Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 45.6% | 103.0 / 26.2 | 69 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/4); new base C (0/31); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTG > NC_000913/1376360‑1376652 | aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTc > 1:803502/1‑151 (MQ=255) ccgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTc < 1:1103824/150‑1 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGcc < 1:111827/151‑1 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGcc > 1:630463/1‑151 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATg > 2:94854/1‑151 (MQ=255) gACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGcc > 1:1048778/1‑151 (MQ=255) cTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCAATGCccgc > 1:990153/1‑151 (MQ=255) gctggggcGGCGACCGAAAAAGGGTGGATATTTCCCGGTGTTTAAGGAAACAGGCCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTTTATC‑CGAACCATTAAA‑ACCC‑TTTTAGGAATATTTTGAACAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc < 2:750687/142‑1 (MQ=255) ggAGGGCGCCCGAAAAATGGTGAGTTTTCCCCTGCGCTTACGGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCCGAAACGGTGGTGTTTCTCGACCCTTAAAC‑CCCC‑TATCAGG‑ATAATATGATAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaa < 1:841897/151‑1 (MQ=255) aCGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaaa > 2:1130973/1‑150 (MQ=255) cGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAAc > 1:778427/1‑151 (MQ=255) cGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGAt > 2:534256/1‑151 (MQ=255) ccGAAAATTGGGGGGTGATCCCCGGCGCGTACTGGAACGGGCCCCCGCGCGTCCCGAACCCGTGGTTTATCCCGACCCTTAAAC‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATAACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCt < 2:247769/150‑1 (MQ=255) ccGAAAAGTGGTGGGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAGCGGTTCGCCGCGCGTACCGAACCGGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAC‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGACCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGAt < 1:1212083/148‑1 (MQ=255) ccGAAAAAGGGTGAGTGATCCCCTGCGCGTACTGGAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGACCCGTGGTTTATCCCGACCCTTTAAC‑CCCC‑TATCAGG‑ATAATATGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGa < 1:1092273/147‑1 (MQ=255) cagaaaagTGGTGGGTGCTCCCCGGCGCGTCCGGGAACGGGTCGCCGCGCGCCCGGGACCCGTGGTGTACCTC‑AACCCTTAAACCCGC‑TATCAGG‑ATAATAAGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGa < 2:258645/143‑1 (MQ=255) aaaagTGGTGAGTGCTCCCCTGCGCTTCCTGAACCAGGCCCCCGCCCGTACCGAACCCGGGGTTTCCCTC‑AACCCTTAAACCCGC‑TATAAGC‑ATCATAGAATCAACCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaaa < 1:617373/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGGGTGATCCCCTGCGCGTACTGAAACAGGTCGCCGCGCTTACCGAACCCGTGGTTTATCCCGACCCTTTAAC‑CCGC‑TATAAGG‑ATCATATAATCACCCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACAt < 1:118051/151‑1 (MQ=255) ggtggttgttccccGGCGCGTACTTGAACAGGCCCCCGCGCGTCCGGGACCCGTGTTGTACCCCGACCCGTAAAC‑CCGC‑TATAAGA‑ATAATATAACAACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTa < 2:1065507/140‑1 (MQ=255) agtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 2:1010621/1‑148 (MQ=255) agtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 1:1159760/1‑148 (MQ=255) gttatccccTGGGCGTCCTGAAACGGGTCGCGGCGCGTCCCGAACCCGGGGTTTATCCCGACCCTTTAAA‑CCGC‑TACAAGA‑ATCATAGGACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt < 1:821789/145‑1 (MQ=255) ttCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc > 2:74233/1‑151 (MQ=255) ttCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc > 2:57106/1‑151 (MQ=255) cccTGCGCTTACGGAAACGGGTCGCCGCGCGTACCGGACCCGGGGTTTATCTCGACCCTTTAAC‑CCGC‑TATCAGG‑ATAATATAATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCgg < 1:536143/151‑1 (MQ=255) gcgTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAttt > 1:542088/1‑151 (MQ=255) gTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt > 1:136685/1‑151 (MQ=255) cTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc > 1:947244/1‑151 (MQ=255) tGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc > 2:416624/1‑150 (MQ=255) tGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc > 1:1124728/1‑150 (MQ=255) gggaacggtccgccgcGCGTCCGGGACCGGTGGTGTTCCCCGACCGGTTAAC‑CCGC‑TATCAGA‑ATCATATGACAACCCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt < 2:830020/137‑1 (MQ=255) ggAACAGGCCGCCGGGCGTCCGGCACCCGTGGTTTATCCCGACCCGTAAAC‑CCGC‑TATCAGG‑TTAATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATc < 2:934391/149‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGCCGCGCGTCCCGAACCGGTGGTGTACCCCGACCCGTAAAC‑CCGT‑AACCAGG‑ATCATATGAACAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcac < 2:426984/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCGTACCGGAACGGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAC‑CCGC‑TATCAGA‑ATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATc < 1:120246/151‑1 (MQ=255) cgTCCCGGACCCGTGGTGTCTCTCG‑ACCCTTAAA‑CCCCTTATAAGA‑ATAATATAACCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg < 2:432603/145‑1 (MQ=255) cgTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:907413/1‑149 (MQ=255) cgTACCGAACCCGTGGTGTTTCTCGAACCTTAAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATAATATAATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaag < 1:804298/148‑1 (MQ=255) cccGGAACCGTGTTGTATCTCAACCCTTTAAC‑CCGT‑TACCAGG‑ATCATATATCCAACCCCCTCGCCGGTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaagaa < 1:1145615/146‑1 (MQ=255) gaacccgggttgtATCTCCACCCTTTAAC‑CCCC‑TATAAGG‑ATCATAGAATAAACCCCCTCGCCAATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGaagaag < 1:534541/135‑1 (MQ=255) acccGGGGTGTATCTCGACCCTTAAAA‑CCCC‑TATCGGG‑ATCAAATGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTg < 2:998090/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGGTGTACCCCGACCCGTAAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATAAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTg < 1:40956/151‑1 (MQ=255) aCCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg > 1:341465/1‑151 (MQ=255) cGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcg > 2:101831/1‑151 (MQ=255) gtggttTATCTCGAACCGTAAAC‑CCCC‑TATAAGA‑ATAATATGATCACCCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTg < 2:1022698/147‑1 (MQ=255) gtggttTACCCCGAACCTTAAAA‑CCGC‑TATCAGT‑ATAATATGATCAACCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgc < 2:902863/149‑1 (MQ=255) gtggtgTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcgc > 1:1180087/1‑151 (MQ=255) gtggtgATTCCCTAACCGTTAAA‑CCCC‑AATCAGA‑ACAATATAAACACCTCCCTCGCGCCTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcgc < 2:705183/151‑1 (MQ=255) ggtgTATCCCGAACCTTTAAC‑CCGC‑TATAAGG‑ATCATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCa < 1:205398/150‑1 (MQ=255) tgtATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc > 1:709763/1‑151 (MQ=255) tcccaaaCCTTAAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGAACACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc < 2:407296/142‑1 (MQ=255) ctcGACCCTTAAAC‑CCGT‑TATCGGA‑ATCATATAATCAACCCCCCCCCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcg < 2:268959/147‑1 (MQ=255) cccaacccGTTAAC‑CCGC‑TATCAGG‑ATAATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt < 1:349632/143‑1 (MQ=255) aaCCTTAAAA‑CCGC‑TATGGGG‑ATCATATGATCAACACCCCCCCGGACCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCa < 1:597296/148‑1 (MQ=255) aCCCTTAAACCCGC‑TATCAGG‑ATAATATAATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCAt < 2:872440/149‑1 (MQ=255) gTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAc > 1:877833/1‑151 (MQ=255) aaa‑CCGC‑TAAAAGA‑ATCATATGAACAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAcc < 1:781721/149‑1 (MQ=255) acccccc‑TACCAGG‑AACATATAACAACCCCCCTCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgc < 2:419886/145‑1 (MQ=255) aa‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgcg > 2:331075/1‑151 (MQ=255) a‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgcg > 1:752699/1‑150 (MQ=255) cGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 2:475869/1‑151 (MQ=255) cGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 1:815492/1‑151 (MQ=255) cGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc > 2:236962/1‑151 (MQ=255) tCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTc > 1:756260/1‑151 (MQ=255) gg‑ATAATAGAATAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt < 2:1085194/151‑1 (MQ=255) gaataatatGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCg < 2:527774/144‑1 (MQ=255) atatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 1:927432/1‑151 (MQ=255) atatGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgt > 2:937562/1‑151 (MQ=255) atGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAtgtg > 1:485910/1‑150 (MQ=255) aaCACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTg > 2:37113/1‑151 (MQ=255) | ACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACCGTGGTGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGG‑ATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTG > NC_000913/1376360‑1376652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |