| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,486 | 0 | C | A | 42.4% | 104.6 / 39.1 | 66 | intergenic (+291/‑165) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/7); new base A (0/28); total (31/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATT > NC_000913/29336‑29636 | tttttGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCcac > 1:691998/1‑151 (MQ=255) ttttGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATACATGAGCcac > 2:1097439/1‑150 (MQ=255) tttGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCcaca > 2:489553/1‑150 (MQ=255) tttGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCcaca < 2:764824/150‑1 (MQ=255) gttgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACaaaa < 1:1151185/150‑1 (MQ=255) gttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAaataat < 2:1055462/151‑1 (MQ=255) gttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAaataa < 2:199074/150‑1 (MQ=255) tAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAt > 1:1148947/1‑151 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATcc > 1:581386/1‑151 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATccc > 2:571550/1‑151 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATccc < 1:965662/151‑1 (MQ=255) tttGCCCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGTTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGc > 2:652624/1‑151 (MQ=255) tttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCg < 2:636459/150‑1 (MQ=255) tttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCg < 1:340673/150‑1 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AAAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCa < 1:906716/150‑1 (MQ=255) ccACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtt > 1:986141/1‑151 (MQ=255) ttttttCTGCTTTTTTTTTTTTTATCAATTCTTCTGGTTGC‑CAAGGTTTTTCC‑AAAACCAGTTGAGATAATTTTTTTGTCGATAATCT‑CCTTAAAACCATGAATGGCCCAAAAAAAAAAAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 2:1103138/150‑1 (MQ=255) ttttttCTGCTCTTTTTTTTTTCATGAATTCTTTTTGCTGCGCAAGCTTTTTCA‑AGAA‑CAGTTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATC‑CTTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtttt < 1:1021265/149‑1 (MQ=255) tttttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAg > 1:182066/1‑150 (MQ=255) tttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcgc > 2:592811/1‑151 (MQ=255) tcctgtttttttttTAATGAATTTTTTTTGCGGC‑CAAGGCTTTTCCAAAAA‑CAGGTAAGATAATTTTTTTGTCATTTAATG‑CCTTAAAAACAGGAATGACCAAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGcc < 1:166833/142‑1 (MQ=255) tctctTTTTTATTTCATGAATTCTTTTTGCTGCGAAATCTTTTTCA‑AGAA‑CAGGTAAGATATTTTTTTTGCCG‑TTAACGCCCTAAAAAACATGGAGGAACCAAAAAAAAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCa < 2:898339/148‑1 (MQ=255) gCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCCCATTTAATTTAATTTTTAgcgc > 1:674052/1‑146 (MQ=255) ttttttttATTCCATTCAATTTTTTTGTGGCCAAAGCGTTTCCA‑AGAA‑AGGGTTAGATTATCTTTTTGTCGTTTAATG‑CTTAAAAACCGTTCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 1:909026/145‑1 (MQ=255) ttttttttTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCC‑AAAA‑AAGTTTAGATATTTTTTTTGTCGCTAAATC‑CCTAAAAAACATGCAGGACCAAAAAAATAAAATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtct < 2:189001/149‑1 (MQ=255) ttttttttTCATCAATTCTTCTTGCTCCGCAAGCTTTTTCA‑AAAA‑CGGTTTAAATAATTTTTTTTTCCCTAATGG‑CCTTAAAAACTTGCTGGACCAAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 2:29971/145‑1 (MQ=255) tATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa > 1:526330/1‑150 (MQ=255) tATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa > 2:773456/1‑150 (MQ=255) aTTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt > 1:568424/1‑151 (MQ=255) tttaaggaactcttctTGCTGCGAAGGCTTTTCCA‑AAAA‑CGGGTTAGATGTTCTTTTTGCCGTTTAATG‑CCTTAAAAACATGCAGGAGCCAAAAAATAAAATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt < 1:468624/140‑1 (MQ=255) ttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgc > 1:244290/1‑151 (MQ=255) ttCATGAATTCTTCTTGCTGCGAAAGCTTTTTCA‑AGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATG‑CCTGAAAAACATGCAGGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATg < 1:82680/150‑1 (MQ=255) tCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgcc > 2:383969/1‑151 (MQ=255) gCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGccgccg > 2:919733/1‑151 (MQ=255) cAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGt > 1:327031/1‑151 (MQ=255) aTCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGttt > 2:774230/1‑151 (MQ=255) cttGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 2:1021286/1‑149 (MQ=255) ttGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 2:208477/1‑148 (MQ=255) tgctgcGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGa > 2:546163/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCTTTTTCC‑AAAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATG‑CCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCa < 1:926865/144‑1 (MQ=255) cgcAGGCTTTTCCA‑AAAA‑CAGTTTAGATGATTTTTTTTTCGTTTAATC‑CTTGAAAAACATGAATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGaaa < 2:1109972/147‑1 (MQ=255) cgcAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg > 2:16160/1‑151 (MQ=255) cgcAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg > 1:191931/1‑151 (MQ=255) aggttttttCA‑AAAA‑AAGTTTAGATTTTTTTTTTTTGTCTTAATC‑CCTAAAAAACTTGAATGCCCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt < 2:150482/141‑1 (MQ=255) aaGCTTTTTCC‑AAAA‑CAGTTTAAATATTTTTTTTGTCTTTTAATC‑CCTGAAAAACATGCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg < 2:1118011/151‑1 (MQ=255) ttttCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCgg < 1:386262/147‑1 (MQ=255) aaaaaggtttAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATC‑CCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAt < 2:666767/142‑1 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg > 2:835730/1‑150 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg > 1:606010/1‑150 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg > 1:968820/1‑150 (MQ=255) tgttttttttGTCGTTTAATG‑CCTGAAAAACATGAATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTa < 1:713716/145‑1 (MQ=255) tCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 1:741915/1‑151 (MQ=255) ttttttGTCGCTTAATG‑CCTAAAAAACATGCATAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc < 2:901292/149‑1 (MQ=255) ttttttTCGTTTAATC‑CCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTAc < 2:448157/146‑1 (MQ=255) tttttGTCGTTTAATG‑CTTGAAAACCATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc < 1:839315/149‑1 (MQ=255) ttGTCGCTTAATC‑CTTAAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatca < 1:951150/150‑1 (MQ=255) ctattAATG‑CCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtg < 2:1165087/146‑1 (MQ=255) cgttaaaTC‑CCTGAAAAACATGAAGGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTcatcat < 2:534115/142‑1 (MQ=255) gCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg > 2:1013537/1‑150 (MQ=255) cTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGa > 1:951033/1‑150 (MQ=255) ttAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAAt > 2:1038008/1‑151 (MQ=255) g‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAat > 2:805382/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:62809/149‑1 (MQ=255) tgaaaaaCATGCATGACCAAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAat < 2:538022/144‑1 (MQ=255) gTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGc > 1:1033745/1‑150 (MQ=255) aaaaCTTGCATACCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaaa < 1:42665/151‑1 (MQ=255) aaaCATGCATGAGCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAAt < 1:279622/151‑1 (MQ=255) atgACCCAAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 1:1029972/151‑1 (MQ=255) aGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagtg > 2:626089/1‑150 (MQ=255) ccAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGaa < 1:909766/150‑1 (MQ=255) acaAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAatat > 1:441038/1‑151 (MQ=255) caAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGCATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATAtt > 1:268928/1‑151 (MQ=255) | TTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCC‑AGAA‑CAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATG‑CCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATT > NC_000913/29336‑29636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |