Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 944,703 | G→A | G224D (GGT→GAT) | dmsC → | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 944,703 | 0 | G | A | 98.4% | 229.7 / NA | 63 | G224D (GGT→GAT) | dmsC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (29/33); total (29/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGGTGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCG > NC_000913/944558‑944849 | atCGATTGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGTCACTGGTAGTGCGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTTGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATTATgcg > 1:149895/2‑150 (MQ=255) cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCt < 2:585535/150‑1 (MQ=255) cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCt < 1:570610/150‑1 (MQ=255) cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTg > 1:633294/1‑151 (MQ=255) aTGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGAt < 2:184414/151‑1 (MQ=255) gggCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCt < 1:690415/150‑1 (MQ=255) cGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCg > 1:814496/1‑151 (MQ=255) gTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGt > 2:53464/1‑151 (MQ=255) tCTGCTTCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGGGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTg > 1:59305/1‑151 (MQ=255) cAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGc > 1:405925/1‑151 (MQ=255) gCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCg > 1:640224/1‑151 (MQ=255) gCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCg > 2:5075/1‑151 (MQ=255) aaTTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGtt < 1:354017/151‑1 (MQ=255) tttCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTg > 1:225886/1‑150 (MQ=255) tCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGccc > 1:469159/1‑151 (MQ=255) gTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCtgt < 2:117917/151‑1 (MQ=255) gTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTAAGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCt < 2:468095/149‑1 (MQ=255) tGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCtt > 1:508831/1‑151 (MQ=255) gttgtgagtgGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCTACTCTTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGGCTATGGTGCGCTGATGGTCTGGCGGATCTTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGAtt < 1:602952/147‑1 (MQ=255) tAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGc > 2:598026/1‑151 (MQ=255) gagtgGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGcacca < 1:79073/151‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAg < 1:18092/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGc < 2:586244/151‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGc > 1:767775/1‑151 (MQ=255) gtggtgTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaa < 1:125421/151‑1 (MQ=255) ggtgTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaaa > 2:661456/1‑150 (MQ=255) gtgtCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaaa > 2:216054/1‑149 (MQ=255) cAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGtt < 2:802022/150‑1 (MQ=255) gTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATc < 2:315835/151‑1 (MQ=255) tGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGcc > 1:778320/1‑151 (MQ=255) gCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGcc < 1:53442/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCgg > 1:65888/1‑151 (MQ=255) gagCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGc < 2:158534/151‑1 (MQ=255) gCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTa < 1:234938/151‑1 (MQ=255) gACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCt < 2:237247/151‑1 (MQ=255) tATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGt > 1:842329/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattca < 1:210719/151‑1 (MQ=255) aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattc > 1:759258/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattc < 2:56002/150‑1 (MQ=255) gTTCTTTGCAGCAGGACGCAGAGCTGGTGACGGACTATGATGCGCTGGTGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGTCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattcat > 1:791950/1‑151 (MQ=255) gTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattcat < 2:640266/151‑1 (MQ=255) gtgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCt < 2:800683/149‑1 (MQ=255) gtgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTg < 2:225910/150‑1 (MQ=255) tgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAATGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTg < 1:696840/149‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTc < 1:858111/151‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTc < 2:763450/151‑1 (MQ=255) gcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTg < 2:363896/151‑1 (MQ=255) gcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGGTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCt > 1:251288/1‑150 (MQ=255) cagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTgg < 2:778584/151‑1 (MQ=255) cGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAggg < 2:359274/151‑1 (MQ=255) gCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAgggg > 1:58180/1‑151 (MQ=255) tcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGaa > 1:709524/2‑148 (MQ=255) gcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAAtt > 2:58865/1‑150 (MQ=255) gcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTa < 1:30827/151‑1 (MQ=255) ggTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTaa < 2:684895/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAAt < 2:41385/150‑1 (MQ=255) tGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCgg > 2:509018/1‑151 (MQ=255) gCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCgg < 1:210439/150‑1 (MQ=255) ccGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTc > 1:395383/1‑151 (MQ=255) ccGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTc > 1:338441/1‑151 (MQ=255) gACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTcgcg < 2:469376/151‑1 (MQ=255) tATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg > 1:219360/1‑151 (MQ=255) tATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg > 1:712750/1‑151 (MQ=255) atgatgCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg < 2:759315/150‑1 (MQ=255) | GTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGGTGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCG > NC_000913/944558‑944849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |