Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,435 | 0 | C | T | 43.9% | 67.7 / 39.8 | 66 | intergenic (‑179/‑28) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/35); new base T (29/0); total (31/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-16 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT > NC_000913/3206285‑3206581 | cAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTc < 1:37903/151‑1 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACaa < 2:508040/150‑1 (MQ=255) gCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc < 1:466183/151‑1 (MQ=255) cAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACa < 2:813914/151‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACaa < 1:187187/151‑1 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAaaaaaaaa > 1:937224/1‑150 (MQ=255) gCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAcaaaaacaaaaaatt > 2:44146/1‑146 (MQ=255) gCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAaaaaaaaaaaaa > 1:28024/1‑146 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑CTGGAg > 1:88697/1‑149 (MQ=255) tCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑AAGGAGTTg > 2:346676/1‑150 (MQ=255) cccTGCTCTGGCACAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGc < 2:1130735/150‑1 (MQ=255) cTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAAAAAAATAAAAAAA‑AAGGAGGTGcc > 2:943441/1‑149 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑ATGGAGtttgc > 2:1013243/1‑142 (MQ=255) ctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCatgat < 1:895127/149‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCg < 1:253081/151‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCg < 2:1106810/151‑1 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTCCATAAAAATAAAAAAA‑CTGGAGTTGTCATGATGAACg > 2:123357/1‑150 (MQ=255) cAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCCGACAAATAAAAAAA‑CTGGAGTTGGCctgat > 2:386497/1‑143 (MQ=255) aaTATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAg < 1:1075413/151‑1 (MQ=255) cattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCTGAAAAAAAAAAAAA‑AAGGAGTTGTCCTGATGAGGGGAAGtaa > 1:57429/1‑148 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGGTTCCATGTTGAGCGGAAGGAATAaacaac > 2:923362/1‑150 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCaa < 1:645857/149‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAAc < 2:1016669/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCa < 2:692912/150‑1 (MQ=255) cgcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAg < 2:1013012/150‑1 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTg < 1:1031997/151‑1 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAA‑ATGGAGGTGGCATGATGAGGGGAAGTAATAAACAAAAAGCAgg > 1:725072/1‑147 (MQ=255) cGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGAc < 1:520089/151‑1 (MQ=255) gAACTGTTAATTCAAAATTCACGGTGCAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTg < 2:476545/148‑1 (MQ=255) gAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACa < 1:959308/151‑1 (MQ=255) gAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACa < 1:1068647/151‑1 (MQ=255) aaCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑ATGGAGGTGGCATGATGAGGGGAAGTAATAAACAACAAGCAGTGAAAAAATTGa > 1:283456/1‑148 (MQ=255) aCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑AAGGGGGTGTCATGATGAGGGGAAAAAATAAAAAACAGGCAGGGAATaa > 1:316158/1‑142 (MQ=255) aCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACaga < 1:541648/151‑1 (MQ=255) aCTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACaga < 2:203664/151‑1 (MQ=255) gTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACagag < 2:678726/149‑1 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAA‑AAGGAGGTGCCATGATGAGGGGAAGGAAAAAAAAACAGGGCGTGAAAAAATTGACa > 2:328892/1‑143 (MQ=255) tACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑ATTGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGGAATAAACAAAAAGCAGGGAAAAAATTGACAGAGATTGttg > 2:205681/1‑148 (MQ=255) aCATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAAACAAAAAAAAAA‑AAGGAGTTTGCATGATGGGGGGAAGGAATAAAAAACAAGCAAAGAAAAAAATGACAGAGATTggtg > 1:843022/1‑146 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTTAGACCAAAACAAAAACCTGGGGGT‑CCGTAGGGGGCCAAAGGAATAAAAAACAGGCAGTGAATAAAATGACAGAGAATTTCGCTa > 1:335175/1‑149 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑c < 2:991435/150‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGTTGCCATGATGAGCGGAAGTAATAAACAACAAGGAGTGAATAAAATGACAGAGATTGTCGCTAA‑Cctt > 2:9161/1‑151 (MQ=255) cGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTAcc < 1:686782/151‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑AAGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAAGCCGGGAAAAAGGTGAAAGAGATTGTTGCTAA‑ATTTACCGcc > 2:370727/1‑151 (MQ=255) cAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGTTTCCCTGATGAGCGGAAGGAATAAACAACAAGCAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAA‑ATTTaacccc > 2:698323/1‑143 (MQ=255) cAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGTTGCCATGATGAGGGAAAAGAATAAACAAAAAGGAGGGAAAAAGTTGACAGAGATTGTTGCTAA‑CTTTATCGCCCTg > 1:518760/1‑151 (MQ=255) aaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATg < 1:698274/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑CTTGAGTTGTCATGATGAGCGGAAGAAATAAACAAAAAGCAGGGAATAAGATGTCAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTTCCCCCATGAt > 2:245876/1‑151 (MQ=255) aaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCCGACAAATAAAAAAA‑ATGGAAGTGGCATGATTAACGGAAAAAATAAAAAACAGGCAGAGGAAAAGATTAACGAGATTGTCGCTAA‑ATTTACCCCCATGAtt > 2:529468/1‑151 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGGATTTTTTTCAAACAAA‑AAAAAAA‑AAGGAGGTGGCCTGGTGGGCGAAAGTAATAAAAAAAAAGGCGTGAAAAAATTTACAGAGATTGTTGCTAA‑CTTTTCccccccggtttt > 1:504685/1‑143 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑ATGGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGGAATAAACAAAAAGCAGTGAAAAAATTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTAACCCCATGAttt > 2:250103/1‑150 (MQ=255) ccACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCACACAAAAACAAAAA‑ATGGGGGTGGCATGATGAGCGGAAGGAATAAACAAAAAGCCGGGAATAAGATGAAAAAGATTGTCGCTAA‑CTTTATCCCCATGATTTTTACCCCaa > 2:182121/1‑150 (MQ=255) ccACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTGGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAt < 2:983037/151‑1 (MQ=255) cacaTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGAGAAATTTTTCAAACAAAAACCAAAA‑CTTGAGTTGGCATGATTAGCGAAAGTAATAAACAACAAGCAGTGAATAAAATTTCAAAGATTGTTGGCAA‑CTTTATCGcccctatttttatcc > 1:827580/1‑133 (MQ=255) acaTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGAAATTTTTCAAGACAAATAAAAAAA‑CGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTGGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:391210/148‑1 (MQ=255) ttttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCGAGACAAATACAAAAA‑TTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGCAGCAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGcc < 2:856862/148‑1 (MQ=255) ttttAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtg < 2:211808/150‑1 (MQ=255) tgaGTGTTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTCCCAGACAAATACAAAAT‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgat < 2:267036/148‑1 (MQ=255) aGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCGACCAAAAAAAAAA‑ATGGAGGTGCCCTGGTGGGGGGAAGAAATAAACAAAAAGCAGGGAATAAAATGACAGAGAATGTTGCTAACCTTTACC‑CCCCGATTTTTTCCCCCAAGCCtgat > 1:1023281/1‑148 (MQ=255) gTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAc < 1:873490/150‑1 (MQ=255) ggTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTACAAGACAAATACAAAAC‑CGGGTGTTGCCATAATGAGCAAAAGTAATAAGAAACAGGAAGTGATAAGGTTGACAGAAATTGTCGTTAT‑TTTTGCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:920823/151‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGGGGATTTTTTCAGACCAAAACAAAAA‑CTGGAGTTTCCGTGGTGGGGGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGGGAATAAGTTTAAAGAGATTTTTGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTTTTCCCGGATGCCTGATGAAgtgggg > 1:424659/1‑149 (MQ=255) ggTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTa < 2:120273/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAc < 2:364080/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTGATTAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:495670/148‑1 (MQ=255) tttttCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGc > 2:381412/1‑151 (MQ=255) tttCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCt < 1:241074/150‑1 (MQ=255) | CAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAA‑CTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT > NC_000913/3206285‑3206581 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |