| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,010,983 | C→T | A340A (GCC→GCT) | uup → | replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,010,983 | 0 | C | T | 97.8% | 159.0 / ‑3.7 | 46 | A340A (GCC→GCT) | uup | replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (20/24); total (20/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
CGTCGCGAACGTGGTGAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCG > NC_000913/1010837‑1011125 | cGTCGCGAACGTGGTGAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAgg > 1:521208/1‑151 (MQ=255) gTCGCGAACGTGGTGAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCGGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGt < 2:68998/151‑1 (MQ=255) gTCGCGAACGTGGTGAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGt > 2:607774/1‑151 (MQ=255) ggtgAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCg < 1:191797/151‑1 (MQ=255) ggtgAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCACAAGTTCTACGTGGCg < 1:856790/151‑1 (MQ=255) cgcgAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAAtt < 2:21486/150‑1 (MQ=255) gATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGAtt < 1:732633/151‑1 (MQ=255) tGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTgg > 2:117707/1‑151 (MQ=255) 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aaTCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGt > 1:727927/1‑151 (MQ=255) cGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAg < 2:403769/151‑1 (MQ=255) tttCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCtt > 2:53476/1‑151 (MQ=255) tttCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCt < 1:442911/150‑1 (MQ=255) tCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTc < 1:119906/150‑1 (MQ=255) cGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCa > 2:194477/1‑150 (MQ=255) aaTGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCg < 1:525452/151‑1 (MQ=255) gAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGAc > 1:334577/1‑150 (MQ=255) tttGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCg > 2:717656/1‑151 (MQ=255) ttGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCg > 1:267296/1‑150 (MQ=255) gCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTAt < 2:695513/151‑1 (MQ=255) cTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTAtt > 2:250356/1‑151 (MQ=255) ccAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCAc < 2:724357/151‑1 (MQ=255) tAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGc > 1:632220/1‑151 (MQ=255) aaCGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCa < 2:599958/151‑1 (MQ=255) 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gAAAGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGc < 1:761200/150‑1 (MQ=255) aaaGATTTTTCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCtt < 2:763537/151‑1 (MQ=255) tttCTGCTCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCg < 2:625673/150‑1 (MQ=255) | CGTCGCGAACGTGGTGAACGTCGCGAAGTGATGGGTACCGCAAAGATGCAGGTGGAAGAGGCCAGCCGCTCCGGTAAAATCGTTTTCGAAATGGAAGACGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCG > NC_000913/1010837‑1011125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |