Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,086,550 | T→C | S179P (TCT→CCT) | fdhD → | formate dehydrogenase formation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,086,550 | 0 | T | C | 98.3% | 220.8 / ‑4.2 | 60 | S179P (TCT→CCT) | fdhD | formate dehydrogenase formation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (27/32); total (27/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
AATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCAAAA > NC_000913/4086403‑4086695 | aaTGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCtt < 1:516476/151‑2 (MQ=255) cATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGa > 1:845213/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTcggc > 1:223734/1‑151 (MQ=255) ccGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTcggcg > 2:831967/1‑151 (MQ=255) cGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTcggcgg < 2:154610/151‑1 (MQ=255) aGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATg > 2:793590/1‑150 (MQ=255) gCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGaa < 1:208678/151‑1 (MQ=255) cGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGa < 2:527843/151‑1 (MQ=255) gCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGAc > 2:688032/1‑151 (MQ=255) tACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTgg < 1:785955/124‑1 (MQ=255) tACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTgg > 2:786011/1‑124 (MQ=255) ccGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTg < 1:271221/150‑1 (MQ=255) ttCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTc > 2:686846/1‑151 (MQ=255) tCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCGCCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCg > 1:698918/1‑151 (MQ=255) aCCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGcc > 1:425702/1‑151 (MQ=255) cccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGcc > 1:238317/1‑150 (MQ=255) cccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCa < 1:466538/151‑1 (MQ=255) cccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCa < 2:253686/151‑1 (MQ=255) ccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCAt < 2:81578/151‑1 (MQ=255) gTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGGGGGGCGCCATGTgg > 1:433729/1‑149 (MQ=255) tGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTg > 1:802022/1‑151 (MQ=255) tctcAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGAc > 2:310672/1‑151 (MQ=255) tcAACACACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGTCa > 2:807070/1‑150 (MQ=255) tcAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACa > 1:278215/1‑150 (MQ=255) aacaaACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAAc < 2:229385/151‑1 (MQ=255) aaCTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGtt > 2:705487/1‑151 (MQ=255) ggATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAgg < 2:278240/150‑1 (MQ=255) ggATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAg < 1:244368/149‑1 (MQ=255) ggATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAg < 2:447127/149‑1 (MQ=255) ggATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGgc < 2:521873/151‑1 (MQ=255) gatgatGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGgcc < 2:684172/151‑1 (MQ=255) aTTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTca < 1:618720/151‑1 (MQ=255) aTTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTca < 2:842701/151‑1 (MQ=255) aCGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTcaca < 1:687989/150‑1 (MQ=255) gTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTcaca > 2:159815/1‑148 (MQ=255) gTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTcaca > 2:318461/1‑148 (MQ=255) cAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAgg < 2:817904/147‑1 (MQ=255) gATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCt < 1:798879/151‑1 (MQ=255) gATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCt < 2:452541/151‑1 (MQ=255) gATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCt < 2:388403/151‑1 (MQ=255) aTTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTg < 1:145404/151‑1 (MQ=255) ttCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgc > 2:427331/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgc < 2:857710/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgca < 1:44901/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgc > 2:49328/1‑149 (MQ=255) cAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgcagc < 2:245576/151‑1 (MQ=255) cAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAgg > 1:226232/1‑151 (MQ=255) tgactgGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTgg > 1:592521/1‑150 (MQ=255) tgactgGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGt > 1:150117/1‑151 (MQ=255) ttGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGCAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAg > 1:744054/1‑150 (MQ=255) tACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGt > 1:745441/1‑151 (MQ=255) cACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGcc > 2:437876/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTAt < 2:511338/151‑1 (MQ=255) gCCTGGATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGaa < 2:850199/150‑1 (MQ=255) ggATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATg < 1:757934/149‑1 (MQ=255) ggATGTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGt < 2:57955/151‑1 (MQ=255) gTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCa > 2:552422/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCa < 2:230118/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCa < 1:49306/150‑1 (MQ=255) gCCACCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCaaaa < 2:292828/150‑1 (MQ=255) | AATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTACTGGTTTCCAGTCGTGCCAGTTATGAAATGGTGCAAAA > NC_000913/4086403‑4086695 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |