Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 366,526 | 0 | T | G | 40.9% | 122.5 / 16.6 | 66 | T329P (ACC→CCC) | lacI | lactose‑inducible lac operon transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/31); new base G (27/0); total (35/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGC > NC_000913/366377‑366675 | aaaGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGggt < 1:11807/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGggtgg < 1:33855/151‑1 (MQ=255) tGGGGGGCCTAATCAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGCCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGATTACGGATTGGGCGGCCGggtggactt > 2:589573/1‑146 (MQ=255) ggggTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGGTTGGGGATTTGGGGGCAGGGGGGgtttt > 2:337500/1‑150 (MQ=255) ggTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGGATTTGGGGCCCGGGGGGGttttctt > 1:64089/1‑151 (MQ=255) gCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTttttctttt < 1:136540/150‑1 (MQ=255) gCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTttttctttt < 2:108053/150‑1 (MQ=255) ccTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCa < 1:661375/151‑1 (MQ=255) gagtgagCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTTGGGGCCCGGGGGGGTTTTTTTTTTACCAGTg > 2:44868/1‑151 (MQ=255) agtgagCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTga < 1:379147/151‑1 (MQ=255) cTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTTTTGGGCGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTCACCAGGgagaacgg > 1:370149/1‑147 (MQ=255) aaCTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑ggg < 2:596550/149‑1 (MQ=255) aaCTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCa < 2:222616/151‑1 (MQ=255) aCTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGGATTTGGGGCCCGGGGGGGTTTTTTTTTTACCACGGAGAC‑ggg > 1:380143/1‑148 (MQ=255) tCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGGGGGTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCaa > 1:727533/1‑149 (MQ=255) aTTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTg < 1:560547/151‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTg < 2:223717/151‑1 (MQ=255) ttgcgttgcgCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGGGCCAGGGGGGGTTTTTTTTTCACCAGGGAGAC‑GGGCAACAGCTGAtt > 1:445653/1‑149 (MQ=255) tgcgttgcgCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGGGTGTTGGGGGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTTACCAGTGTGAC‑GGGGAACAAGTGATTGc > 1:643991/1‑150 (MQ=255) gcgttgcgCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGccc < 2:734352/151‑1 (MQ=255) cgcTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCAcc < 2:418555/151‑1 (MQ=255) gcTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGCTTGTGTGTTTGGCGCCGGGGGGGGGTTTCTTTTTTCCAGTGAGAC‑GGGGAACAGCTGCTTGGCCTTTAc > 2:320267/1‑149 (MQ=255) gcTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGC‑GGGAGAGGCGGGTTTCGGGTTTGGGGGCCGGGGGGGGTTTTTTTTTC‑CCCGGGAGACGGGGCACAACCTGATTGCCCTTccc > 2:332767/1‑147 (MQ=255) cTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTTGGGGCCAGGGGGGGTTTTTTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGGCCTTCCCCGc > 1:739985/1‑151 (MQ=255) tCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGCGCCAGGGGGGTTTTTTTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACcccc > 1:778913/1‑151 (MQ=255) cACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCt < 1:95768/151‑1 (MQ=255) cTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTGGGATTTGGCGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTTACCCGTGAGAC‑GGGCGAAAGCGGATTTCCCCTTCCCGCCt > 1:604106/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTTGGCGCCAGGGGGGTTTTTTTTTTTACCAGGGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCCTCACCGcc > 2:230354/1‑148 (MQ=255) gCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGGTTGCGGATTTGGCGCCCGGGGGGGTTTTTTTTTTACCCGCGAGAC‑GGGGAACAGCCGATTGCCCtttcccccc > 2:379472/1‑139 (MQ=255) gCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTga < 1:346172/151‑1 (MQ=255) ttCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTgaga < 2:958806/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTgaga < 2:330798/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGGGGTTTTTCTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCCCCCGGccccggg > 1:809335/1‑145 (MQ=255) cAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGCGCCCGGGGGGTTTTTTTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGagagag > 1:428259/1‑150 (MQ=255) gTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGtt < 2:397537/150‑1 (MQ=255) gTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGGTTGCGTATTGGGCGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTTACCCAGGAGAC‑GGGCAACAACCGCTTGCCCTTCACCCCCCGGCCCCGAGAGAGtt > 2:565478/1‑150 (MQ=255) tCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGGGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAACTGATTGCCCTTCACCCCCCGGCCCCgaga > 2:974243/1‑144 (MQ=255) gggAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGCGCCAGGGGGGGTTTTTTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTgc > 1:700227/1‑149 (MQ=255) gAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTgcagca < 2:633049/151‑1 (MQ=255) aCCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGc < 1:141449/151‑1 (MQ=255) gTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTTGGCGCCAGGGGGGGTTTTCTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGCAAAAGCTGATTGCCCCTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCAc > 1:662794/1‑151 (MQ=255) gCCGGCTGCATTAATGAAGCGGCCAGCGCCCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCTAGGTTTGTTTTTCTTTTCACCATTGAGAC‑GGGCAACAGCTGAGTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGGGAGAGTTGCAGCGAGCGTTCCACg < 2:887977/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCt < 1:67150/151‑1 (MQ=255) cAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTTGGCGCCAGGGGGGTTTTTTTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCCCCCGGCCCTGAGAGAGGTGCAGCAAGCGGGCCAc > 1:547296/1‑147 (MQ=255) cAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTg < 1:900719/151‑1 (MQ=255) cAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTg < 1:776535/151‑1 (MQ=255) aGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGCGCCAGGGGGGGTTTTCTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGGGAGAGTTGCAGCAAGCGGGCCACGCTgg > 2:98693/1‑151 (MQ=255) gCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGCGCCCGGGGGGGTTTTTTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGGAACAGCTGATTTTCCCTCCCAGCCTGGCCCCGGGAGAGGTGCAGCAAGCGGGCCCCGCCGGttt > 1:754468/1‑150 (MQ=255) gCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTGCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCGTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGt < 2:136353/148‑1 (MQ=255) ttAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTTGGGGCCCGGGGGGGTTTTTTTTTTACCAGTGAGAC‑GGGGAAAAGCTGATTGCCCTTCACCGCCCGGCCCTGAGAGAGGTGCAGCAAACGGGCCCCGCTGGTTTGccc > 1:230010/1‑151 (MQ=255) gAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTGGGCGCCAGGGGGGTTTTTCTTTTTACCCGGGAGAC‑GGGCAACAACTGATTGCCCTTCACCCCCCGGCCCCGGGAGAGGTGCAGCAAACGGGGCACGCCGGGTTTccccc > 2:1000358/1‑147 (MQ=255) gAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCcagc < 1:575421/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTTCGTATTGGGCGCCCGGGGGGGTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGGTTGCCCccgc > 1:304956/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCCGGGTGGTTTTTCTTTTCACCCGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCCCCGCCTGGCCCTGAGAGAGGTGCAGCAAGCGGGCCACGCCGGTTTGCCCCCGCAGGCGaaaa > 2:250561/1‑150 (MQ=255) ggTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATggtggt < 2:695777/150‑1 (MQ=255) tGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAcg > 2:767861/1‑151 (MQ=255) tGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAcg > 1:856772/1‑151 (MQ=255) tGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAcg > 1:477359/1‑151 (MQ=255) tGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAc < 2:162868/150‑1 (MQ=255) tGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAc < 1:938580/150‑1 (MQ=255) gCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAcgg > 1:23746/1‑151 (MQ=255) tATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAAcggcgg > 1:127990/1‑151 (MQ=255) gggCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCggggt > 2:402221/1‑148 (MQ=255) gggCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGat < 2:210990/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGatat < 2:328863/151‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACa < 2:790834/151‑1 (MQ=255) cAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATaa > 2:298366/1‑148 (MQ=255) cAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACAt < 2:380137/151‑1 (MQ=255) aGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATg < 2:445645/151‑1 (MQ=255) ggtcgtTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACa > 1:1721/1‑147 (MQ=255) tggtTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAAAATGAGc > 2:842896/1‑150 (MQ=255) | AAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGC‑GGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGAC‑GGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGC > NC_000913/366377‑366675 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |