Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,725,207 | IS1 (+) +9 bp | coding (532‑540/1299 nt) | kgtP ← | alpha‑ketoglutarate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2725215 | 0 (0.000) | 80 (1.020) | 66/298 | 0.3 | 100% | coding (532/1299 nt) | kgtP | alpha‑ketoglutarate transporter |
? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
GCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2725068‑2725215 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG > NC_000913/3583428‑3583577 GCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGT < 1:761843/151‑1 GCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGT < 1:422857/151‑1 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1:1116714/148‑1 CTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 2:67253/1‑149 CTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGAGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:954870/1‑149 tACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:313823/2‑151 GACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:1090468/150‑1 CGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1166164/151‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |