTATTTTGATTGTTTTTGTTATTTTTGA‑TTTTATTATAATTATTTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaatt                                                                                    <  2:1018218/128‑1 (MQ=255)
                                            tAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAAAATATTTTTAAAAAAaata                                                                                    >  1:3464925/1‑127 (MQ=255)
                                              atatAAATTATCTAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATAC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaat                                                                                 <  1:1610967/128‑1 (MQ=255)
                                              atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAACCCAAAAAATTTTAAAAACaataaa                                                                                  >  2:3759870/1‑128 (MQ=255)
                                               tataAATTATCTAAGTTTTTTTTAGGATTGATTAGTTTATTTATAC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaatt                                                                                <  2:462039/128‑1 (MQ=255)
                                               tataAATTAGCTTAGTATTTATTAGTATTTATTATTTTTTTTATCA‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaat                                                                                 <  2:3308130/128‑1 (MQ=255)
                                                ataAATTATTTAATTTTTTTTTTGTATTTATTATTTAATTTATAA‑TTTAAATATAATTAATATAATTAAAAT‑TTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaatt                                                                                <  1:849685/128‑1 (MQ=255)
                                                    tttatttatttttttattTGTATTGTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTAATA‑AATTAATTTTTTTAAAATTTTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                                            <  2:515497/116‑1 (MQ=255)
                                                    attattttaGTTTTTATTAGTATTTTTTTTTTTATTTTTAA‑TTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAg                                                                             <  2:3982536/120‑1 (MQ=255)
                                                    aTTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                                            <  1:3633745/128‑1 (MQ=255)
                                                       aGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAA‑‑TAATATTTTTAAAAAAAAtaaataaaaaattaa                                                                       >  1:1551302/1‑121 (MQ=255)
                                                        tcaaattatttattTTGATTGATTTTTTTATTTAAAC‑TTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTg                                                                        <  2:945750/122‑1 (MQ=255)
                                                        gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑ACATAATTTTTTTAAAAAAAAtaaataaataattaa                                                                       >  2:1380908/1‑121 (MQ=255)
                                                         cTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAATAAAATTTTTAAAAAAAAttaattaattaatta                                                                       >  1:3927294/1‑121 (MQ=255)
                                                           atttatttattATGATTGATTTTTTTTTTTTATC‑TTTTAATATAATTATATTAATTAAAATTTTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGa                                                                       <  1:1785186/125‑1 (MQ=255)
                                                             ttatttattTGGAATGATTAGTTTAATTATCC‑TTTTAATATAATGATTTTAATTAAAATATATTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttat                                                                  <  2:2947860/127‑1 (MQ=255)
                                                             gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAAtaaataaaataataaatat                                                                   >  2:1852320/1‑117 (MQ=255)
                                                             ctaattattaTGATTTTTTATTATATTTAATA‑TTTTAATATAATGTATTTAATTTAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATtta                                                                   <  1:2607932/124‑1 (MQ=255)
                                                              tatttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATAATATTTTTAAAAAAAATTAAATAAttatttatttat                                                                  >  2:1681624/1‑128 (MQ=255)
                                                               ttttattAGGAATTTTTAGTTTATTTATCA‑TTTTAATAAAAATCAATTAAATAAAATTATTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttatt                                                                 <  1:2256799/127‑1 (MQ=255)
                                                                tttattAGTATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTaa                                                               <  1:3052144/128‑1 (MQ=255)
                                                                     taGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTATAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAGAACTATTATTGTTAAAAAAAATAAATAATTTCTTTATTTA‑TAAAtatt                                                          >  2:2019749/1‑128 (MQ=255)
                                                                       ttattgattATTTTATTTATAC‑TTTTAAAATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAAtatta                                                         <  1:2412409/126‑1 (MQ=255)
                                                                        gattttttATTTGATTTATAC‑TTTTAATATTATTATTTTAATTAAAATTTTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAAtattat                                                        <  2:1929974/122‑1 (MQ=255)
                                                                         attgattAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTAATATCTTaaaagattc                                                        >  2:3101365/1‑122 (MQ=255)
                                                                         attgattAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAATAATATTTTTAAAAAAAATTAATAAATAATTTATATATTAAATattatt                                                       >  1:1228588/1‑128 (MQ=255)
                                                                          ttgtttAGTTTATTTATTT‑TTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTTAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTAttt                                                      <  1:3091259/128‑1 (MQ=255)
                                                                           tgattAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATACAAAAAATTTTTAAAAAAAATAAATTAATAATTTATTTATAAAATATTAtttt                                                     >  1:444769/1‑128 (MQ=255)
                                                                           tgattAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAATATTGTTAAAAAAAATTAATTAATTCTTTATTTATTAAATATTAttttt                                                    >  2:3052144/1‑128 (MQ=255)
                                                                              tttttttattttACC‑TTTTAATATAATTAATTAAATTAAAATATTTTA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTaa                                                 <  2:3339531/124‑1 (MQ=255)
                                                                                 ttttatttaTCA‑ATTTTATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACa                                               <  2:3590091/127‑1 (MQ=255)
                                                                                 gTTAATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACaa                                              <  1:1006804/128‑1 (MQ=255)
                                                                                  tttatttaTCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAATTTATAAAAAAAAATAATTAATAAATTATATATAAAAAATTAATTTTTAaaaa                                              >  2:2502855/1‑128 (MQ=255)
                                                                                      tttatCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTGATTTATTAAATATTTTTTTTTAAAAAAttt                                          >  2:2643312/1‑128 (MQ=255)
                                                                                       ttatCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAATATTTTTAAAAAAAATAAATAAATAATTAATTTATAAAAAATAATTTTTAAAAAAATTTa                                         >  1:528233/1‑128 (MQ=255)
                                                                                        tatCC‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTAAATATTTATTTATAAAATATTATTTTTTAAAAAATTTAc                                        >  1:3517351/1‑128 (MQ=255)
                                                                                         atCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                      <  1:3147393/128‑1 (MQ=255)
                                                                                           cc‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATATTTTTATAAAAAATTAATTAATTATATATTTATAAAATTTTATTTTTTTAAAAATTTaaa                                       >  1:3229231/1‑126 (MQ=255)
                                                                                           cc‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAAAATATTTTTAAAAAAAATAAATTAATTAATAAATTAAAAAATATAATATTTTaaaaaaataacatt                                     >  1:2667721/1‑120 (MQ=255)
                                                                                           cc‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑CCATAATATTTTTAAAAACAATTAATTAAATATATATTTATTAAAAATTAATATTAAAAAAAATTaaaaaa                                    >  2:1772337/1‑123 (MQ=255)
                                                                                           aaattttAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                      <  1:1847900/125‑1 (MQ=255)
                                                                                            cattttAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTg                                    <  1:401947/126‑1 (MQ=255)
                                                                                            c‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGa                                   <  1:3370858/128‑1 (MQ=255)
                                                                                            c‑TTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAATAAAATTTTTAAAAAAAAAAAATTAATAATTAATTTAAAAAATATTATTTTTTAAAAAATTTaaatta                                    >  1:2349268/1‑123 (MQ=255)
                                                                                               tttAAAATAATTAATTTAATTAAAA‑ATTTTTA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGc                                 <  1:3284013/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                               taattaaAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcc                  <  1:2775144/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                 attaaAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAATACATAATATTTTTAAAAACAATTAATTAAGTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTTAACTTTAGATAAATTAGCGTTtcatcc               >  1:3171922/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                  ttaaAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAAATTAAATTTAGCAAAATTaaatttaacac                >  2:1088564/1‑118 (MQ=255)
                                                                                                                    aaaaTA‑TTTAAT‑AAAAAAAAATAAATAAAACAAGACCTTATATTGTTTAAAACAATTAATTAAGTCTTGTTTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTGAGCTAAATTAGAGTTTCATCCAc             <  1:2029063/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                      aaTATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAACACCTAATATTGTTAAAAAAAATTAATTAATTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTAACATTGAGCTAATTTAGCGTTTCATCCACCt           >  1:1978380/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                      aaTATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATTTTTTTAAAAAAAATTAATTAATAATTAATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTAAGATAAATTAGAGttacagcccaatt          >  2:3188061/1‑117 (MQ=255)
                                                                                                                        tatTTTAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCtt          <  1:2295612/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           tttAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACCTAATATTTTTAAAAACAATTAATTAATTATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTTATCTAAATTAGCGTTTCCTCCACATTTatt      >  2:2336887/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                           tttAAA‑TAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAg       <  1:1063766/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            ttAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGtc     <  1:3867416/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               at‑aaAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAAGTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTAACCTTGAGATAAATTAGCGTTACATCCACCTTTATtctc   >  2:3934591/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                                |                                                                                                                                
TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCC‑TTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.