| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 43.5% | 111.8 / 12.4 | 62 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/4); new base C (0/27); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.25e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376356‑1376655 | gtttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACATGTCGCCGCGCGTACCGGAT‑A‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAacac < 1:282733/149‑1 (MQ=255) cTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACAcc > 1:552235/1‑151 (MQ=255) ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACAccc > 2:816017/1‑151 (MQ=255) tACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCt > 1:453431/1‑151 (MQ=255) tACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCt > 1:446461/1‑151 (MQ=255) ccgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCg < 1:929970/151‑1 (MQ=255) cgccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGc < 2:382406/151‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccg < 1:323576/151‑1 (MQ=255) tCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCccgcc > 2:957034/1‑151 (MQ=255) cgcgTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGtt > 2:1109170/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtc > 1:3333/1‑151 (MQ=255) ccTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtc > 1:810612/1‑151 (MQ=255) ggCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACg > 2:1048165/1‑151 (MQ=255) ccGCAAAAGTGGTTAGAGTTCCCCGGCTCCTACGGTAAACGGCCGCCGCGCGT‑CCGGAA‑CGCTTGT‑TGTATC‑CCAACCCTTAAA‑CCGTCTACGAGGCAAATATGCAATCCCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATc < 1:581595/150‑1 (MQ=255) ccGAAAAA‑TGGTGAGTGTTCCCCGGCGCGTACGGGAACAGTTCCCCGCGCGTACCGAAC‑C‑CGTGG‑TGTATCTCAACCCTTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCt < 2:883595/150‑1 (MQ=255) cGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt > 2:293826/1‑150 (MQ=255) aaaa‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 1:768043/1‑151 (MQ=255) aaaa‑GGGTGAGTGTTCCCCTGCGCGTACGGAAACGGGTCGCCGCGCGTCCCGGAC‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCG‑TTATCAGGATCATATGATCAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTaa < 2:494454/149‑1 (MQ=255) aaa‑GGGGGAGTGATCCCCGGCGCGTACTGAACCGGGTCCCCGCGCGTACCGGAA‑C‑GGGGG‑TGTATCTCGACCCGTAAAC‑CCG‑CTATCAGGATAATATGATCAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACa < 2:1067830/151‑1 (MQ=255) gtgaTTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 2:1012051/1‑147 (MQ=255) tccccTGCGCGTACTGGAACGGGTCGCCGCGCGTCCGGGAC‑C‑CGGGG‑TGTATCTCGACCCTTAAAC‑CCG‑CTACAAGGATCAAATAATAAACCCCCTCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTAt < 2:840604/148‑1 (MQ=255) cccgccgcgTACGGGACCGGGCCCCCGCGCGTACCGGAC‑C‑GGGGG‑TTTACCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑TTATCAGGACAAAATGATAACCCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc < 1:145853/144‑1 (MQ=255) ccTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGc > 2:354114/1‑151 (MQ=255) gcgcGTACTAAAACGGGCCCCCGCGCGCCCCGAAA‑C‑GGGGG‑TTTATCCCAACCTGTTAAC‑CCT‑CTAACGGGATAAAATACACAACCCCCTCGGCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTAt < 1:116017/144‑1 (MQ=255) gTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCt > 1:249019/1‑151 (MQ=255) tacggaaagaGGCCGCCGCGCGT‑CCCGAA‑C‑CGGGGTTTTATCTAGAACCTTTAAC‑CCC‑TTACAGGGATAAAATAATCAACCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAtt < 1:15691/138‑1 (MQ=255) ggacaaGGTCCCGGCGCGTACGGAAC‑C‑CGGGT‑TTTATTACGAACCTTAAAA‑CCC‑TTATCAGAATAAAATATTCACCCCCCGCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGa < 2:106141/136‑1 (MQ=255) accgggccgccgcGCGT‑CCGGAA‑C‑CGGGGTTTTATCTCGACCCTTAAAC‑CCG‑CTACAAGAATAAAATGATAAACCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACAt < 1:336094/144‑1 (MQ=255) acgggTCGCCGCGCG‑ACCGGAACC‑CGGGG‑TGTA‑CCCCAACCCTTAAACCCG‑TTATCAGAATAATATAAAAAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATca < 1:259881/144‑1 (MQ=255) ggTCCCCGCGGGTACGGGAA‑C‑GGGGG‑TGTATCTCGACCCGTTAAC‑CCG‑CTACAAGAATCATATGAACAACCCCCTCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcaca < 1:35613/146‑1 (MQ=255) gccgcGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg > 1:200251/1‑151 (MQ=255) gccgcGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCg > 2:1040992/1‑151 (MQ=255) ccgcGGGTCCCGAAC‑C‑GGTGG‑TTTTTCCCAACCTGTAAAA‑CCG‑CTATAGGGATAATATAATCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCga < 1:406997/151‑1 (MQ=255) ccgcGCGTCCCGGAC‑C‑CGTGG‑TTTATCTCGACCCTTAAAC‑CCG‑CTATCAGGATCATATGACCACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATc < 2:90448/149‑1 (MQ=255) gcgTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:39326/1‑150 (MQ=255) cgTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:219000/1‑149 (MQ=255) cgTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:565268/1‑149 (MQ=255) aCCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGAt > 2:418623/1‑150 (MQ=255) gAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCt > 1:1019727/1‑151 (MQ=255) acc‑cGTGG‑TGTCTCTCGACCCGTTAAC‑CCG‑CTATCAGAATCATATGACCACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATa < 2:1073713/144‑1 (MQ=255) gtgg‑ttTATCTCGACCCTTTAAC‑CCG‑CAAAAAGGATAATATTATAACCCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg < 2:108698/148‑1 (MQ=255) gtgg‑tgTATCCCGAACCGTAAAC‑CCG‑CTATCAGGATCATATAACAAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcg < 2:1019809/150‑1 (MQ=255) gg‑tgTATCTCGACCCGTAAAC‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATAAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAg < 2:458652/151‑1 (MQ=255) ggtttacccagaCCCTTAAACCCG‑CTATCAGGATAATTTGAACACCCCCCTCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgc < 2:977726/136‑1 (MQ=255) tATCTC‑AACCCTTAAACCCG‑CTATAAGAATCATATAATAAACCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgc < 2:21516/149‑1 (MQ=255) cccaaaCCGTTAAC‑CCG‑CTATCAGGATAATATGATAACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTg < 2:623568/146‑1 (MQ=255) aaCCGTAAAC‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATAACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCAt < 2:442079/149‑1 (MQ=255) ccGTAAAC‑CCG‑TTATCAGGATAATATGACCAACCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACa < 2:15110/151‑1 (MQ=255) tAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAActg > 1:669903/1‑149 (MQ=255) ccG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAc > 1:1050509/1‑151 (MQ=255) ccG‑CTATCAGAATAAAAGAATAACCCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgcg < 1:560523/149‑1 (MQ=255) g‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCt > 2:410898/1‑151 (MQ=255) cTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTg > 2:1089737/1‑151 (MQ=255) aTCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCt > 2:1044512/1‑151 (MQ=255) aTCAGGATAATATGAACACCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTg < 2:329945/149‑1 (MQ=255) ggacaatataaaaaaCCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt < 1:1090332/138‑1 (MQ=255) ggATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGt > 1:827976/1‑151 (MQ=255) tCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCAt > 1:1132444/1‑151 (MQ=255) tataaccAACCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTc < 2:453459/140‑1 (MQ=255) atGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGc > 1:719503/1‑151 (MQ=255) atGACCACCCCCCCCGCCAATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCg < 2:1018537/142‑1 (MQ=255) tGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGc > 1:1062395/1‑150 (MQ=255) tCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCatat > 1:844966/1‑151 (MQ=255) acacCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGc > 2:142369/1‑151 (MQ=255) acCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCgg > 2:65516/1‑151 (MQ=255) | GCTTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAA‑TGGTGAGTGATTCCCTGCGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAA‑C‑CGTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCG‑CTATCAGGATCATATGATCAACACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376356‑1376655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |