| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 752,861 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑66/+321) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 65 (1.200) | 49/298 | 0.2 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 752861 = | 0 (0.000) | intergenic (‑66/+324) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 689045 | NA (NA) | 67 (1.230) | 62/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 752864 | 0 (0.000) | intergenic (‑69/+321) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTT > NC_000913/752717‑753013 | actggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtagttt > 2:576904‑M2/145‑151 (MQ=255) ggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtagtttttagt < 2:658532‑M2/12‑1 (MQ=255) ggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtagtttttagt < 1:382935‑M2/12‑1 (MQ=255) 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gattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACt < 2:651323‑M2/52‑1 (MQ=255) gCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagcca > 1:490435‑M2/1‑98 (MQ=255) cGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGTGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccata > 1:56683‑M2/1‑97 (MQ=255) ggCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccata > 1:644144‑M2/1‑96 (MQ=255) catttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTg > 1:529392‑M2/90‑150 (MQ=255) 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CTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTT > NC_000913/752717‑753013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |