| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,536,197 | 0 | A | T | 42.9% | 74.8 / 55.4 | 63 | intergenic (+166/+417) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/32); new base T (27/0); total (31/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCC > NC_000913/4536047‑4536346 | cATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTa < 2:257530/151‑1 (MQ=255) tGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑GTTTTTgg > 1:573552/1‑151 (MQ=255) tACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGaa < 2:733819/150‑1 (MQ=255) gtagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATg‑aaagaa < 1:19535/151‑1 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑CTTTTTGGGATg‑aaaaaa > 1:632929/1‑150 (MQ=255) aaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATg < 1:347465/150‑1 (MQ=255) gggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GGTTTTTGGATG‑AAAAAAAAAgca > 2:456415/1‑149 (MQ=255) tatTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑GTTTTTTGAATG‑AAAAAAAAAggaagcaa > 1:271700/1‑149 (MQ=255) tatTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGGAAG‑AAAAAAAAAgaaagaaa > 2:502746/1‑149 (MQ=255) ttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGA‑G‑GACTTTGGGATG‑GAAGGAAAAgcaaagaaaaaaa > 2:58682/1‑141 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAataatata < 2:1073593/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑CTTTTTTGGATG‑AAAAAAAAAACAAACAaaaatataa > 2:247422/1‑148 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTGGGATG‑AAAGAAAAAGAAAACAAAAAAAtaaaaa > 1:569235/1‑150 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGA‑G‑TTTTTTGGAATA‑GAAAAAAAAACAAGAAAAAAAAtaataa > 2:814723/1‑148 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTTTGAATG‑AAAAAAAAAACAAGCAAaaaaataaaaatagg > 2:344139/1‑146 (MQ=255) aGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTa < 2:1041797/151‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAAtt < 1:559066/151‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAAtt < 1:1047368/151‑1 (MQ=255) ttttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑GTTTTTTGAATT‑AAAGAAAAAACAAGCAATAAAATAATAATAGTCTTATtttttt > 2:339184/1‑146 (MQ=255) gCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTaa < 2:550977/151‑1 (MQ=255) gCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTaa < 1:759129/151‑1 (MQ=255) gCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 1:141225/150‑1 (MQ=255) aGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCa < 1:534596/151‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCatat < 1:889910/151‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCatat < 1:703275/151‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCata < 2:280427/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCata < 2:299366/150‑1 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTGGGATGAAAAAAAAAAGCAACCAA‑AAAATAATAAAAGCCTAATTTTTTTTTACATCATTaaa > 1:980101/1‑142 (MQ=255) ttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatc < 1:375733/150‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatca < 1:371026/150‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTGGAATG‑AAAAAAAAAGCAAGCAAAAAAAAAATAAATGGCTAATTTCTTTTTAcatcaattaaaa > 2:407075/1‑135 (MQ=255) ttATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGGATG‑AAAAAAAAAGACAACAATAAAATAATAAAAGGCTTATTTTTTTTTACATCATTAAACATATCATCATCGTCt > 2:1016762/1‑150 (MQ=255) tataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTa < 2:949435/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAttt < 1:22399/150‑1 (MQ=255) aaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGc < 1:773185/151‑1 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTTTGTATT‑TAAAAAAAAACAAACAAAAATAAAATAAATGGCTAATTTTTTTTTAAAAAATTAAAAATATCATCAACATCTttttt > 2:360162/1‑147 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGcc < 2:158404/147‑1 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGa < 2:873834/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGAATT‑AAAAAAAAAGCAAACAAAAAAATAATAAATGGCTTATTTTTTTTAAAATAATTTAAAATAACAACATCGTCTttttttcaaa > 2:620858/1‑144 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGG‑TTTTTAGGAA‑A‑AAAGGAAAAGTAAGAACTAATAAAATAAATGAGTCATTTTTTTTAACATCATTAAAAAAAACATCATCGTCTTTTTTTCAGAAt > 1:712949/1‑151 (MQ=255) ttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GTCTTTTAGAGTTA‑AAAGAAAAGATAGCCAATAA‑ATAAAAAAAGGCTTATTTTTTTTAATAACATTTAACAAATCATTATAGGCTATTTTTCAGatacc > 2:989509/1‑144 (MQ=255) tACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTTTGAATG‑GAAGAAAAAAGAAAGAATAATATAATAATGGCCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAACATATAATCATAGTCTATTTTCCCGAATCCGt > 2:932188/1‑149 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTTTGAATG‑AAAAAAAAAACAAGCAAAAAAATAAAAAAAGACTAATTTTTTTTAACAACATTAAACAAATCATCATCCTCTATTTTTCAGAATCCGCCGAc > 1:785132/1‑150 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGGATG‑AAAAAAAAAGCAAACAAAAAAATAAAAAAAGGCCCATTTTTTTTTACATCATTAAACAAATCAACATCCTCTATTTTCCCGaaaac > 1:81221/1‑141 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGAATG‑AAAGAAAAAACCAACAAAAATATAATAATAGCCTTATTTTTTTTAACAACATTTAACATATTATCATCCTCTTTTTTCCACAAAACCTCGAc > 1:475624/1‑150 (MQ=255) tAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTTGGGATG‑AAAGAAAAAGCAAGAAAAAAAATAATAATTGGCCAATTTTTTTTTACATCATTAAAAATATAAACATTCTCTATTTTCCACGAACCGTCGACtt > 1:78909/1‑151 (MQ=255) aaTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACt < 1:266381/149‑1 (MQ=255) aTTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGGATG‑AAAAAAAAAGCAAGCAAAAATATAAAAAAAGGCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAACATATTATTCTCGTCTTTTTTTCAGAAACCCCCGCCTTATaa > 1:350044/1‑150 (MQ=255) tCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGc < 2:895589/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑CGTTTTGGGATG‑GAAAAAAAAGCGAGCAATAATATAATAAAAGTCTAATTTTTTTTTACAACATTAAAAAAATCATCATGGTCTTTTTTTCTGAATCCGGGGACTtat > 1:267556/1‑143 (MQ=255) tttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGGATG‑AAAGAAAAAGGAAGCAAAAAAATAATAAAAGGCTAATTTTTTTTAAAAACATTAAACATATCCTCATCGTATATTTTTCAGAATCCGGCGACtt > 1:903851/1‑139 (MQ=255) tGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGaa < 1:293682/150‑1 (MQ=255) tGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGaa < 1:1006434/150‑1 (MQ=255) cATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAAc < 2:193189/149‑1 (MQ=255) aTAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTTGAAAG‑AAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAATAAAAAAGGCCCCATTTTTTTTAAAATAATTAAACAAATACACATTCTCTTTTTTTTAGAATACCTCGGCTTTTAATTACCACAACgg > 1:210636/1‑150 (MQ=255) aTAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTGGAATG‑AAAGAAAAAACAAGCAAAAATAAAAAAATGGGCCAATTTTTTTTAACAACATTAAACATATAATCATCGTCTATTTTTCAGAAACCGTCGACTTATAATTCCCACAACgg > 1:1018143/1‑150 (MQ=255) tAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑G‑GTTTTTGGGAAG‑AAAGAAAAAGCAAGCAAAAATATAAAAATAGCCTCATTTTTTTTAAAATCATTTAAAATATCATTAAAGTCTTTTTTCCAGAAATCGTCGAATTATAATCTCCAGaa > 1:502985/1‑146 (MQ=255) gggATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACg < 1:909258/151‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGtgct < 1:1078126/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGtgct < 2:206771/150‑1 (MQ=255) cGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAAc < 1:787409/151‑1 (MQ=255) t‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtg > 2:619158/1‑151 (MQ=255) g‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgt > 2:148057/1‑151 (MQ=255) tttAGGAATT‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgtg < 2:966054/149‑1 (MQ=255) aGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGccc > 1:121294/1‑150 (MQ=255) | CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑G‑CTTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCC > NC_000913/4536047‑4536346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |