| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 213,341 | 0 | A | G | 46.7% | 96.0 / 28.6 | 76 | G337G (GGA→GGG) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/32); new base G (34/1); total (43/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGCCG > NC_000913/213191‑213491 | aGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑a < 1:400418/151‑1 (MQ=255) gCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAg > 1:1082938/1‑149 (MQ=255) gCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAg > 1:433080/1‑149 (MQ=255) gCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAgtg < 1:663366/151‑1 (MQ=255) cTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAggg > 1:42158/1‑147 (MQ=255) cccTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTAC‑a > 2:283076/1‑149 (MQ=255) ccTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCt < 2:1057676/151‑1 (MQ=255) aCGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGGGTAC‑AGCTTAATGCg > 2:426547/1‑151 (MQ=255) cGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGTGGAC‑AGCTTAATGCgg > 1:494875/1‑151 (MQ=255) gggCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTAC‑AGCTTAAAGTgggggg > 1:634255/1‑150 (MQ=255) gggCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAgg < 1:671462/150‑1 (MQ=255) gggCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGc < 1:1045327/151‑1 (MQ=255) ggCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCg < 2:365123/151‑1 (MQ=255) cgcgTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGat < 1:472468/151‑1 (MQ=255) gcgTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTAC‑AGCTTAATACgggggg > 1:233924/1‑146 (MQ=255) ttGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTc < 1:380343/150‑1 (MQ=255) gAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGc < 1:1077301/150‑1 (MQ=255) aaTCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAC‑AGCCTTATGCGGGAGGGGGAATTCcccc > 1:591633/1‑150 (MQ=255) aaTCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTTGccc > 2:1127554/1‑150 (MQ=255) aTCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTGC‑AACTTAATTAGGGGGGGGAGATTTTCCCTc > 1:332422/1‑151 (MQ=255) cGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCcgc < 2:269675/151‑1 (MQ=255) aCGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGCGGG‑GAGGGGAG‑AGCTTTATTCGGGGGGGGATATTCGcccccc > 1:167519/1‑147 (MQ=255) cGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTg < 1:862776/151‑1 (MQ=255) cTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGGGTAA‑AGCTTAATGCGGGGGGCGATATTCGcccccccc > 2:919545/1‑144 (MQ=255) tATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAC‑AGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTCTcccccc > 1:279878/1‑143 (MQ=255) aTCAGTCGCAGCTGTGGTGGATTAAGTCCGTCACCGGGCAGAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAGCCGCTGGAATTGCCAGCGGGGCTGGG‑GAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAg < 1:328053/150‑1 (MQ=255) aTCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAg < 2:346404/150‑1 (MQ=255) cAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGAc < 2:636192/150‑1 (MQ=255) aGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGGGGG‑GAGCGGAC‑AGGATAATGGGGGAGGCGGAATTTGGCCCCcgcgggga > 2:46687/1‑142 (MQ=255) aGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGTGTAC‑AGCCTAATGCGGGGGGCGATATTCGCCCCCCCCCTGCAg > 1:345711/1‑147 (MQ=255) gTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGaa < 1:658022/151‑1 (MQ=255) gCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGAGGG‑GACTGTTC‑AAATTTATGAGGGAAGGGAGATTCACCCTCcgcccgccaacggaacg > 2:679816/1‑137 (MQ=255) gCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCg < 1:1117502/151‑1 (MQ=255) aaCTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCCCGCGCCGACGAAGCgg > 2:945157/1‑150 (MQ=255) aCTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCGGGG‑GAGAGTAC‑AACCTAAATCGGGGGGCGATATTCGCCCTCCCCGTGCAGACCAAGCgg > 1:844961/1‑149 (MQ=255) gtggtgGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCa < 1:452685/149‑1 (MQ=255) gtggtgGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCa < 1:882646/149‑1 (MQ=255) tggtggATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTAA‑AGCTTAATGCGGGGGGGGATATTTGCCCCCCGCGGGCCGACGAAGGGGGCAgcg > 2:480508/1‑151 (MQ=255) gtggATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAC‑AGCTTAATGCGGGGGGGGGTATTCGCCCCCCCCGGGCAGACGAAACGGGCAgcggg > 2:1016909/1‑149 (MQ=255) tAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGGAC‑AGCTTAATTCGGGGGGCGATATTCCCCCTCCCCCCGCCGACGCAACGGTCAgcgtgcggt > 2:580657/1‑147 (MQ=255) aaTCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAA‑AGCTTAATGCGGGGGGGGGTATTCGCCCTCCGCGCGCAGAACAAGCGGGCAgcgtgcggt > 1:211482/1‑145 (MQ=255) ccGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAg < 2:805060/150‑1 (MQ=255) cGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAgcg < 2:93602/151‑1 (MQ=255) gTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGGGGAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGGTATTTGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGGCAGCGGGCGTTTTaaa > 2:705415/1‑147 (MQ=255) cACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGTACAACCTTAATG‑GGGGGGGGATATTCGCCCCCCCCGCGGCGACGGAGCGGGCAGAGTGCGGTTTAAAGCGcc > 1:711830/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTTAAGCGGGGGGGGGTATTCGCCCTCCCCGTGCAGACGGAGCGGGCAgcggggctttttaaacg > 2:283686/1‑133 (MQ=255) ccGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAgg < 1:1026610/151‑1 (MQ=255) ggCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGAtt < 1:921455/151‑1 (MQ=255) cGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCa < 1:789381/150‑1 (MQ=255) gAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAA‑AACTTAAAGCGGGAGGGGGTATTCGCCCCCCCCGTGGAGACGAAGGCGGGAGCGTGCGGTTTAAAGCGCCAGGagt > 1:66388/1‑141 (MQ=255) gAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑GAGGGTAC‑AGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTTGCCCTCCCCGTGCCGACGGAGGGGGCAGCGTGCGTTTTAAAGCGCCAGGGGTGCTGCat > 1:157169/1‑150 (MQ=255) gAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCata < 2:557653/151‑1 (MQ=255) aaaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGTGTAC‑AGCTTAAATCGGGGGGGGGAATTTCCCCCCCCCGTGCCGACCGAAAGGGCAGCGCGGGGTTCAAAAGGCCAGGGTTGCTGCcta > 1:1112162/1‑150 (MQ=255) aaaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCatat < 1:694041/151‑1 (MQ=255) aaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCCGGG‑GAGTGGAC‑AGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTTGCCCCCCCCGGGGCGGCGAAGCGGGCAGCGGGCGGTTTAAAACGCCAGGATTGCTGCCTAtt > 1:475022/1‑151 (MQ=255) aaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTg < 1:345157/151‑1 (MQ=255) aCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGt < 2:244811/151‑1 (MQ=255) gtgCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGTGGG‑GAGGGGAA‑AGCTTAATGCGGGGGGGGAGATTTGCCCCCCCCGGGCAGACGAAACGGGCAGCGGGGGGTTTAAAACGCCCGGAGTTCTGGCTATTGt > 1:763130/1‑146 (MQ=255) 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ccGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAag < 2:211486/151‑1 (MQ=255) gggCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTgg < 1:283072/151‑1 (MQ=255) gggCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTgg < 1:76701/151‑1 (MQ=255) gggCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTgg > 2:962428/1‑151 (MQ=255) gggCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAAAGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTgg > 1:908034/1‑151 (MQ=255) ggCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTggg > 1:916295/1‑151 (MQ=255) tGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCg > 2:825534/1‑150 (MQ=255) ggg‑CAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGCAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATTTGGCAAGAGCTGGGCg > 1:1052616/1‑149 (MQ=255) g‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTgcc > 1:445748/1‑151 (MQ=255) aaGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTgccg < 1:980052/151‑1 (MQ=255) | AGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGCTGGG‑AAGTGTAC‑AGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGCGGTCAGCGTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGCCG > NC_000913/213191‑213491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |