| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 17,041 | 0 | G | C | 45.0% | 100.8 / 28.6 | 61 | intergenic (‑81/‑448) | mokC/nhaA | regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/4); new base C (0/27); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.62e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCG > NC_000913/16892‑17179 | aTGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGacagacag < 2:1166962/150‑1 (MQ=255) ttCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGc > 1:670187/1‑151 (MQ=255) tctctTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgccg > 1:340981/1‑151 (MQ=255) ttGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATc > 1:850524/1‑151 (MQ=255) cGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt > 2:1190541/1‑151 (MQ=255) ggTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt > 2:13157/1‑150 (MQ=255) ggTCAGAAAGAGCCCCTCAACATGTGTTCAGCATAGAGGGGGCCGGGGGTGGATGAA‑AAAATACCCCGCGGGTT‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAAGCCCTGAGACAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTa < 2:1093995/151‑1 (MQ=255) tCAGTAAGGGGCACTCTACATGTGTTCAGCATAGAGGAGGCCTCGGGTTGAGGGT‑AAAATATCCCTCGGGGT‑TTTTCTCTTCCTGCCTTTCAGCTAATGCCTGAGACAGCCCCCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt < 1:867876/148‑1 (MQ=255) tCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAc > 1:969033/1‑151 (MQ=255) tCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAc > 2:69687/1‑151 (MQ=255) tAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAt > 1:915521/1‑151 (MQ=255) aagggccACTCTACATGTTTTCAGAATATAGGAGGCCTGGGGTTGAGGGT‑AAAATATCCCCGGGGGT‑TTTTCTCTCCCTGCCTTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTAAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAc < 1:386613/140‑1 (MQ=255) ccctctACTTGTGTTCAGCATATGGGAGGCCTGGGGTTGATGTA‑AAAATTCCCCTGGGGTT‑TTTTCTCTCTCTCCCTTTCAGTTAATCCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtttt < 2:215110/145‑1 (MQ=255) ccctctACTTGTGTCCAGCAAATGGGAGGCCTGGGGTTG‑TGGTAAAAATACCACTCGGGGT‑TTTTCTCTACCCGCCGTTCATTAAATGCCTGACAAAGCCACCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGtt < 2:199233/148‑1 (MQ=255) aCTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGtttt > 2:533080/1‑151 (MQ=255) ctctACATTTTTTAAGAATATGGGGGGCTTCGGTTTGATGGA‑AAAATATCCCTCGGGTT‑TTTTCTCTATCTGCCTTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGtttt < 1:997241/150‑1 (MQ=255) ctctACATGTGTTCAGCATAGGGGGGGCCGGGGGTTGATGAA‑AAAATCCCCCGGGGGTT‑TTTTCTCTATCTCCCGTCCATTAAATGCCGGAGACAAACACCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGttt < 2:212481/149‑1 (MQ=255) ctACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATc > 2:1145716/1‑151 (MQ=255) tacttttcttCAGTATATGGGTGGCTGGGGTTTGATGGT‑AAATTACCCCTGGGGTC‑TTTTCTCTACCTGCCTTTCACTAAATCCGTGAGACAGCCCCCCTCAGGCTCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGtttt < 2:209402/139‑1 (MQ=255) aCATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCg > 2:59005/1‑150 (MQ=255) ttttCAGAATATGGGGGGCCTGGGGTTGATGAA‑AAAATACCCCTCGGGTT‑TTTTCTCTTTCTCCCTTTCAGCTAATCCCTGAGACAGACACCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTAt < 2:1151368/141‑1 (MQ=255) tgtCCAGCATATGGGGGCCCTGGGTTTGATGGA‑AAAATATCCCTCGGGTT‑TTTTCTCTTTCTGCCGTTCAGCTAATGCCGGAGACAGACACCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATc < 1:525069/144‑1 (MQ=255) tttCAGCATATGGGGGCCCTCGGTTTGTTGAA‑AAAATATCCCTCGGGTT‑TTTTCTCTATCTCCCGTTCACTTAATCCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTa < 1:815101/149‑1 (MQ=255) agaatatGGGGGGCCTGGGTTTGATGAA‑AAAATATCCCTGGGGGT‑TTTTCTCTACCTCCCGTCCAGTAAATGCCTGAGACAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATcc < 2:1058620/147‑1 (MQ=255) agaatatAGGGGGCCTCGGGTTGAGGAA‑AAAATACCACCGGGTTC‑TTTTCTTTATCTCCCGTTCAGCTAATGCCGGAAACAGACAGCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCt < 1:494426/148‑1 (MQ=255) ataGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGa > 2:734984/1‑148 (MQ=255) gggggggCCTGGGTTTGGTGAT‑AAAATCCCCCGGGGGTC‑TTTTCTCTACCGCCCTTTCATTAAATGCTGGAGAAAGCCCGCCTCAACCTCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAAt < 2:922577/137‑1 (MQ=255) gggggCCTGGGTTTGATGTA‑AAAATATCCCTGGGGCT‑TTTTCTTTACCCGCCTTTCATCAAATCCCTGAGACAAACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATc < 2:891362/138‑1 (MQ=255) ggaggCCTGGGGTTGATGGA‑AAAATATCTCGGGGTTT‑TTTTCTCTCTCCGCCGTTCATCTAATCCCTAAGACAGACACCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGc < 2:1035684/151‑1 (MQ=255) aggCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCt > 2:1182451/1‑151 (MQ=255) ggCCTCGTTTGGATGAA‑AAAATATCCCGGGGGTT‑TTTTCTTTATCTCCCTTTCATCTATTGCGTGAAACAGCCCCCCAAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTc < 1:1199199/151‑1 (MQ=255) ggtttgttgtaaaaaTACCAC‑CGGGGCTTTTTCTCTCTCCGCCGTTAAATTATCCCCTGAGACAGACCCCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCt < 2:84750/133‑1 (MQ=255) ttgaggaaaaaaTATCCCGGGGGTT‑TTTTCTCTTTCTCCCGTTCAGCTAATGCCTGAGAAAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttttt < 2:790354/142‑1 (MQ=255) t‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGt > 2:343857/1‑150 (MQ=255) aaaaTATCACTCGGGTT‑TTTTCTCTATCTGCCTTCAAGCTAATGCCTGAGAAAGACACCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTa < 1:111723/150‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTa > 1:376380/1‑150 (MQ=255) aaaTCTCACTGGGGTT‑TTTTCTCTACCTGCCTTTCAGCAAATCCCTGAGACAGACCCCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAt < 2:537786/151‑1 (MQ=255) aaaTATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAt > 2:685452/1‑151 (MQ=255) atatCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAttt > 1:139253/1‑151 (MQ=255) cGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATg > 2:114751/1‑150 (MQ=255) ggggT‑TTTTCTCTTTCTGCCGTTCAGCTAATGCCTAAGACAGACACCCAAAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAt < 2:896154/151‑1 (MQ=255) ggggT‑TTTTCTCTTTCTCCCTTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAAt < 1:74701/148‑1 (MQ=255) ggC‑TTTTCTCGATCTTCCTTTCAGCTAATGCCAAAGACAGCCACCCAAAAGCCACCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAttt < 2:217729/151‑1 (MQ=255) gC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAttt > 1:988576/1‑150 (MQ=255) ttttCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAat > 2:595496/1‑151 (MQ=255) tttCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAatt > 2:761639/1‑151 (MQ=255) ttCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAatt > 1:718289/1‑150 (MQ=255) ctctATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAattatt > 1:160288/1‑151 (MQ=255) ctctATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAattatt > 1:39168/1‑151 (MQ=255) ctctATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAattatt > 2:87484/1‑151 (MQ=255) aTCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAAc > 2:169719/1‑151 (MQ=255) cTGCCTTTCACCTAATGCCGAAGACAGCCACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTa < 1:104822/147‑1 (MQ=255) cctttCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACttt < 2:319432/146‑1 (MQ=255) ccGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAAc < 1:587594/146‑1 (MQ=255) ttCGGCTAAGGCCTGAGACAGACGTCCTCAGGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAAt < 1:485257/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTa < 2:583641/147‑1 (MQ=255) atcTAATGCCTGAGACAGACAGCCAAAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTaa < 1:68954/143‑1 (MQ=255) cTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTT‑‑TTATTTAACTTTAATTTATCTCtt > 2:118085/1‑151 (MQ=255) aaTGCCGGAGACAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTAt < 1:290900/146‑1 (MQ=255) gCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCAGCTATTCTATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCAt > 2:12195/1‑151 (MQ=255) ccTGAGACAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTc < 1:859225/148‑1 (MQ=255) cTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCGGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCg > 2:774380/1‑151 (MQ=255) tgaaaaagacacCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCAt < 2:546843/142‑1 (MQ=255) | ATGCTGCTTCATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGT‑AAAATATCACTCGGGGC‑TTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCG > NC_000913/16892‑17179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |