| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 987,494 | 0 | T | G | 44.9% | 102.6 / 25.2 | 70 | intergenic (‑512/+91) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/34); new base G (31/0); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.47e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTTGCAC > NC_000913/987346‑987644 | tcttTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGtt < 2:139051/150‑1 (MQ=255) tttCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGt > 1:9124/1‑147 (MQ=255) tCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCaa < 1:1055097/150‑1 (MQ=255) cAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCaaa < 1:763953/150‑1 (MQ=255) gACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAg < 2:294644/151‑1 (MQ=255) aTCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGAtt < 2:162060/151‑1 (MQ=255) ccAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTg < 2:226688/150‑1 (MQ=255) cAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAGATTGCt > 2:441527/1‑151 (MQ=255) aGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGaaaaaaaatgttt > 1:463205/1‑141 (MQ=255) aGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGGAATAAATTACtt > 1:525157/1‑151 (MQ=255) gAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTg < 1:1026491/151‑1 (MQ=255) aTGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGGAATAAATTGCTTgt > 2:977735/1‑149 (MQ=255) ccAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTa < 1:949708/151‑1 (MQ=255) aaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTaacaaac < 1:367296/151‑1 (MQ=255) aTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTaacaaaca < 1:436709/151‑1 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATa < 2:6796/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACtt < 1:715377/151‑1 (MQ=255) aaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTg < 1:616333/151‑1 (MQ=255) gCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGaaa < 1:864674/151‑1 (MQ=255) tATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGCAAAAAGAATGGTTT‑ATTTTAAAAAAAAAAAACATGCCAGa > 1:646029/1‑147 (MQ=255) ttAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGGAAATAGATTTTTTT‑TCTTTACAAAACAAAAAATTTACAGAAAAGa > 1:944125/1‑150 (MQ=255) gCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAAATTGGTTT‑ATTTTACAAAAAAAAAAATTGACAGaaaaaaaaa > 2:207778/1‑145 (MQ=255) cTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaa < 2:716919/150‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa < 1:163141/151‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa < 2:962698/151‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGAGTCTTGAAGAAAATGGTTT‑ACTTTACAAAAAGAAAAATAGACCaaaaaaaaaaaaaa > 1:707701/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAAATTGATTT‑AGTTAACAAAAAAATAAATTTACAGAAAAGATaaaaaa > 2:329945/1‑148 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCa < 1:480607/151‑1 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAAATTTGTTT‑ACTTTAAAAAAAAAAAAATTTACAGaaaaaaaaaaaaaaaa > 1:522612/1‑145 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGGGCAAATAAAATTTTTT‑TCTTTAAAAAAAAATAAAATTACAGaaaaaaaaaaaaaaaa > 1:725436/1‑145 (MQ=255) ccGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGgc < 1:235253/150‑1 (MQ=255) gCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGCGGTGTAAATAGATTGGTTG‑TACTAAAAAAAAGATAAATTCGGAGGAAAAATAAAAAAAAAG‑CCAGCggg > 2:566857/1‑147 (MQ=255) tAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAGATTGGTTG‑ACTTTACAAAAAGATAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACCAGggggggggg > 2:726083/1‑144 (MQ=255) aaGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGCAAAAAAATTGTTTG‑GCTTTACAAAAAAAAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAACGGGGGCCgg > 2:918658/1‑148 (MQ=255) aGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGGGTAAAAAAAATTCTTG‑TATTTAAAAAAAAAAAAATTTAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑ACAGCggggggcgg > 1:379277/1‑141 (MQ=255) gAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAAATTGCTTG‑ACTTTACAAAAAAAAAAATTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAGCGGGCGCCGGGTCtt > 2:152817/1‑151 (MQ=255) gCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAg < 2:32202/151‑1 (MQ=255) ggATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGTAAAAAAAATGTTTT‑TATTAAAAAAAAAAAAAAATTTAAGAAAAGAAAAAAAAAAAA‑ACAGCGGGCGCTGGCCCtt > 1:375455/1‑145 (MQ=255) aTTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGc < 2:693124/151‑1 (MQ=255) ttAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAAATTTTTTG‑ACTTAACAAAAAGAAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAGCGGGGGGTGGGTCtt > 2:1104265/1‑142 (MQ=255) aGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGTAAAAAGATTTTTTT‑TCTTTAAAAAAAAAAAAAATGACAAAAAAAATAAAAAAAAAA‑ACAACGGGGGCCGGCGCGTTAAGACGcca > 2:61508/1‑148 (MQ=255) tttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGCAAATAAAATTCTTT‑GCTTTAAAAAAAGATAAAATTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAACGGGGGCTGGgtccttgagacagcaaa > 2:65201/1‑136 (MQ=255) tttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAAtt < 1:730430/150‑1 (MQ=255) tttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAAtt < 1:927817/150‑1 (MQ=255) tttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGGGGTAAAAAATTTGTTG‑AATTTAAAAAAAAATAAAATTAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑ACACCGGGGGCGGGGTCTTGAAGAGGcccaa > 1:905147/1‑144 (MQ=255) ttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAAATTGCTTT‑GCTTAAAAAAAAAAAAAATTGACAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAGCGGGGGCTGGCTCTTGAAAAAGGTAAATTa > 2:1056723/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGCTGGAAAAAGAATATTTT‑GCTTAAAAAAAAAAAAAATTTAACGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑GCAGCGGGCGCCGGGGCTTTAAGAAGCCAAAATa > 1:992321/1‑150 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGa < 2:673575/150‑1 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGa < 2:1092586/150‑1 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGGAAATGATTGTTTG‑TTTTATCAAAAAAAAAAATTTTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑ACAACGGGGGCCGGGTCTTTAAGAAGCTAAAATAGa > 2:840110/1‑150 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAAAATGTTTT‑AGTTAACAAAAAAAAAAAATTAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACGGGCGGCGGGTCTTGAAGAAGCCaaaaaaaa > 1:84252/1‑145 (MQ=255) gcgcGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGGTATGACGGGGTTGCAAATAGAATGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGa < 1:450726/150‑1 (MQ=255) cgcgTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGTAAAAAGAATTCTTG‑ACTTAACAAAAAAATAACTTTTCAGAAAAAATAAAAAAAAAG‑CCAGCGGGGGCTGGCTCTTTTAGAAGCTaaa > 2:417743/1‑144 (MQ=255) cgTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTTGAAATAAAATGCTTGAATTTAAAAAAAAAAAAAATTG‑GAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAGCGGGCGGCGGCCCCTGAAAAAGCGAAATTaaaaac > 2:888311/1‑148 (MQ=255) tAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGTAAATAAATTGCTTG‑GCTTTACAAACAGAAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCACCGGGCGCCGGGTCTTGGAGACGCCCAATTAGaa > 2:653427/1‑146 (MQ=255) tAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAATAAATTTCTTT‑ACTTTACAAAAAAAAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑ACAACGGGCGCTGGGTCTTTTAAAAGCTAAATTaaaa > 2:1332/1‑146 (MQ=255) aaaTGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGc < 1:251059/151‑1 (MQ=255) gTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTa < 2:756677/151‑1 (MQ=255) tGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTAc < 2:45383/150‑1 (MQ=255) tGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGCAAAAAGATTTCTTG‑AATTAACAAAAAAAAAAACTTACAGAAAAAATAAAAAAAAAG‑GCCACGGGCGCTGGCCCTTGTAGACGCCAAAATAAAAAATGGCGGTTcgcg > 2:764826/1‑148 (MQ=255) gTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAAAATTCTTG‑TATTAAAAAAAAAATAAATTTGCAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑CCAGCGGGGGCCGGGTCTTTGAGACGCCAAAATAAAAAATGGCGGTAcg > 1:357989/1‑145 (MQ=255) tAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGAAAAAAATTTCTTT‑TCTTTACAAAAAAAAAAATTTTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑ACAGCGGGGGCCGGGGCTTTTAGACGCTAAAATAAAAACTGGCGGTAAGCgg > 2:904853/1‑147 (MQ=255) atTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGt < 1:21714/150‑1 (MQ=255) 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aTGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCacgtac < 1:441518/151‑1 (MQ=255) cGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGttt > 1:428225/1‑151 (MQ=255) ggTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTTGc < 2:1097943/151‑1 (MQ=255) gTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTTGc > 2:848958/1‑150 (MQ=255) ttGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTTGCAc > 1:697601/1‑151 (MQ=255) | TCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTG‑ACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAG‑CCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTTGCAC > NC_000913/987346‑987644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |