| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 987,494 | 0 | T | G | 48.5% | 100.0 / 19.0 | 66 | intergenic (‑512/+91) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/32); new base G (31/1); total (33/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGT > NC_000913/987350‑987637 | tCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCaa < 1:25513/150‑1 (MQ=255)tCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGTaa > 2:110560/1‑150 (MQ=255) cAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGaaa > 2:65738/1‑150 (MQ=255) aGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATa < 1:321586/151‑1 (MQ=255) aGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTggta > 1:46529/1‑145 (MQ=255) aGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATAAATTGCtt > 2:878695/1‑151 (MQ=255) gAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTg < 1:421525/151‑1 (MQ=255) gCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACtt < 1:822053/151‑1 (MQ=255) gCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACt < 1:368285/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaac < 2:372837/151‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaacaa < 2:773206/151‑1 (MQ=255) aaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGTAAAAAAATTTCTTTACTTtacaa > 1:449880/1‑150 (MQ=255) aaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAAATTTTTTGACTTtaaaaa > 2:400196/1‑150 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATa < 2:592915/150‑1 (MQ=255) ggAAAAGGGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAAc < 1:56706/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAAATTTTTTTAATTTAAAAACAAATAAAtt > 1:458091/1‑151 (MQ=255) aaaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAAATTGCTTGACTTaaaaaaaaaaaaaatt > 2:346536/1‑141 (MQ=255) gCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGaaa < 1:465429/151‑1 (MQ=255) gCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGaaa < 1:864491/151‑1 (MQ=255) gCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAAATGTTTTTCTTAACAAAAAAATAAAATGACAGaa > 1:48937/1‑150 (MQ=255) cTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCCAAAAGATTGCTTGACTTTAAAAAAAGATAAATTTACAGaaa > 2:60333/1‑150 (MQ=255) aTTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGa < 1:677271/151‑1 (MQ=255) aTTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTGTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATGGATTGCTGGACTTAACAAACAGAGGTCTTGACAGAAAAg < 1:270760/150‑1 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaa < 1:985120/150‑1 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaa < 1:715132/149‑1 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaa < 2:41612/149‑1 (MQ=255) aaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag < 2:46535/151‑1 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGc < 1:747142/151‑1 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGc < 1:40374/151‑1 (MQ=255) aaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGcc < 1:925073/151‑1 (MQ=255) aaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGcc < 2:235685/151‑1 (MQ=255) aaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGGGGTCATAGATTGCTTTAATTTAAAAAAAAAAAAATTCGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGcc > 2:658005/1‑151 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa < 1:268566/151‑1 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTTGAAAAAAATTGCTTGACTTTAAAAAAAAAAAAATTTACAGAAAAAATaaaaaaaaaaac > 2:561979/1‑145 (MQ=255) aaTCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCgg < 1:461665/151‑1 (MQ=255) aTCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGTAAAAAAATTTCTTGTCTTTACAAAAAAAAAAATTTAAAGaaaaaaaaaaaaaaaaagcagaggg > 1:30563/1‑140 (MQ=255) gCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCt < 2:421267/151‑1 (MQ=255) cAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAGATTGCTTTACTTAAAAAACAAATAAATTGAAAGAAAAAATAAAAAAAAAACCAGCGGgcgccg > 2:981811/1‑149 (MQ=255) aGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTTGAAAAAAAATGTTTTACTTAAAAAAAAAAAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGCGGGGGCCGGctc > 1:923280/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAAAATTGTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAATTGTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGGGCGCTGGctct > 1:841309/1‑149 (MQ=255) gCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATAAATTGCTTTACTTAACAAAAAGATAAATTGACAGAAAAGAAAAAAAAAAAACCAGCGGGGGCCGGCTCtt > 2:691460/1‑147 (MQ=255) gCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATAAAATTCTTTACTTTACAAAAAAAAAAAATGACAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGCGGGGGCCGGCGCtt > 1:483298/1‑147 (MQ=255) ggATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAATAGATTGTTTTGCTTTACAAAAAAATAAATTGACAGAAAAAATAAAAAAAAAGCCAGCGGGGGCGGGGTCTTGAAGa > 2:814043/1‑150 (MQ=255) tAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCt < 2:510734/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGTAAAAAAATTTTTTTACTTTAAAAAAAAAAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGCGCTGGGGCTTGTAGACGCCaa > 1:931394/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGTCAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAAt < 2:844119/150‑1 (MQ=255) ttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAACAGAGTGGTTTTCTTCAAAAACAAAAAACATTTCAGAAAAGATAAAAAAAAAAACAGAGGGCGGCGGGCCTTGTAGACGCCaaa > 2:933294/1‑149 (MQ=255) ttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAGAATGTTTTTATTTAAAAAAAGATAAAATTTCAGGAAAAAAAAAAAAAAAGGCAACGGGGGCCGGCGCCTTAAGaagacaaaat > 1:349064/1‑142 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGaa < 1:878595/151‑1 (MQ=255) cgcgTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATAGAATTCTTTACTTAACAAAAAAATAAATTGACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGCGCCGGGTCCTGAAGACGACAAATTa > 2:275837/1‑147 (MQ=255) gcgTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGc < 2:209407/151‑1 (MQ=255) cgTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAAAAAATTGTTTTTATTAAAAAAAAAATAAATTGATAGAAAAAATAAAAAAAAAAACAGCGGGCGGCGGCTCTTGAAGAAGCtaaaataaaaaat > 1:797961/1‑148 (MQ=255) gTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCCAAATTAGAAGCTg < 1:732957/151‑1 (MQ=255) gTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAATTTTTTTAATTTAAAAAAAAAAAAATTTAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACAACGGGCGCCGGGTCTTTGAGAAGCCAAAATaaaa > 1:555547/1‑147 (MQ=255) gCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAATTGCTTGAATTAAAAAAAAGATAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACGGGGGCTGGCTCTTGAAGAAGCTAAATTAGaaaatgggggttcg > 1:614/1‑138 (MQ=255) aaTGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCgg < 2:339817/151‑1 (MQ=255) aaTGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAGATTTCTTGTCTTAAAAAAAAAATAACTTTACAGAAAAGATAAAAAAAAAACCAACGGGGGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAAAAGCTGGCGTTAcgc > 2:671685/1‑149 (MQ=255) aaTATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTAc < 2:220375/151‑1 (MQ=255) tatTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGCAAAAAAATTG‑TTTTCTTTAAAAAAAAATAAATTGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACGGGGGCCGGCCCCTTTAGACGCTAAAATAAAAACTGGCGGTGCGCCGAgga > 1:600485/1‑146 (MQ=255) ccGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTggg < 1:368356/150‑1 (MQ=255) cGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGGAAATAGAATTCTTTGATTAACAAAAAAATAAATTGACAGAAAAGAAAAAAAAAAAGCCAGCGGGGGCGGGCCCTTGTAGACGCCAAAATAAAAACTGGCGATACGAGGAGTACGgggg > 1:585360/1‑149 (MQ=255) cGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAATTGGTTTACTTTACAAAAAGATAAATTGACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGCGCTGGCTCTTTAAAAAGCTAAATTAAAAAATGGCGGTAAGCGGGGGACGgggg > 1:98931/1‑149 (MQ=255) tAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAAATTATTGTCTTTACAAAAAAAAAAACTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGCGCTGGGTCTTTTAGAGGCCAAATTATAAACAGGCGtttaccggaggac > 2:444816/1‑131 (MQ=255) cAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAAAAATTTCTTGGCTTTACAAAAAAAAAAAATTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAACGGGGGCCGGCTCTTTAAGAAGCCAAAATAAAAGGTGGGGGTACGCGGAGGACGgggggaagg > 2:237315/1‑144 (MQ=255) tATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCacgt < 2:978284/150‑1 (MQ=255) ggC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCacgtacgt > 2:910383/1‑151 (MQ=255) | TCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGT > NC_000913/987350‑987637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |