Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,266,451 | A→G | T120A (ACC→GCC) | prmC → | RF‑1 and RF‑2 N5‑glutamine methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,266,451 | 0 | A | G | 98.2% | 187.0 / ‑4.2 | 57 | T120A (ACC→GCC) | prmC | RF‑1 and RF‑2 N5‑glutamine methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (24/32); total (24/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.76e-01 |
TTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTGCAAAGCGACTG > NC_000913/1266303‑1266596 | tttAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGcc > 1:20195/1‑151 (MQ=255) ccGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGc < 1:110376/151‑1 (MQ=255) ggggTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGTCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCg > 2:791674/1‑150 (MQ=255) gagaATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGAttgcgct > 1:826755/1‑151 (MQ=255) aaTTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGAttgcgcttgc < 1:706227/151‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTgg > 1:769701/1‑151 (MQ=255) tCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATtgcgcttgcgct < 1:8339/146‑1 (MQ=255) cGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCt > 1:727146/1‑149 (MQ=255) cGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCt > 1:678800/1‑149 (MQ=255) cGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTag < 1:256720/151‑1 (MQ=255) cGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTa < 1:647614/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTagcg < 1:800131/150‑1 (MQ=255) gTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAgcgc > 1:600537/1‑151 (MQ=255) gTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAgcgc > 1:555447/1‑151 (MQ=255) aTTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGccc < 2:114934/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACt < 2:622899/151‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTg < 1:683867/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGc < 2:510851/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCg > 2:629012/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCg < 2:618873/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCg > 1:424446/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGaa < 2:600576/151‑1 (MQ=255) ccAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGaaa < 1:440349/151‑1 (MQ=255) aGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAAtt > 2:460703/1‑151 (MQ=255) gACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGCAATTATc > 2:16231/1‑151 (MQ=255) gACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATc > 1:169930/1‑151 (MQ=255) aTTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGt > 2:416231/1‑149 (MQ=255) cccGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATg > 1:169745/1‑151 (MQ=255) cGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGcc > 1:228991/1‑151 (MQ=255) aCGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGAt < 2:540569/150‑1 (MQ=255) aCGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATg < 1:712675/151‑1 (MQ=255) ggAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCt > 2:717342/1‑151 (MQ=255) ggAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCt < 1:770475/151‑1 (MQ=255) cTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCcccc > 2:288664/1‑151 (MQ=255) cTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTccc > 2:500648/1‑151 (MQ=255) ggtggAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTcc < 2:758203/148‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAAc < 1:779222/151‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAAc < 2:706974/151‑1 (MQ=255) ggCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGt < 1:188976/151‑1 (MQ=255) aCTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAAt < 2:121282/151‑1 (MQ=255) ggCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATg < 2:755220/149‑1 (MQ=255) gcgcGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGccc < 2:312517/151‑1 (MQ=255) gcgGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAAt < 1:230860/145‑1 (MQ=255) gTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCAt < 2:555485/151‑1 (MQ=255) tGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCGCGGGACGGGTGCCGGGGTGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATc < 1:142337/150‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGc > 1:134012/1‑151 (MQ=255) acaacCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGAta < 1:151701/151‑2 (MQ=255) acCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCaaa < 2:485281/151‑1 (MQ=255) acCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCGGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCaaa < 1:423408/151‑1 (MQ=255) cTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCaaaa > 2:266055/1‑150 (MQ=255) cGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATcc > 1:323451/1‑151 (MQ=255) tATTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCcac > 2:242888/1‑151 (MQ=255) aTTCTCGATCTCGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCcaca < 1:398250/151‑1 (MQ=255) tctcGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTGCa > 1:719612/1‑150 (MQ=255) cGGGACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTg < 1:242864/145‑1 (MQ=255) gggACGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTGCAAAGCg < 1:201243/151‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTGCAAAGCGACTg < 2:668581/151‑1 (MQ=255) | TTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAAATTATCGCTGTAGATCGTATGCCTGATGCTGTCTCCCTGGCACAACGTAATGCCCAGCATCTGGCGATCAAAAATATCCACATTCTGCAAAGCGACTG > NC_000913/1266303‑1266596 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |