Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,725,207 | IS1 (+) +9 bp | coding (532‑540/1299 nt) | kgtP ← | alpha‑ketoglutarate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2725215 | 0 (0.000) | 93 (1.230) | 78/298 | 0.0 | 100% | coding (532/1299 nt) | kgtP | alpha‑ketoglutarate transporter |
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GCGCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2725066‑2725215 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG > NC_000913/3583428‑3583577 gctCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGG > 1:614551/4‑151 GCGCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGG > 2:52819/1‑151 CGCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGG < 1:684478/151‑1 TTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGA > 2:571492/1‑150 CTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCT > 2:140865/1‑151 TTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGCATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCC > 2:534707/1‑150 TTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCC < 1:1096239/150‑1 CGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACT > 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1:20577/1‑151 TGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 2:1147040/1‑151 GACGACGTAACCACAACTCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:258883/1‑151 GACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:461572/151‑1 GTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:383977/151‑1 AACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:105446/1‑151 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GTGTTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC < 1:75969/150‑1 TTGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG < 1:86928/149‑1 TGTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > 1:812899/1‑151 GTAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG < 2:763557/151‑1 TAAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 1:25089/1‑150 AAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > 2:20241/1‑151 AAAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGA < 2:710555/150‑1 AAACCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACA < 2:733296/151‑1 CCACGACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC > 1:24061/1‑150 GACAACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGC < 1:106964/151‑1 AACCAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTAT > 1:951051/1‑151 CAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT < 1:519663/150‑1 AGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < 1:421783/151‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG < 2:1010896/151‑1 GCGCGTTTCTTGTTGCGAAGTTTCATCTAACTGACGACGTAACCACAACGCCACAACAGCTAACACAGCTCCTAACGCGAAAGGAATACGCCATCCCCACTCTCTGAGTGCAGCGTCTTCCATGGTGTGTTGTAAAACCACGACAACCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2725066‑2725215 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG > NC_000913/3583428‑3583577 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |