Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,674,448 | C→A | P179Q (CCG→CAG) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,674,448 | 0 | C | A | 98.6% | 290.2 / NA | 71 | P179Q (CCG→CAG) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (34/36); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCTTTTGTCTGGGGATT > NC_000913/1674302‑1674595 | gAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGtt > 1:657137/1‑151 (MQ=255) aaCGCGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTg > 2:496780/1‑151 (MQ=255) aaCGCGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTg > 2:253643/1‑151 (MQ=255) cgcgGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGaa < 1:61376/151‑1 (MQ=255) gcggcgATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAg < 1:632151/151‑1 (MQ=255) tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATggc > 2:826331/1‑151 (MQ=255) gACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATggcg < 1:433195/151‑1 (MQ=255) gACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATggc < 2:138713/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATggcggc < 1:199038/151‑1 (MQ=255) gTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGgcggcg < 2:382620/151‑1 (MQ=255) gTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGgcggcg > 2:589635/1‑151 (MQ=255) ccAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAAc < 1:24821/150‑1 (MQ=255) ccAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACg > 1:637766/1‑151 (MQ=255) tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg > 2:838340/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAc > 2:965367/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAc > 1:197037/1‑149 (MQ=255) gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgt > 2:792096/1‑151 (MQ=255) cAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgtg < 2:375141/151‑1 (MQ=255) aGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgtgt > 2:776405/1‑151 (MQ=255) ttATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGttt > 2:27840/1‑151 (MQ=255) ttATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGttt > 1:167268/1‑151 (MQ=255) tATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTtc > 1:291025/1‑151 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTtct < 2:416005/147‑1 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTtct < 2:249388/147‑1 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCAtt > 2:111982/1‑151 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCAtt < 1:1009617/151‑1 (MQ=255) aTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTa < 1:750155/151‑1 (MQ=255) aTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTa < 2:171914/151‑1 (MQ=255) gCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATc > 1:263576/1‑151 (MQ=255) ccATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCt < 1:240763/151‑1 (MQ=255) cATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTg < 2:897252/151‑1 (MQ=255) cATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTg < 1:125956/151‑1 (MQ=255) cATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTg < 2:105073/151‑1 (MQ=255) cATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTg > 1:71458/1‑151 (MQ=255) aaTATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGaaa < 2:418196/151‑1 (MQ=255) aaTATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGaa > 1:650928/1‑150 (MQ=255) tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAAc > 1:161358/1‑151 (MQ=255) ttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGcc < 1:347787/150‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCAt < 2:916175/150‑1 (MQ=255) tgctgcTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATc > 2:534676/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCa < 1:703588/150‑1 (MQ=255) ctgACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGcatc > 2:297725/1‑150 (MQ=255) gACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGcatcat < 2:105507/150‑1 (MQ=255) gACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGcatca < 1:221488/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCg < 1:914430/151‑1 (MQ=255) cTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGcc > 1:761006/1‑151 (MQ=255) gTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCt < 1:801477/150‑1 (MQ=255) acGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTTAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGc < 1:290296/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGc < 2:71454/150‑1 (MQ=255) aGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATg > 1:603870/1‑151 (MQ=255) gCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCt < 1:709721/150‑1 (MQ=255) ccACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTcg < 2:979109/151‑1 (MQ=255) ccACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTcg > 2:936444/1‑151 (MQ=255) aaTTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTcgccgc > 2:714483/1‑151 (MQ=255) gCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCCCCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACt < 1:284605/150‑1 (MQ=255) ccGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCg > 2:688133/1‑150 (MQ=255) ggAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATg > 2:513038/1‑151 (MQ=255) ggAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATg > 2:665582/1‑151 (MQ=255) aaaaTTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGtt > 2:542793/1‑151 (MQ=255) aaaTTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGttc > 2:554022/1‑151 (MQ=255) aaaTTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGttc > 1:417392/1‑151 (MQ=255) aaTTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGttcg > 2:994101/1‑151 (MQ=255) tttCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGttcgct > 1:462458/1‑151 (MQ=255) cAGCACATGGTGGCGCGTCCGGGTGCCGGGATGGCGGCGATTCAAAGAGCGATTGACAGAGTTTCTCCTTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGCTGCTCGCCGCACTCGTTGttcgcttcg > 2:299018/1‑151 (MQ=255) cAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGttcgcttc < 2:637715/150‑1 (MQ=255) gCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTtcgcttcgct < 1:931634/151‑1 (MQ=255) aaaTGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCttt < 1:8068/151‑1 (MQ=255) aaaTGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCttt < 1:858468/151‑1 (MQ=255) atgGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCTTTTGTCt < 1:808944/151‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCTTTTGTCTgggg > 2:857184/1‑151 (MQ=255) gTCAGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCTTTTGTCTGGGGAtt < 1:746492/151‑1 (MQ=255) | GAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTCTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGATGCTCGCCGCACTCGATGTTCGCTTCGCTTTTGTCTGGGGATT > NC_000913/1674302‑1674595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |