Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,435 | 0 | C | T | 41.5% | 78.2 / 34.3 | 65 | intergenic (‑179/‑28) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/34); new base T (27/0); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAA > NC_000913/3206287‑3206583 | gtgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCa < 1:199191/151‑1 (MQ=255) gtgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCa < 1:915192/151‑1 (MQ=255) tCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACaaa < 2:75075/150‑1 (MQ=255) gCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCACACaaa > 2:839085/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCCGACAAATaaa > 1:511542/1‑148 (MQ=255) aaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGAAAAATaaaa > 2:934174/1‑150 (MQ=255) aCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAAACAAATaaaaaa > 2:579548/1‑150 (MQ=255) ttGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACaaaaaa > 1:634457/1‑148 (MQ=255) gCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCCGACAAATAAAAAAAATgg > 2:667057/1‑150 (MQ=255) gCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGa < 2:346120/151‑1 (MQ=255) gCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGa < 1:525273/151‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAAAGGAggt > 1:226007/1‑149 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGtt < 1:717909/151‑1 (MQ=255) gCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCatg < 1:896137/150‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCA‑AAAAATAAAAAAAAAGGAGGTg > 1:215480/1‑139 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:429756/151‑1 (MQ=255) gcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGCGa > 1:106609/1‑150 (MQ=255) gcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGaa < 1:881374/151‑1 (MQ=255) cAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAATGGAGGTGGCATGATGAGCGaa > 1:602121/1‑150 (MQ=255) cAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGaaa < 1:487549/151‑1 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGt < 1:213361/151‑1 (MQ=255) attcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 1:955625/150‑1 (MQ=255) ttcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGTTGCCCTGATGAGCGAAAAtaataa > 1:7614/1‑149 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AAATTTTTCAAAAAAATAAAAAAAATTGGGTTGGCATGATGAGGGGAAAAAATAAACaa > 2:790695/1‑149 (MQ=255) aTTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACa < 1:596683/150‑1 (MQ=255) ttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATTGAGTTGGCCTGATGAGCGGAAGAAAAAAATAACaa > 2:965001/1‑147 (MQ=255) ttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGG‑AATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGTTTCCATGATGAGCGGAAGTAATAAACaaaa > 2:520712/1‑145 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGaa < 1:528286/151‑1 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGa < 1:425268/150‑1 (MQ=255) gATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATa < 2:789059/150‑1 (MQ=255) gATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGAG‑AATTTTTTCAGAAAAAAAAAAAAAATGGAGTTGGCATGATGAGCGGAAGTAATAAGAAACaagaag > 2:882666/1‑139 (MQ=255) cACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGtt < 2:214103/150‑1 (MQ=255) aCGAACTGTTAATTACATATTAACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AAATTTTTTAGAAAAAAAAAAAAAATGGAGTTGGGATGATGAGGGAAAGTAATAAAAAAAAAGAAGGGAATAAGtt > 2:291219/1‑149 (MQ=255) aCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACaga < 2:14452/151‑1 (MQ=255) aCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACaga < 2:427883/151‑1 (MQ=255) cATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTa < 2:778040/151‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAAACAAATACAAAAAATGGAGTTGTCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAAAAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGAATGTCGc > 2:518026/1‑148 (MQ=255) cACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAACAACAGGCAGTGAATAAATTGACAGAGATTTTCGCTAACttt > 1:577988/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTAc < 2:675521/151‑1 (MQ=255) aaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATg < 1:565280/150‑1 (MQ=255) aaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCCGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGGAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGAATGTCGCTAACTTTACCGCCATGAt > 1:339903/1‑150 (MQ=255) aaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGAttt < 2:250409/151‑1 (MQ=255) tataAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGTAATAAACAAAAAGCAGGGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGAttttt > 1:272692/1‑148 (MQ=255) ataAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCACACAAATACAAAAAATTGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGAAATAAAAAAAAAGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCCCCATGAttttt > 2:643910/1‑147 (MQ=255) aaaCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑TAATTTTTCAGACCAAAAAAAAAAATGGGGTTGCCGTGATGAGCGGAAAAAATAAAAAACAGGAAATGAAAAAGGTGAAAGAGAATGGTGCTAAATTTAACGGCCTGCATTTTAccc > 2:623358/1‑150 (MQ=255) aaaCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑GATTTTTTCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGTCATGATGAGGGGAAGTAAAAAACAACAAGCAGGGGATAAGATGACAGAGAATGTTGCTAACTTTTCCGCCATGATTTTTAacc > 2:865619/1‑150 (MQ=255) aaCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑TATTTTTTCACACAAATAAAAAAAATGGGGTTGGCCTGGTGAGGGGAAGTAAAAAAAAACAAGGAGTGAAAAAAGTTAAAGAGAATGTCGGTAAATTTAACGCCCAGATTTTTTccc > 2:525665/1‑149 (MQ=255) ccACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:629981/150‑1 (MQ=255) aTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAAAAAAAAACAAAAAATGGAGGTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAGGCAGAGGATAAATTGACAGAGAATTTTGCTAACTTTACCCCCATGATTTTTACCCGCATGcc > 1:506126/1‑150 (MQ=255) ttttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtg < 2:21551/150‑1 (MQ=255) ttttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGCG‑AATTTTTCCCGACAAATACCAAAACTGGAGTTGCCCTGGTGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAATGAATAAATTTACAGAGATTTTCGCTAACTTTACCCCCCCGATTTTTAcccccaagcc > 2:667858/1‑141 (MQ=255) tttAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGG‑AATTTTTCC‑GAAAAATACAAAAAATTGGGTTGGCCTGGTGAGCGGAAGTAATAAACAAAAAGCAGAGAATAAAATTACAGAGATTTTTGCTAACTTTTCCCCCATGATTTTTACCCCAAAGcc > 2:365004/1‑147 (MQ=255) ttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAACTGGAGGTGGCATGGTGAGCGAAAGTAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTTACGCCATGATTTTTTCCCGaa > 2:757511/1‑142 (MQ=255) gTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGCGGAAGTAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACg > 1:771005/1‑151 (MQ=255) ggTTGTTGGTGGC‑GGTA‑ATTTTTTCCATACAATTGCAAAAACAGGGGTGGCCAGGTTAAGTGAATTTATAAATCAAGAGGCAGGGAATGGGTTGGCAGCGTTTCTCCCTAATTTTGCCGCCATGATTTCTGCCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:970814/151‑1 (MQ=255) tttGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTTAATAAGTTGACAGAGATGGTCGCTATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGtggtgg < 2:361266/150‑1 (MQ=255) tttGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGtggtgg < 1:78218/150‑1 (MQ=255) ttGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:428292/150‑1 (MQ=255) gtgGC‑GGTG‑AATTTTTTCCGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCCTGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATa > 2:75121/1‑150 (MQ=255) gtgGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGAt < 1:752760/149‑1 (MQ=255) gtgGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATa < 1:742007/150‑1 (MQ=255) gC‑GGTG‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACt < 2:235789/151‑1 (MQ=255) ggTG‑AATTTTCCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaa < 2:636712/151‑1 (MQ=255) gTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaa > 2:851590/1‑150 (MQ=255) aaTTTTCCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTGGCAATGATGAGCGAAAGTAATAACCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACa < 1:875491/151‑1 (MQ=255) ccAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTaa < 1:732231/149‑1 (MQ=255) | GTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAA > NC_000913/3206287‑3206583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |