Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 41.9% | 96.9 / 35.1 | 62 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/3); new base A (0/26); total (33/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.74e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGGG > NC_000913/29347‑29646 | ttAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAatat > 1:1025867/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATaa > 2:724582/1‑150 (MQ=255) tGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAGAATAATATaaaa > 1:986554/1‑150 (MQ=255) gTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATaaaaa < 2:334908/150‑1 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTCTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATccc > 1:377416/1‑151 (MQ=255) ttttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCg > 1:700119/1‑151 (MQ=255) ttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc > 1:887756/1‑151 (MQ=255) tGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc < 2:993493/150‑1 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGtt > 1:782770/1‑151 (MQ=255) tCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACt > 2:49643/1‑151 (MQ=255) ccttttttttCTGCTCTTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAACCTTTTCCAAAAAAAGTTTAAATAATTTTTTTGCCCTTAAATCCCTAAAAAAAATGAAGGAC‑CAAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGa < 2:178401/144‑1 (MQ=255) ccATTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGAAAAACATGAATGAG‑CCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACt < 1:56369/150‑1 (MQ=255) ttttttTGCTCTTTTTTATTTAATAAATTCTTTTTGCTGCGCAAGCTTTTCCAAAAACAGTTTAAATAATTTTTTTGTCTTTTAATGCCTAAAAAACATGCATGAG‑CCAAAAAATAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAg < 2:238249/150‑1 (MQ=255) tttttCTGCTTTTTTTTTTTTAATGCAATTTTTTTGCTGCGCAAGCGTTTCCAAGAACAGGTTAAATTATTTTTTTTTCGTTAATTGCCTGAAAAACATGAATGAC‑CCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAg < 2:608052/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGcc > 2:985746/1‑151 (MQ=255) tCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc > 2:565538/1‑151 (MQ=255) cTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCatat > 2:365987/1‑151 (MQ=255) cGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtct > 1:596854/1‑151 (MQ=255) cGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtct > 2:877124/1‑151 (MQ=255) gTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtctc > 2:671397/1‑151 (MQ=255) tttttATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 2:500409/1‑151 (MQ=255) tttttATCTCATGCAATCTTTTAGCTGCAAAAGGTTTTTCAAAAACAGGTGAGATAATTTTTTGGTCGCTATGTGCATAAAAACTATGCAGGAC‑CCAAAAAAAAATAAAAAAATGCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtctc < 1:1073195/150‑1 (MQ=255) tttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATg > 1:660706/1‑151 (MQ=255) tttCATGAATTCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCCAAAACAGTTTAGATTTTTTTTTTGTCCTTTATTCCCTAAAAAACATGCATGAA‑CCAAAAAATAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGaa < 2:528006/149‑1 (MQ=255) cATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccg > 2:845652/1‑151 (MQ=255) aaTCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGtt > 1:59393/1‑151 (MQ=255) tttttGCGGCGAAGGCTTTTCCCAAAACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGCTAAAGCCCTGAAAAACATGCATGAC‑CCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc < 1:448968/147‑1 (MQ=255) ttcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 2:43979/1‑151 (MQ=255) ttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 2:311700/1‑148 (MQ=255) ctgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAt > 2:137020/1‑151 (MQ=255) tgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt > 1:1058087/1‑151 (MQ=255) gcgcAAGCGTTTCCCAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGAAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc < 1:817856/151‑1 (MQ=255) cgcAAGCTTTTTCAAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTTAAAAACATGCATGAC‑CCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt < 2:602723/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTTCCAAAAACAGTTTAGATGTTCTTTTTGTCTCTTAATCCTTGTAAACCATGCTTGAC‑CCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt < 2:812684/146‑1 (MQ=255) aaGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg > 2:406479/1‑151 (MQ=255) aaGCGTTTTCAAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTAAATGCCTGAAAAACATGCATGAC‑CCAAAAAAAAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGa < 1:839297/142‑1 (MQ=255) tttCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 2:731112/1‑151 (MQ=255) tgcccAGAAAGGGTTATATAATTTTTTTTTCGTTAAACTCTTGAAAACCATCTAGAAC‑CCAAAAAATAATAAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAg < 1:216652/147‑1 (MQ=255) aaaaCAGTTTAGATGATTTTTTTGTCTCTTAATGCCTAAAAAACATGCATGAC‑CCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAt < 1:594014/148‑1 (MQ=255) aGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAtt > 1:603253/1‑151 (MQ=255) aaCAGTTTAGATTTTTTTTTTGTCGTTTAATGCTTAAAAAACATGCATGAC‑CAAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAttt < 1:186869/150‑1 (MQ=255) ctgtttAGTTGTTTTTTTTGTCTCTTAACGCCTAAAAAACATGCA‑GAGACCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGa < 2:668843/141‑1 (MQ=255) ttAAATGTTTTTTTTTTCGTTTAATGCCTAAAAAACATGCATGAC‑CCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAt < 2:335914/148‑1 (MQ=255) atCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGt > 1:100973/1‑151 (MQ=255) tttttttGTCGTTTAATGCCTAAAAAACATGCATGCC‑CCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt < 2:1078219/139‑1 (MQ=255) tCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 2:811992/1‑151 (MQ=255) tttGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGTATGAC‑CCCCAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatc < 1:351730/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt > 2:142490/1‑151 (MQ=255) gTCGCTTAATGCCTGTAAACCATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGAGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAACTTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTcatcat > 2:555470/1‑149 (MQ=255) gTCGCTTAATGCCTAAAAACCATAAACAAC‑CCAAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt < 2:570680/150‑1 (MQ=255) cGCTTAATGCCTGAAAAACATGCATGAC‑CCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgt < 1:433528/150‑1 (MQ=255) ctaaaaaaCATGAATGAG‑CCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat < 1:28108/146‑1 (MQ=255) cTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg > 1:921685/1‑151 (MQ=255) cTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg > 1:266744/1‑151 (MQ=255) aaaaCATGCATGAG‑CCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaaa < 2:86267/151‑1 (MQ=255) aaaaCATGCATGAC‑CCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTaa < 1:223824/143‑1 (MQ=255) aaaaCATGCATGAC‑CCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaaa < 2:754699/151‑1 (MQ=255) accaaaaaaaaaATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagt < 2:161283/143‑1 (MQ=255) aaaaaaaaATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat < 2:616078/147‑1 (MQ=255) aataatATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtctc > 1:652234/1‑151 (MQ=255) aataatATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtctc > 2:192329/1‑151 (MQ=255) aataTAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg > 1:32613/1‑151 (MQ=255) aataAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTg < 1:419721/150‑1 (MQ=255) tataAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg > 2:590036/1‑149 (MQ=255) taAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAggg > 1:740346/1‑151 (MQ=255) | TTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAG‑CCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGGG > NC_000913/29347‑29646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |